eRNA AP003469.2与肝细胞癌患者预后的相关性分析

目的通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库筛选肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中关键的增强子RNA(enhancer RNA,eRNA),探究其作为HCC预后分子和治疗靶点的潜力。方法从TCGA数据库中检索下载33种癌症类型的基因表达RNA-seq配置文件,应用Kaplan-Meier生存分析和Spearman相关分析筛选与HCC患者生存相关的eRNA和靶基因。评估目的eRNA与临床特征的相关性。进行基因集富集分析以研究目的eRNA潜在的生物学功能。在HCC细胞株Hep 3B中分别构建AP003469.2和靶基因酪氨酸/色氨酸羟化酶激活蛋白ζ(tyrosine and tryptophan hydroxylase activators zeta,YWHAZ)功能缺失细胞模型,定量实时PCR检测AP003469.2敲低后对YWHAZ表达的影响。应用体外增殖实验和transwell实验探究AP003469.2和YWHAZ敲低对细胞增殖和迁移、侵袭能力的影响。在泛癌中验证目的eRNA在其他癌种中的预后潜能。结果在HCC中,AP003469.2和靶基因YWHAZ与患者不良预后相关,且AP003469.2的表达在患者的组织病理学分级、AJCC分期和T分期方面,差异均具有统计学意义(均P<0.05)。基因和通路富集分析结果显示,AP003469.2与参与中性粒细胞脱颗粒、中性粒细胞活化、细胞外基质降解、细胞骨架蛋白重构、细胞伪足和细胞黏附等生物学行为的分子和调控通路相关;进一步分析发现,AP003469.2可能通过中性粒细胞细胞陷阱和细胞伪足调控HCC的发生和发展。定量实时PCR实验证实AP003469.2对靶基因YWHAZ转录的促进作用(P<0.05)。CCK-8和transwell实验表明,AP003469.2和YWHAZ敲低均可抑制HCC细胞株Hep 3B的增殖、迁移和侵袭能力(均P<0.01)。结论AP003469.2可能是HCC中的关键eRNA,有潜力成为HCC早期诊断和预后的标志物和治疗靶点。

手术还是辅助生殖?——卵巢子宫内膜异位囊肿合并不孕治疗中的医学抉择

卵巢子宫内膜异位囊肿(OEM)是妇科常见病,可影响卵巢功能,与患者的不孕症密切相关。针对OEM合并不孕,手术和辅助生殖是最主要的两种治疗手段。由于患者病理类型、临床表现与诉求的差异,优先选择手术还是辅助生殖仍然存有争议。针对该种疾病,目前关于OEM给出的诊治建议仍然存在局限性。本文以临床医生的视角,通过分析OEM造成不孕的可能原因,对比手术和辅助生殖技术在处理此类患者中的影响,结合患者年龄、病理类型、病变累及范围、既往治疗史等情况,提出针对患者个体化治疗环节中需要考虑的各方面因素,探索手术与辅助生殖的时机、适应证及临床中需要注意的问题,以及手术治疗与辅助生殖支持的临床协同等,将其加以分析总结,并提出相应建议,以期为实际临床决策的制定提供帮助。

长链非编码RNA MIR100HG在肿瘤中的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是一类不能编码蛋白质且长度大于200个核苷酸的RNA分子,在肿瘤的发生发展过程中起着重要作用。LncRNA MIR100HG参与调节多种信号通路,从而调控肿瘤细胞增殖、分化、代谢、凋亡和耐药等,MIR100HG在不同肿瘤中的表达不同,既有抑瘤特性,又有致癌特性。本文就MIR100HG在肿瘤发生发展中的调控作用以及其对肿瘤预后影响进行综述,并探讨其在肿瘤诊断、临床治疗和预后中作为靶点的潜在临床应用。

Linc00704对结直肠癌细胞增殖、迁移及侵袭的影响

目的探讨Linc00704(long non-coding RNA 00704)对结直肠癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。方法RT-qPCR检测配对结直肠癌及癌旁正常组织、结直肠癌细胞和正常永生化人结肠上皮细胞系FHC中Linc00704mRNA的表达。反义寡核苷酸(antisense oligonucleotide,ASO)转染结直肠癌细胞构建Linc00704低表达细胞模型,慢病毒感染结直肠癌细胞构建Linc00704过表达细胞模型,RT-qPCR检测转染效率;CCK-8实验检测细胞增殖能力,Transwell实验检测细胞迁移及侵袭能力。结果相比癌旁组织,Linc00704在结直肠癌组织中表达降低(t=4.103,P<0.001)。8种结直肠癌细胞系中有6种细胞系(RKO、HCT15、NCI-H716、SW480、SW1463、SW48)Linc00704的表达较FHC细胞低(F=44.750,P<0.001)。沉默Linc00704表达可促进Caco-2、DLD-1细胞迁移和侵袭能力(均P<0.01),但对增殖无明显影响(均P>0.05)。过表达Linc00704可抑制RKO、HCT15细胞迁移和侵袭能力(均P<0.001),但对增殖无明显影响(均P>0.05)。结论Linc00704在结直肠癌组织中呈低表达,过表达Linc00704可抑制结直肠癌细胞迁移和侵袭能力。

环状RNA与m6A修饰调控恶性肿瘤作用研究进展

N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物RNA中最常见的表观遗传修饰,由甲基转移酶、去甲基化酶和阅读蛋白共同调控实现生物体内动态平衡及甲基化的可逆变化,影响RNA的剪接、加工、定位、转运、翻译和降解等过程,从而调控肿瘤的进展。环状RNA(circRNA)作为一种新型多功能非编码RNA,具有结构稳定、进化保守、高度丰富、组织特异性等特征,同时它可通过充当microRNA(miRNA)分子海绵、结合蛋白质、翻译蛋白和调控基因转录和剪接等方式参与调节多种生理病理活动,有望为肿瘤早期诊断和治疗提供新的分子标志物及潜在药物靶点。大量研究表明,m6A与circRNA可分别调控癌基因表达,且两者之间存在相互调节作用,m6A修饰可调节circRNA生物发生、核输出、降解、翻译和先天免疫,circRNA也可通过miRNA分子海绵或结合m6A修饰酶等机制调控m6A修饰,共同参与肿瘤细胞的增殖、迁移侵袭、干性、耐药性和免疫微环境等过程,这将有助于发现更多肿瘤研究的调节机制和治疗靶点。然而,鉴于m6A修饰和circRNA生物学的复杂性,许多研究仍有待阐明,如m6A检测技术尚不精确、m6A修饰的circRNA数据库仍为空缺、circRNA高效生产方法的开发和递送系统优化仍处于初级阶段等。因此,m6A修饰和circRNA相互作用网络尚需更深入研究。本文综述了circRNA的特征、形成机制及生物学功能,并综合阐述了m6A甲基化修饰基本概念和研究现状,总结分析m6A修饰和circRNA间的相互作用,及其对恶性肿瘤发生发展的影响,对两者临床应用价值和应用前景进行讨论,以期为肿瘤早期诊断、精准诊疗、预后判断与药物研发提供新思路。