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基于转录组测序探索创伤弧菌MO6-24/O小RNA
1
作者
周亚男
李宗城
+3 位作者
张晓彤
胡成进
应晓敏
曹源
《生物技术通讯》
CAS
2019年第3期354-359,共6页
目的:基于转录组测序注释,探索创伤弧菌MO6-24/O小RNA(sRNA)。方法:在海洋培养基2216E中培养创伤弧菌MO6-24/O,收集从对数生长期到静止期不同时间点的细菌,提取细菌RNA,通过富集sRNA以及去除核糖体RNA进行建库和测序,然后将读段匹配到...
目的:基于转录组测序注释,探索创伤弧菌MO6-24/O小RNA(sRNA)。方法:在海洋培养基2216E中培养创伤弧菌MO6-24/O,收集从对数生长期到静止期不同时间点的细菌,提取细菌RNA,通过富集sRNA以及去除核糖体RNA进行建库和测序,然后将读段匹配到创伤弧菌MO6-24/O基因组并进行注释,最后进行验证。结果:发现59个顺式编码sRNA、102个反式编码sRNA,并进行了部分验证。结论:鉴定出创伤弧菌MO6-24/OsRNA。
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关键词
创伤弧菌
小RNA
转录组测序
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职称材料
体内与体外RNA-RNA相互作用的比较初探
2
作者
陆启轩
查磊
+3 位作者
李宗城
陈临溪
李伍举
应晓敏
《军事医学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第7期517-520,共4页
目的通过比较in vitro与in vivo的RNA-RNA相互作用(RNA-RNA interaction,RRI),探究通过in vitroRRI推测in vivo RRI的可靠性。方法采用perl语言编写脚本分析酵母转录组水平in vitro RNA的二级结构信息,得到可能的in vitro RRI,再与酵母...
目的通过比较in vitro与in vivo的RNA-RNA相互作用(RNA-RNA interaction,RRI),探究通过in vitroRRI推测in vivo RRI的可靠性。方法采用perl语言编写脚本分析酵母转录组水平in vitro RNA的二级结构信息,得到可能的in vitro RRI,再与酵母的in vivo小核仁RNA(snoRNA)-rRNA相互作用进行比较。结果发现in vitrosnoRNA-rRNA相互作用与in vivo snoRNA-rRNA相互作用的重叠率仅为23.42%(26/111);而in vitro测定的snoRNA双链片段与in vivo测定的参与RRI的snoRNA片段重叠率为38.78%(19/49);in vitro测定的rRNA双链片段与in vivo测定的参与RRI的rRNA片段重叠率为80.70%(46/57)。结论 in vitro和in vivo条件下snoRNA-rRNA的相互作用差异很大,提示in vitro条件下测定的snoRNA-rRNA的相互作用不能真实反映它们在in vivo的相互作用。
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关键词
RNA—RNA相互作用
生物信息学
RNA
小核仁
核糖体RNA
原文传递
推动酒产业创新发展的思考
3
作者
李宗城
《社会主义论坛》
2007年第12期38-39,共2页
中华民族几千年的酿酒历史,孕育出了底蕴丰厚的酒文化,给人类文明进步和生活增添了绚丽的色彩,也为今天酒产业的发展提供了无穷的文化动力。地处西南边疆的云南茅粮酒业集团,正是依托云南丰富多彩的民族酒文化,紧密跟踪当代消费者...
