盐胁迫下白花前胡香豆素合成途径关键酶基因生物信息学分析

目的系统研究白花前胡香豆素合成途径关键酶基因的蛋白结构特征,并明确关键酶基因在盐胁迫下的表达模式。方法通过白花前胡前期转录组测序,确定前胡香豆素生物合成关键酶基因的序列,利用蛋白质结构分析预测软件对关键酶蛋白进行系统预测分析,并通过qRT-PCR分析盐胁迫下关键酶基因的变化规律。结果关键酶基因编码蛋白都有着各自特殊的保守结构域和三级结构;0.15 mol/L NaCl处理4 h对PAL和4CL基因的表达水平影响最高,比对照组上调1倍;而COMT-S和GXM在不同处理时间下,基因表达水平均明显下降。结论受盐胁迫后上调表达的香豆素合成途径关键酶基因,可以提高植物对逆境胁迫的耐受性。

基于ITS序列分析霍山石斛及其近缘物种之间的亲缘关系

通过分析部分石斛属植物的ITS序列,研究霍山石斛与其近缘物种之间的亲缘关系,并分析石斛属的起源及分化时间.从GenBank下载了1种Malaxis属、1种Liparis属的ITS核苷酸序列为外群,27种石斛属的ITS核序列为内群.经比对后序列长度为682 bp,外群及石斛属的A+T含量均高于C+G,其中序列中有416个变异位点.A+T平均含量为46.4%,C+G平均含量为53.6%.从系统发育树中看出内群分为6支,霍山石斛与石斛组中其他物种的亲缘关系最近,与顶叶组的亲缘关系较近,而与Spatulata组、Dendrocoryne组和Latouria组的亲缘关系最远.对石斛属系统发育的分析显示大部分石斛属分组与传统石斛分组相同,与传统石斛分组不同的是顶叶组的鼓槌石斛、叉唇组和瘦轴组的物种都聚类到石斛组,顶叶组小黄花石斛与聚石斛可能应该另立新的石斛组.通过贝叶斯法估算得出石斛属的最近共同祖先时间为21.4109Ma,而石斛组的最近共同祖先时间为16.5522 Ma,组内平均分化时间约为7.3445 Ma.本研究表明石斛组起源于中新世早期,组内分化主要发生在中新世后期,气候的改变可能促使了石斛组内分化.(图1表2参27)