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长链非编码RNA在骨关节炎中的发病机制及中药干预
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作者 黄柯琪 李加根 +1 位作者 陈尚桐 容向宾 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第34期5571-5576,共6页
背景:骨关节炎的病因多样且发病机制复杂,具体的发病机制至今仍未完全明确。随着生物信息领域近年的不断深入,越来越多研究发现可能是关节骨组织中长链非编码RNA(lncRNA)和微小核糖核酸(miRNA)异常表达介导下游相关信号通路参与骨关节... 背景:骨关节炎的病因多样且发病机制复杂,具体的发病机制至今仍未完全明确。随着生物信息领域近年的不断深入,越来越多研究发现可能是关节骨组织中长链非编码RNA(lncRNA)和微小核糖核酸(miRNA)异常表达介导下游相关信号通路参与骨关节炎的发展。目的:综述lncRNA在骨关节炎发展过程中的作用机制,以及中药单体和复方有效成分调控lncRNA及下游信号通路对骨关节炎的治疗作用。方法:以“lncRNA,膝骨关节炎,miRNA,软骨细胞,信号通路,中药”为中文检索词检索中国知网、万方、维普数据库;以“long non-coding RNA,knee osteoarthritis,miRNA,chondrocytes,signal pathway,traditional chinese medicine”为英文检索词检索PubMed数据库,检索各数据库建库至2023年3月的相关文献,根据纳入及排除标准最终纳入61篇文献。结果与结论:(1)骨关节炎的发病机制涉及复杂的分子调控网络,其中包括软骨组织中lncRNA、miRNA的异常表达,这些异常表达可能导致软骨细胞凋亡、软骨细胞外基质降解及促炎细胞因子的大量生成,这些变化相互作用,导致关节软骨的退变和关节炎的进展,因此需要进一步深入的研究来揭示分子调控网络的精细机制;(2)中药治疗骨关节炎的作用机制主要集中在调节lncRNA、miRNA的表达进而减轻软骨细胞凋亡、细胞外基质降解及促进细胞增殖,延缓骨关节炎的发生发展。 展开更多
关键词 骨关节炎 lncRNA ceRNA 中药 治疗进展 综述 组织工程
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机器学习识别激素性股骨头坏死中线粒体自噬诊断标志物及免疫浸润分析
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作者 黄柯琪 陈跃平 +1 位作者 陈尚桐 李加根 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第11期2402-2410,共9页
背景:线粒体自噬和激素性股骨头坏死的发生、发展关系密切,但具体生物标志物及调控机制尚未明确。目的:通过机器学习算法识别激素性股骨头坏死中线粒体自噬的关键标志物及免疫浸润分析。方法:从GEO数据库下载股骨头坏死数据集GSE123568... 背景:线粒体自噬和激素性股骨头坏死的发生、发展关系密切,但具体生物标志物及调控机制尚未明确。目的:通过机器学习算法识别激素性股骨头坏死中线粒体自噬的关键标志物及免疫浸润分析。方法:从GEO数据库下载股骨头坏死数据集GSE123568和GSE74089,分别作为训练集和验证集,在激素性股骨头坏死组和对照组之间选择差异表达基因,进行加权共表达分析。从MitoCarta 3.0数据库下载线粒体自噬相关基因,然后与差异基因和模块基因取交集。利用两种机器学习算法鉴定激素性股骨头坏死线粒体自噬关键基因,利用外部验证集进行验证。采用CIBERSORT和免疫浸润分析免疫细胞占比,单样本基因集富集分析线粒体自噬基因与免疫细胞的相关性分析。结果与结论:①差异分析共获得1163个差异基因,其中有663个上调基因和500个下调基因;加权共表达分析鉴定出4个相关模块,共1412个模块基因;②最终与线粒体自噬基因取交集初步筛选出39个交叉基因可能是疾病相关线粒体自噬基因;GO富集分析结果显示,生物过程主要涉及血红素代谢、线粒体运输、核苷酸双磷酸代谢和硫酯代谢过程,细胞组分主要涉及线粒体基质、线粒体外膜、细胞器外膜和线粒体内膜,分子功能主要涉及脂肪酸连接酶活性、铁-硫簇结合和辅酶A连接酶活性;KEGG富集分析结果共映射出6条通路,主要涉及脂肪酸降解、线粒体自噬、丁酸代谢、脂肪酸生物合成和辅因子生物合成;③经LASSO回归和随机森林算法分析最终得到4个核心基因(ALDH5A1、FBXL4、MCL1和STOM),4个核心基因和诊断列线图外部验证集的受试者工作特征曲线均大于0.9;④激素性股骨头坏死发生发展与活化的树突状细胞、骨髓来源的抑制性细胞、调节性T细胞和中心记忆CD8T细胞等免疫细胞有关;⑤结果显示,4个关键的线粒体自噬基因ALDH5A1、FBXL4、MCL1和STOM通过破骨细胞分化和免疫机制在激素性股骨头坏死进展中发挥关键作用,均具有较好的疾病预测效果,可能作为激素性股骨头坏死诊断和治疗的生物标志物。 展开更多