中华民族几千年的酿酒历史,孕育出了底蕴丰厚的酒文化,给人类文明进步和生活增添了绚丽的色彩,也为今天酒产业的发展提供了无穷的文化动力。地处西南边疆的云南茅粮酒业集团,正是依托云南丰富多彩的民族酒文化,紧密跟踪当代消费者的需求变化,加强产品的开发创新,不断扩充品牌的文化内涵,提升品牌的影响力,推动了企业又好又快发展。从1995年开始创办时只是一家以酿酒和地方资源开发利用为一体的小企业,发展成为拥有4个子公司、固定员工1600多人、白酒产品多样化、总资产达到4.5亿元的大型企业,被国家批准升格为省级企业集团。
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关键词
酿酒历史
产业创新
产品多样化
资源开发利用
中华民族
企业集团
文明进步
文化动力
原文传递
题名
基于转录组测序探索创伤弧菌MO6-24/O小RNA
1
作者
周亚男
李宗城
张晓彤
胡成进
应晓敏
曹源
机构
潍坊医学院医学检验学系
解放军第九六〇医院实验诊断科
解放军总医院第五医学中心南院区肿瘤学研究室
军事医学研究院军事认知与脑科学研究所
出处
《生物技术通讯》
CAS
2019年第3期354-359,共6页
基金
国家自然科学基金(31100960)
文摘
目的:基于转录组测序注释,探索创伤弧菌MO6-24/O小RNA(sRNA)。方法:在海洋培养基2216E中培养创伤弧菌MO6-24/O,收集从对数生长期到静止期不同时间点的细菌,提取细菌RNA,通过富集sRNA以及去除核糖体RNA进行建库和测序,然后将读段匹配到创伤弧菌MO6-24/O基因组并进行注释,最后进行验证。结果:发现59个顺式编码sRNA、102个反式编码sRNA,并进行了部分验证。结论:鉴定出创伤弧菌MO6-24/OsRNA。
关键词
创伤弧菌
小RNA
转录组测序
Keywords
Vibrio vulnificus
small RNA
transcriptome sequencing
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
下载PDF
职称材料
题名
体内与体外RNA-RNA相互作用的比较初探
2
作者
陆启轩
查磊
李宗城
陈临溪
李伍举
应晓敏
机构
南华大学药物药理研究所
军事医学科学院基础医学研究所
出处
《军事医学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第7期517-520,共4页
基金
国家973计划资助项目(2010CB912801)
国家自然科学基金资助项目(31241404
+2 种基金
30901577
81270420
31071157)
文摘
目的通过比较in vitro与in vivo的RNA-RNA相互作用(RNA-RNA interaction,RRI),探究通过in vitroRRI推测in vivo RRI的可靠性。方法采用perl语言编写脚本分析酵母转录组水平in vitro RNA的二级结构信息,得到可能的in vitro RRI,再与酵母的in vivo小核仁RNA(snoRNA)-rRNA相互作用进行比较。结果发现in vitrosnoRNA-rRNA相互作用与in vivo snoRNA-rRNA相互作用的重叠率仅为23.42%(26/111);而in vitro测定的snoRNA双链片段与in vivo测定的参与RRI的snoRNA片段重叠率为38.78%(19/49);in vitro测定的rRNA双链片段与in vivo测定的参与RRI的rRNA片段重叠率为80.70%(46/57)。结论 in vitro和in vivo条件下snoRNA-rRNA的相互作用差异很大,提示in vitro条件下测定的snoRNA-rRNA的相互作用不能真实反映它们在in vivo的相互作用。
关键词
RNA—RNA相互作用
生物信息学
RNA
小核仁
核糖体RNA
Keywords
RNA-RNA interactions
bioinformatics
snoRNA
rRNA
分类号
R341 [医药卫生—基础医学]
原文传递
题名
推动酒产业创新发展的思考
3
作者
李宗城
机构
云南茅粮酒业集团董事长
出处
《社会主义论坛》
2007年第12期38-39,共2页
文摘
中华民族几千年的酿酒历史,孕育出了底蕴丰厚的酒文化,给人类文明进步和生活增添了绚丽的色彩,也为今天酒产业的发展提供了无穷的文化动力。地处西南边疆的云南茅粮酒业集团,正是依托云南丰富多彩的民族酒文化,紧密跟踪当代消费者的需求变化,加强产品的开发创新,不断扩充品牌的文化内涵,提升品牌的影响力,推动了企业又好又快发展。从1995年开始创办时只是一家以酿酒和地方资源开发利用为一体的小企业,发展成为拥有4个子公司、固定员工1600多人、白酒产品多样化、总资产达到4.5亿元的大型企业,被国家批准升格为省级企业集团。
关键词
酿酒历史
产业创新
产品多样化
资源开发利用
中华民族
企业集团
文明进步
文化动力
分类号
F124.3 [经济管理—世界经济]
TS971 [轻工技术与工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组测序探索创伤弧菌MO6-24/O小RNA
周亚男
李宗城
张晓彤
胡成进
应晓敏
曹源
《生物技术通讯》
CAS
2019
0
下载PDF
职称材料
2
体内与体外RNA-RNA相互作用的比较初探
陆启轩
查磊
李宗城
陈临溪
李伍举
应晓敏
《军事医学》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
原文传递
3
推动酒产业创新发展的思考
李宗城
《社会主义论坛》
2007
0
原文传递
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