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基于t-SNE与UMAP降维的细胞分类及差异化基因筛选研究
被引量:
1
1
作者
李元夫
《应用数学进展》
2022年第10期6951-6958,共8页
单细胞RNA测序技术已经广泛地应用于细胞异质性等关键生物学问题的研究中,与此同时该技术的发展也为基因数据分析提出了很大的挑战。本文基于t-SNE和UMAP两种非线性降维方法,对单细胞RNA数据进行降维、聚类并与线性主成分降维聚类结果...
单细胞RNA测序技术已经广泛地应用于细胞异质性等关键生物学问题的研究中,与此同时该技术的发展也为基因数据分析提出了很大的挑战。本文基于t-SNE和UMAP两种非线性降维方法,对单细胞RNA数据进行降维、聚类并与线性主成分降维聚类结果进行对比,得出结论:UMAP方法针对单细胞RNA数据降维聚类的效果更为理想。最后以UMAP非线性降维聚类的结果为例筛选出不同细胞类别中的显著差异化基因。
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关键词
单细胞RNA测序
t-SNE
UMAP
显著差异化基因
下载PDF
职称材料
克草胺防除大豆田杂草药效试验
2
作者
王继善
邹井玉
李元夫
《农药》
CAS
北大核心
1989年第4期61-61,64,25,共3页
本文通过对防除大豆田间杂草,施用国产克草胺除草剂与国外氟乐灵等除草剂进行药效对比试验证明,克草胺灭草保产与氟乐灵等无显著差异,可以取代氟乐灵等进行开发应用。
关键词
克草胺
大豆
田间杂草
药效试验
下载PDF
职称材料
题名
基于t-SNE与UMAP降维的细胞分类及差异化基因筛选研究
被引量:
1
1
作者
李元夫
机构
南京信息工程大学数学与统计学院
出处
《应用数学进展》
2022年第10期6951-6958,共8页
文摘
单细胞RNA测序技术已经广泛地应用于细胞异质性等关键生物学问题的研究中,与此同时该技术的发展也为基因数据分析提出了很大的挑战。本文基于t-SNE和UMAP两种非线性降维方法,对单细胞RNA数据进行降维、聚类并与线性主成分降维聚类结果进行对比,得出结论:UMAP方法针对单细胞RNA数据降维聚类的效果更为理想。最后以UMAP非线性降维聚类的结果为例筛选出不同细胞类别中的显著差异化基因。
关键词
单细胞RNA测序
t-SNE
UMAP
显著差异化基因
分类号
O29 [理学—应用数学]
下载PDF
职称材料
题名
克草胺防除大豆田杂草药效试验
2
作者
王继善
邹井玉
李元夫
机构
辽宁省瓦房店市植保站
瓦房店市土城乡农技站
出处
《农药》
CAS
北大核心
1989年第4期61-61,64,25,共3页
文摘
本文通过对防除大豆田间杂草,施用国产克草胺除草剂与国外氟乐灵等除草剂进行药效对比试验证明,克草胺灭草保产与氟乐灵等无显著差异,可以取代氟乐灵等进行开发应用。
关键词
克草胺
大豆
田间杂草
药效试验
分类号
S451.224 [农业科学—植物保护]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于t-SNE与UMAP降维的细胞分类及差异化基因筛选研究
李元夫
《应用数学进展》
2022
1
下载PDF
职称材料
2
克草胺防除大豆田杂草药效试验
王继善
邹井玉
李元夫
《农药》
CAS
北大核心
1989
0
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