关键词 激素性股骨头坏死 线粒体自噬 机器学习 免疫细胞浸润 关键标志物
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基于机器学习探讨不同年龄阶段半月板损伤铁死亡作用机制和免疫浸润研究
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作者 黄柯琪 陈跃平 +2 位作者 曾浩 李加根 陈尚桐 《海南医学院学报》 CAS 北大核心 2024年第5期367-375,共9页
目的:确定不同年龄阶段半月板损伤的重要铁死亡相关生物标志物和免疫浸润研究。方法:(1)从GEO数据库中获得训练数据集,使用GSE191157基因芯片表达矩阵分析数据,同时,从铁死亡官方下载相关基因进行进一步分析。(2)使用“limma”包对半月... 目的:确定不同年龄阶段半月板损伤的重要铁死亡相关生物标志物和免疫浸润研究。方法:(1)从GEO数据库中获得训练数据集,使用GSE191157基因芯片表达矩阵分析数据,同时,从铁死亡官方下载相关基因进行进一步分析。(2)使用“limma”包对半月板损伤的老年患者和年轻患者进行差异表达基因分析,对GSE191157基因芯片的所有基因进行WGCNA分析。(3)选取2个与半月板损伤疾病最相关的颜色模块,再将相关模块的基因与铁死亡相关基因取交集。(4)随后将交集基因进行本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析。(5)通过机器学习LASSO回归对不同年龄半月板损伤铁死亡交集基因进行分析,提取核心基因。(6)最后进行基因集富集分析(GSEA)、SSGEVA免疫浸润等功能分析,确定核心基因与半月板损伤铁死亡确有相关性。结果:共鉴定出2517个差异基因,与铁死亡相关基因取交集得到61个基因,经WGCNA分析后得到与疾病相关性最高的青色和黄色模块,与之取交集得到46个交集基因;通过机器学习LASSO回归筛选出4个核心基因BEX1、MMP13、PTPN18和SLC38A1;GSEA分析结果提示半月板损伤铁死亡主要与Toll样受体信号通路、RNA转录与剪接、mTOR信号通路和ECM-受体相互作用有关;免疫细胞浸润分析显示出核心基因表达与免疫细胞浸润之间具有明显相关性,MMP13在效应记忆CD8 T细胞、CD56dim自然杀伤细胞、中央记忆CD4 T细胞中呈现负相关,而SLC38A1、BEX1、PTPN18三个核心基因呈正相关。结论:该研究共筛选出4个与不同年龄阶段半月板损伤的铁死亡相关关键基因,分别为BEX1、MMP13、PTPN18和SLC38A1;免疫细胞浸润分析显示出核心基因表达与免疫细胞浸润之间具有明显相关性。 展开更多
关键词 半月板损伤 铁死亡 免疫浸润 生物信息学 机器学习
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器官系统-临床整合教学模式在中医骨伤科学实习教学中的应用
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作者 陈跃平 陈尚桐 +1 位作者 黄柯琪 李加根 《广西中医药大学学报》 2023年第4期86-89,102,共5页
[目的]探讨器官系统-临床整合教学模式在中医骨伤科学实习教学中的教学效果。[方法]选择2017级、2018级中医学专业本科实习生70人为教学对象,其中2017级的学生35人为对照组,2018级的学生35人为试验组。对照组采用传统教学方法,试验组采... [目的]探讨器官系统-临床整合教学模式在中医骨伤科学实习教学中的教学效果。[方法]选择2017级、2018级中医学专业本科实习生70人为教学对象,其中2017级的学生35人为对照组,2018级的学生35人为试验组。对照组采用传统教学方法,试验组采用器官系统-临床整合教学模式教学。在实习结束后采用出科考核和调查问卷的方式评价教学效果。[结果]试验组出科临床操作考核、综合笔试考核、人文考核以及出科总成绩均高于对照组,且两组差异有统计学意义(P<0.05)。试验组超过90%的学生认为器官系统-临床整合教学模式能够激发学习主动性,提高自主学习能力,提高临床操作能力等。[结论]采取器官系统-临床整合医学教学模式带教的学生成绩更佳,更受学生欢迎,教学效果显著。 展开更多
关键词 器官系统 临床教学 中医骨伤科学 教学改革
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牛棉籽饼中毒并发流产的诊疗
