目的旨在探究结直肠癌患者中驱动蛋白家族成员2A(Kinesin Family 2A,KIF2A)的表达,其与患者临床病理特征和预后的相关性,以及敲降KIF2A对结直肠癌细胞HCT116增殖、侵袭、迁移,以及其下游PI3K/AKT信号通路的影响。方法回顾性分析2016年1...目的旨在探究结直肠癌患者中驱动蛋白家族成员2A(Kinesin Family 2A,KIF2A)的表达,其与患者临床病理特征和预后的相关性,以及敲降KIF2A对结直肠癌细胞HCT116增殖、侵袭、迁移,以及其下游PI3K/AKT信号通路的影响。方法回顾性分析2016年1月至2019年12月98例经手术切除治疗的结直肠癌患者,并采用免疫组织化学染色方法(Immunohistochemistry,IHC)测定患者术中留存的癌组织和癌旁组织KIF2A的表达,通过在HCT116细胞中转染抑制KIF2A表达的小分子化合物(KIF2A、ShRNA)来探究。结果根据IHC染色评分,将KIF2A表达水平划分为高表达(IHC评分>3)和低表达(IHC评分≤3)。收集患者术前肿瘤特征,获取患者的生存随访信息,并计算总体生存期(Overall Survival,OS)。敲降KIF2A对细胞的作用通结果显示,KIF2A在癌组织中显著高于癌旁组织(P<0.001)。且癌组织KIF2A高表达与较大的肿瘤直径、淋巴结转移、较高的N分期和TNM分期相关(P<0.05)。此外,KIF2A高表达患者OS显著低于KIF2A低表达患者;进一步分析结果显示,KIF2A高表达是较差OS的独立预测因素(P<0.05)。此外,细胞实验结果表明,敲降KIF2A可通过靶向PI3K/AKT信号通路,从而抑制HCT116的恶性增殖和迁移,促进其凋亡。结论KIF2A与结直肠癌的肿瘤特征以及不良预后相关,且敲降KIF2A可抑制PI3K/AKT信号通路的激活,从而抑制结直肠癌细胞恶性增殖、迁移能力,促进其凋亡,表明其有成为结直肠癌标志物的潜能。展开更多
文摘目的:通过使用生物信息学方法分析高通量芯片,揭示与椎间盘退变(IDD)相关的信号通路和miRNA-mRNA的调控关系。方法:首先,从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载了IDD相关的两个数据集:GSE56081和GSE116726。使用R编程环境的limma软件包鉴定出IDD样本和正常样本的差异表达基因(DEGs)和差异表达miRNA(DE-miRNAs),并且对DEGs进行了GO(Gene Ontology)功能富集分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析,以鉴定IDD中DEGs相关的生物学功能。通过miRTarBase数据库筛选出DE-miRNAs经过试验验证的靶基因,并将靶基因与DEGs取交集,最终构建高度可信的miRNA-mRNA调控关系网络,通过Cytoscape软件将其可视化。结果:总共筛选出523个DEGs和858个DE-miRNAs。GO分析表明,DEGs可能参与的生物过程(BP)包括生物调节、代谢过程、对刺激的反应、多细胞生物过程、细胞通讯、定位等;细胞成分(CC)主要涉及细胞膜、细胞核、含蛋白质复合物、细胞外基质、细胞投射、细胞骨架等;分子功能(MF)主要包括蛋白质结合、离子结合、核酸结合、转移酶活性、水解酶活性、结构分子活性等。KEGG途径分析表明,鉴定出的DEGs可能主要通过TGF-β信号通路、TNF信号通路、雌激素信号通路、PI3K-Akt信号通路四条通路影响IDD的进程。最后分析出32对miRNAs-mRNAs的调控关系。结论:本研究鉴定了可能参与IDD的信号通路和高度可信的miRNA-mRNA调控关系,为研究IDD的分子机制提供了新的理论依据和研究方向。
文摘目的旨在探究结直肠癌患者中驱动蛋白家族成员2A(Kinesin Family 2A,KIF2A)的表达,其与患者临床病理特征和预后的相关性,以及敲降KIF2A对结直肠癌细胞HCT116增殖、侵袭、迁移,以及其下游PI3K/AKT信号通路的影响。方法回顾性分析2016年1月至2019年12月98例经手术切除治疗的结直肠癌患者,并采用免疫组织化学染色方法(Immunohistochemistry,IHC)测定患者术中留存的癌组织和癌旁组织KIF2A的表达,通过在HCT116细胞中转染抑制KIF2A表达的小分子化合物(KIF2A、ShRNA)来探究。结果根据IHC染色评分,将KIF2A表达水平划分为高表达(IHC评分>3)和低表达(IHC评分≤3)。收集患者术前肿瘤特征,获取患者的生存随访信息,并计算总体生存期(Overall Survival,OS)。敲降KIF2A对细胞的作用通结果显示,KIF2A在癌组织中显著高于癌旁组织(P<0.001)。且癌组织KIF2A高表达与较大的肿瘤直径、淋巴结转移、较高的N分期和TNM分期相关(P<0.05)。此外,KIF2A高表达患者OS显著低于KIF2A低表达患者;进一步分析结果显示,KIF2A高表达是较差OS的独立预测因素(P<0.05)。此外,细胞实验结果表明,敲降KIF2A可通过靶向PI3K/AKT信号通路,从而抑制HCT116的恶性增殖和迁移,促进其凋亡。结论KIF2A与结直肠癌的肿瘤特征以及不良预后相关,且敲降KIF2A可抑制PI3K/AKT信号通路的激活,从而抑制结直肠癌细胞恶性增殖、迁移能力,促进其凋亡,表明其有成为结直肠癌标志物的潜能。