结直肠癌淋巴结转移相关基因标志物的筛选

目的:筛选与结直肠癌淋巴结转移相关的基因或肿瘤标志物的单核苷酸多态性(SNPs)、拷贝数变异(CNVs)并检测其m RNA表达量。方法:从前期收集的1 053个肿瘤相关候选基因中,采用目标区域测序(Illumina Hiseq)捕获25例结直肠病人的癌组织和癌旁组织中与淋巴结转移相关的候选基因的SNPs和CNVs;用荧光定量PCR检测39例结直肠癌病人的癌组织和癌旁组织中6个相关候选基因(VEGFC、CCNA2、IL2、ABCG2、EGF及NFKB1)m RNA表达量的改变。结果:SLC28A3、BRCA1、RRM2、PMS2、CDA、EPHX1、RALY、CD33、BCL10、ETV1、MST1R、KMT2B、BCL2、LSM3、TTF1、MAP3K1基因的SNPs与结直肠癌的淋巴结转移相关,差异具有统计学意义(P均<0.05);DDR1、CYP21A2、SULT1A1、XRCC2、POU5F1、FLT1基因的CNVs在淋巴结转移组和未转移组均未见明显差异(P均>0.05);与无淋巴结转移组相比,EGF和NFKB1基因的m RNA表达量在淋巴结转移组中降低,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:SLC28A3、BRCA1、RRM2、PMS2、CDA、EPHX1、RALY、CD33、BCL10、ETV1、MST1R、KMT2B、BCL2、LSM3、TTF1、MAP3K1基因的SNPs以及EGF、NFKB1基因表达下调可能与结直肠癌淋巴结转移有关,为结直肠癌淋巴结转移的潜在分子标志。本实验未发现候选基因CNVs与结直肠癌病人的淋巴结转移相关。

HCMV感染的标志性蛋白研究进展

人巨细胞病毒(HCMV)感染可导致各种疾病,并常常导致严重的并发症。随着临床实验室技术的发展,检测与HCMV感染相关的特异蛋白生物标志物有利于快速准确诊断HCMV感染并对预后进行观察。本文对最近几年报道的HCMV标志性蛋白进行概述。

人类巨细胞病毒感染的特异性血清蛋白差异表达

目的应用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术结合液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)技术,筛选在人类巨细胞病毒(HCMV)血清差异表达蛋白。方法收集HCMV感染者与正常人的血清各10例,去除高丰度蛋白,iTRAQ试剂标记后采用液相色谱-串联质谱技术鉴定特异性蛋白,并比较蛋白的表达差异。结果共鉴定出362种蛋白质。对比发现有49种血清蛋白的表达差异超过两倍,其中蛋白表达显著上调的有19种,显著下调的有30种;这些差异蛋白中有6种与HCMV感染具有较高的相关性,分别是:脂联素、α-1抗胰蛋白酶、载脂蛋白E、C反应蛋白、结合珠蛋白和血清淀粉样蛋白A1。结论定量的血清蛋白质组学分析,可有效地获得HCMV感染者与正常人的血清蛋白质组差异表达图谱,筛选出与HCMV感染相关的特异性蛋白,为HCMV的早期诊断与治疗提供依据。