新乡市新型冠状病毒肺炎的流行特征分析

目的了解新乡市新型冠状病毒肺炎(以下简称新冠肺炎)的流行特征,为预防控制新冠肺炎疫情提供相关科学依据。方法收集新乡市卫生健康委员会网站发布的新乡市新型冠状病毒疫情资料,使用Excel 2013建立数据库,采用SPSS 19.0软件进行描述性分析。结果 2020年1月24日新乡市确诊第1例新冠肺炎患者,至2月17日24时,累计报告57例。新乡市本次疫情共有3次高峰,长垣市、辉县市、封丘县、新乡县和卫辉市的病例数只占68%,其中长垣市累计发病率最高,为1.69/10万。男性35例,女性22例,性别比为1.59∶1,20~69岁的患者占85.9%。共报告15起聚集性疫情,占确诊病例的75.4%。结论新乡市新冠肺炎患者以中老年为主并且聚集性疫情多,应密切监测中老年人群,减少人群聚集。

基于不同方法的大肠埃希菌分型效果评价

目的评价并验证成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPRs)、血清学和多位点测序分型(MLST)方法对大肠埃希菌分型的效果。方法使用CRISPRsFinder分析大肠埃希菌全基因组序列的CRISPRs间隔序列,使用在线软件SeroTypeFinder和MLST获得血清型和序列型(ST);采用PCR扩增并分析349株大肠埃希菌CRISPRs,使用CRISPRs间隔序列预测血清型和ST,并比较血清学和MLST分型结果。结果将I-E型CRISPR/Cas、I-F型CRISPR/Cas和CRISPR3-4分别命名CT-Ⅰ、CT-Ⅱ和CT-Ⅲ。根据CRISPRs间隔序列构成和排列进一步进行分型,203株大肠埃希菌被分为79个CT型别,76个血清型和66个ST。CRISPRs分型的区分能力最强,辛普森指数为0.936。CRISPRs和血清学的关联程度最高,调整兰德指数为0.908。CRISPRs型能进一步区分相同血清或ST产志贺毒素的大肠埃希菌[O157∶H7(ST11)、O104∶H4(ST678)和O26∶H11(ST21)]菌株。扩增实验室菌株的CRISPR1、CRISPR2、CRISPR3、CRISPR4和CRISPR3-4,检出率分别为81.1%、94.5%、1.4%、1.4%和4.6%;根据CRISPRs间隔序列预测O157∶H7(ST11)和ST131准确率分别为95.0%和100.0%。结论基于CRISPRs的大肠埃希菌的分子分型方法呈现较好的分型效果和临床应用效果,预期可以成为大肠埃希菌分型的重要分子标志物。