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基于N-酰基甘氨酸保留指数系统的代谢物色谱峰对齐方法
1
作者
郝俊迪
陈耀宇
+4 位作者
王彦真
安娜
白沛蓉
朱泉霏
冯钰锜
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期159-163,I0001-I0006,共11页
色谱峰对齐(peak alignment)是非靶向代谢组学分析中常用的数据处理步骤。色谱峰对齐的目的是整合多批次液相色谱-质谱(LC-MS)分析得到的代谢物数据,从而确保数据的可比性与可靠性。然而,微小的色谱分离条件变化会导致连续分析之间的色...
色谱峰对齐(peak alignment)是非靶向代谢组学分析中常用的数据处理步骤。色谱峰对齐的目的是整合多批次液相色谱-质谱(LC-MS)分析得到的代谢物数据,从而确保数据的可比性与可靠性。然而,微小的色谱分离条件变化会导致连续分析之间的色谱保留时间(retention time,RT)漂移,进而影响色谱峰对齐的准确性。本文提出了一种基于保留指数系统的色谱峰漂移校正策略(retention index-based chromatographic peak-shift correction,RI-based CPSC),应用于代谢物的保留时间漂移校正和色谱峰对齐。为此,我们合成了一系列N-酰基甘氨酸(C2~C23)同系物作为校正物,建立了一套液相色谱保留指数系统。该保留指数系统能够有效修正由流速、洗脱梯度、仪器系统和色谱柱变化所引起的色谱保留时间漂移。利用保留指数系统,我们构建了基于Python的程序(https://github.com/WHU-Fenglab/RI-based-CPSC)来调整原始数据的保留时间,以修正系统的保留时间偏移,随后,应用Joint Aligner算法进行色谱峰对齐。以人粪便样作为测试样,评估了RI-based CPSC策略的色谱峰对齐准确性。以一份时间跨度为157天的长期数据为例,RI-based CPSC策略的应用可以将色谱峰对齐率从15.5%显著提高至80.9%,说明RI-based CPSC策略能够显著提高多批次LC-MS分析的色谱峰对齐准确性。
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关键词
保留指数
色谱峰对齐
保留时间漂移
液相色谱-质谱
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职称材料
FAHFAs:生物功能、分析及合成
2
作者
朱泉霏
郝俊迪
+2 位作者
严靖雯
王雨
冯钰锜
《化学进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期1115-1125,共11页
羟基脂肪酸支链脂肪酸酯(branched fatty acid esters of hydroxy fatty acids,FAHFAs)是一类新发现的生物活性脂质分子。FAHFAs在哺乳动物体内具有重要的生理功能,如改善葡萄糖耐量、增强胰岛素敏感性、维持血糖稳态和抗炎等。目前,FA...
羟基脂肪酸支链脂肪酸酯(branched fatty acid esters of hydroxy fatty acids,FAHFAs)是一类新发现的生物活性脂质分子。FAHFAs在哺乳动物体内具有重要的生理功能,如改善葡萄糖耐量、增强胰岛素敏感性、维持血糖稳态和抗炎等。目前,FAHFA相关研究已成为脂质领域研究的一个新方向,受到科学家们的关注。本文总结了自FAHFAs发现至今的主要研究成果,从FAHFA的生理功能、代谢、生物体内的储存形式、分析检测和化学合成等五个方面进行介绍,以期为未来FAHFAs领域的研究提供一些借鉴。
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关键词
羟基脂肪酸支链脂肪酸酯
生物功能
分析检测
化学合成
原文传递
题名
基于N-酰基甘氨酸保留指数系统的代谢物色谱峰对齐方法
1
作者
郝俊迪
陈耀宇
王彦真
安娜
白沛蓉
朱泉霏
冯钰锜
机构
武汉大学化学与分子科学学院
武汉大学公共卫生学院
武汉大学免疫与代谢前沿科学中心
出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期159-163,I0001-I0006,共11页
基金
国家自然科学基金项目(22274119,21721005)
中央高校基本科研业务费专项资金(2042022kf1030,2042022dx0003)。
文摘
色谱峰对齐(peak alignment)是非靶向代谢组学分析中常用的数据处理步骤。色谱峰对齐的目的是整合多批次液相色谱-质谱(LC-MS)分析得到的代谢物数据,从而确保数据的可比性与可靠性。然而,微小的色谱分离条件变化会导致连续分析之间的色谱保留时间(retention time,RT)漂移,进而影响色谱峰对齐的准确性。本文提出了一种基于保留指数系统的色谱峰漂移校正策略(retention index-based chromatographic peak-shift correction,RI-based CPSC),应用于代谢物的保留时间漂移校正和色谱峰对齐。为此,我们合成了一系列N-酰基甘氨酸(C2~C23)同系物作为校正物,建立了一套液相色谱保留指数系统。该保留指数系统能够有效修正由流速、洗脱梯度、仪器系统和色谱柱变化所引起的色谱保留时间漂移。利用保留指数系统,我们构建了基于Python的程序(https://github.com/WHU-Fenglab/RI-based-CPSC)来调整原始数据的保留时间,以修正系统的保留时间偏移,随后,应用Joint Aligner算法进行色谱峰对齐。以人粪便样作为测试样,评估了RI-based CPSC策略的色谱峰对齐准确性。以一份时间跨度为157天的长期数据为例,RI-based CPSC策略的应用可以将色谱峰对齐率从15.5%显著提高至80.9%,说明RI-based CPSC策略能够显著提高多批次LC-MS分析的色谱峰对齐准确性。
关键词
保留指数
色谱峰对齐
保留时间漂移
液相色谱-质谱
Keywords
retention index(RI)
peak alignment
retention time shift
liquid chromatography-mass spectrometry(LC-MS)
分类号
O658 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
FAHFAs:生物功能、分析及合成
2
作者
朱泉霏
郝俊迪
严靖雯
王雨
冯钰锜
机构
武汉大学化学与分子科学学院
武汉大学免疫与代谢前沿科学中心
出处
《化学进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期1115-1125,共11页
基金
国家自然科学基金项目(No.21635006,31670373,21721005,21904099)
中国博士后科学基金项目(No.2018M642893)资助。
文摘
羟基脂肪酸支链脂肪酸酯(branched fatty acid esters of hydroxy fatty acids,FAHFAs)是一类新发现的生物活性脂质分子。FAHFAs在哺乳动物体内具有重要的生理功能,如改善葡萄糖耐量、增强胰岛素敏感性、维持血糖稳态和抗炎等。目前,FAHFA相关研究已成为脂质领域研究的一个新方向,受到科学家们的关注。本文总结了自FAHFAs发现至今的主要研究成果,从FAHFA的生理功能、代谢、生物体内的储存形式、分析检测和化学合成等五个方面进行介绍,以期为未来FAHFAs领域的研究提供一些借鉴。
关键词
羟基脂肪酸支链脂肪酸酯
生物功能
分析检测
化学合成
Keywords
FAHFAs
biological function
analysis and detection
chemical synthesis
分类号
O623.61 [理学—有机化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于N-酰基甘氨酸保留指数系统的代谢物色谱峰对齐方法
郝俊迪
陈耀宇
王彦真
安娜
白沛蓉
朱泉霏
冯钰锜
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
FAHFAs:生物功能、分析及合成
朱泉霏
郝俊迪
严靖雯
王雨
冯钰锜
《化学进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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