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作者 李加根 《湖南畜牧兽医》 2010年第6期24-25,共2页
1发病情况 2003年4月2日,我县长寿镇坳上村四组有一母黄牛突发疾病。此牛与其他牛自2002年11月起,投喂土榨棉籽饼,每天用量2.5~3kg,直至发病畜主诉:母牛6岁,已妊娠7个月。近一月来,此牛大便干燥,粪便上附有血丝粘液,小便呈红色。4月... 1发病情况 2003年4月2日,我县长寿镇坳上村四组有一母黄牛突发疾病。此牛与其他牛自2002年11月起,投喂土榨棉籽饼,每天用量2.5~3kg,直至发病畜主诉:母牛6岁,已妊娠7个月。近一月来,此牛大便干燥,粪便上附有血丝粘液,小便呈红色。4月1日下午出栏饮水时,眼睛好象视物不见而掉进沟里,今早发现腹胀,阴部流血,不吃饲料。 展开更多
关键词 棉籽饼中毒 母黄牛 诊疗 流产 并发 发病情况 投喂 母牛
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猪疥螨综合防治体会
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作者 李加根 《湖南畜牧兽医》 2009年第3期33-34,共2页
猪疥螨(俗称猪癞子)是由疥螨科的猪疥螨寄生于猪的表皮以内所引起的一种以瘙痒和皮肤炎症为特征的慢性皮肤病。疥螨病对猪的危害是疥螨侵入表皮,并引起其他病原体的感染。尤其在每年的秋冬季,疥螨病的流行都十分严重,已成为困扰猪... 猪疥螨(俗称猪癞子)是由疥螨科的猪疥螨寄生于猪的表皮以内所引起的一种以瘙痒和皮肤炎症为特征的慢性皮肤病。疥螨病对猪的危害是疥螨侵入表皮,并引起其他病原体的感染。尤其在每年的秋冬季,疥螨病的流行都十分严重,已成为困扰猪场的主要疾病。 展开更多
关键词 猪疥螨 综合防治 慢性皮肤病 皮肤炎症 疥螨病 病原体 秋冬季 表皮
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胫腓双骨折内固定是否固定腓骨的比较
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作者 陈尚桐 陈跃平 +5 位作者 黄川洪 董盼锋 章晓云 卓映宏 黄柯琪 李加根 《中国矫形外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期979-984,共6页
[目的]比较胫腓双骨折开放复位内固定术是否固定腓骨的临床疗效。[方法]回顾性分析2018年1月—2020年1月广西中医药大学附属瑞康医院创伤骨科收治的54例胫腓骨双骨折患者的临床资料,依据术前医患沟通结果,29例固定腓骨,25例不固定腓骨... [目的]比较胫腓双骨折开放复位内固定术是否固定腓骨的临床疗效。[方法]回顾性分析2018年1月—2020年1月广西中医药大学附属瑞康医院创伤骨科收治的54例胫腓骨双骨折患者的临床资料,依据术前医患沟通结果,29例固定腓骨,25例不固定腓骨。比较两组围手术期、随访和影像资料。[结果]所有患者均顺利完成手术,术中无相关并发症发生。固定组手术时间[(112.4±13.3)min vs(81.0±11.2)min,P<0.001]、切口总长度[(7.0±1.3)cm vs(4.9±1.2)cm,P<0.001]显著长于未固定组,但前者术中透视次数[(3.0±0.9)次vs(5.1±1.4)次,P<0.001]、术后首次触地时间[(8.4±1.4)d vs(24.9±3.0)d,P<0.001]均显著少于后者。所有患者获得随访,随访时间12~18个月。固定组恢复完全负重活动时间显著早于未固定组[(22.1±1.3)周vs(23.4±1.0)周,P<0.001]。与术后3个月相比,末次随访时,两组VAS、HSS、AOFAS评分及踝背伸-跖屈ROM均显著改善(P<0.05)。末次随访时,固定组VAS[(0.2±0.3)vs(1.3±0.8),P<0.001]、HSS[(88.8±0.7)vs(87.3±2.1),P<0.001]、AOFAS[(91.3±6.6)vs(79.7±14.0),P<0.001]评分及膝伸-屈ROM[(134.9±5.5)°vs(126.2±6.1)°,P<0.001]、踝背伸-跖屈ROM[(58.1±8.4)°vs(44.2±10.4)°,P<0.001]均优于非固定组。影像方面,固定组的骨折复位优良率显著高于未固定组(P<0.05),固定组的影像骨折愈合时间显著早于非固定组(P<0.05)。[结论]对胫腓骨双骨折开放复位内固定中,固定腓骨临床结果更优,是一种可行的方法。 展开更多
关键词 胫骨腓骨骨折 骨折固定术 腓骨固定 腓骨不固定
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