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猪ISG 20基因生物信息学分析及其抗PEDV感染的初步研究
1
作者
王梦璐
张志杰
+8 位作者
李之晗
聂晶晶
瞿云芝
张春红
刘志成
沈海燕
张建峰
孙亚妮
李玉谷
《动物医学进展》
北大核心
2024年第10期7-14,共8页
为了研究猪干扰素刺激基因20(interferon-stimulated gene 20,ISG20)的序列信息及其表达情况,并探讨其对猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)增殖的影响,以提取的猪小肠上皮细胞IPEC-J2总RNA为模板扩增猪ISG 20基因...
为了研究猪干扰素刺激基因20(interferon-stimulated gene 20,ISG20)的序列信息及其表达情况,并探讨其对猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)增殖的影响,以提取的猪小肠上皮细胞IPEC-J2总RNA为模板扩增猪ISG 20基因的CDS区序列,并应用生物信息学进行分析,进而构建pcDNA3.1-3×Flag-ISG20重组质粒转染入IPEC-J2细胞鉴定表达情况。此外,在转染重组质粒的细胞中感染PEDV分析ISG20对PEDV增殖的影响。结果表明,猪ISG 20基因CDS区的大小为516 bp,编码171个氨基酸,理论等电点(pI)为8.84;猪ISG20存在2个N-糖基化位点和23个磷酸化位点,主要定位于细胞骨架和细胞质中,以α-螺旋和无规则卷曲构成;构建的pcDNA3.1-3×Flag-ISG20重组质粒能够在IPEC-J2细胞中表达,蛋白大小约为19.6 ku,而且可以明显抑制PEDV的增殖;克隆了猪ISG 20基因,并且在IPEC-J2细胞中重组质粒pcDNA3.1-3×Flag-ISG20能够表达且发挥抑制PEDV增殖的作用,研究结果为深入探讨PEDV与ISG20的相互作用,以及以此为靶点筛选抗PEDV生物制剂提供了思路。
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关键词
干扰素刺激基因20
生物信息学分析
真核表达
猪流行性腹泻病毒
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职称材料
题名
猪ISG 20基因生物信息学分析及其抗PEDV感染的初步研究
1
作者
王梦璐
张志杰
李之晗
聂晶晶
瞿云芝
张春红
刘志成
沈海燕
张建峰
孙亚妮
李玉谷
机构
华南农业大学兽医学院
西北农林科技大学动物医学院
广东省农业科学院动物卫生研究所/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室
岭南现代农业科学与技术广东省实验室茂名分中心
出处
《动物医学进展》
北大核心
2024年第10期7-14,共8页
基金
猪禽种业全国重点实验室项目(2023QZ-NK13,ZQQZ-55)
广东省农业农村厅"十四五"广东省农业科技创新十大主攻方向"揭榜挂帅"项目(2022SDZG02)
+3 种基金
广东省科学技术厅基础研究基金项目(2021A1515011125,2023A1515011681)
广东省科学技术厅畜禽疫病防治研究重点实验室项目(2023B1212060040)
岭南现代农业科学与技术广东省实验室茂名分中心自主科研项目(2022KF010)
国家自然科学基金项目(31302101)。
文摘
为了研究猪干扰素刺激基因20(interferon-stimulated gene 20,ISG20)的序列信息及其表达情况,并探讨其对猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)增殖的影响,以提取的猪小肠上皮细胞IPEC-J2总RNA为模板扩增猪ISG 20基因的CDS区序列,并应用生物信息学进行分析,进而构建pcDNA3.1-3×Flag-ISG20重组质粒转染入IPEC-J2细胞鉴定表达情况。此外,在转染重组质粒的细胞中感染PEDV分析ISG20对PEDV增殖的影响。结果表明,猪ISG 20基因CDS区的大小为516 bp,编码171个氨基酸,理论等电点(pI)为8.84;猪ISG20存在2个N-糖基化位点和23个磷酸化位点,主要定位于细胞骨架和细胞质中,以α-螺旋和无规则卷曲构成;构建的pcDNA3.1-3×Flag-ISG20重组质粒能够在IPEC-J2细胞中表达,蛋白大小约为19.6 ku,而且可以明显抑制PEDV的增殖;克隆了猪ISG 20基因,并且在IPEC-J2细胞中重组质粒pcDNA3.1-3×Flag-ISG20能够表达且发挥抑制PEDV增殖的作用,研究结果为深入探讨PEDV与ISG20的相互作用,以及以此为靶点筛选抗PEDV生物制剂提供了思路。
关键词
干扰素刺激基因20
生物信息学分析
真核表达
猪流行性腹泻病毒
Keywords
ISG20
bioinformatics analysis
eukaryotic expression
Porcine epidemic diarrhea virus
分类号
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
S858.28 [农业科学—临床兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
猪ISG 20基因生物信息学分析及其抗PEDV感染的初步研究
王梦璐
张志杰
李之晗
聂晶晶
瞿云芝
张春红
刘志成
沈海燕
张建峰
孙亚妮
李玉谷
《动物医学进展》
北大核心
2024
0
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