高油酸花生新品种蜀花7号的选育

四川省农业科学院经济作物育种栽培研究所利用中花8号/K01-6杂交育成高油酸花生品种蜀花7号,2022年与四川花生加工企业四川省百世兴食品产业有限公司联合完成品种登记,品种登记号:GPD花生(2022)510122。蜀花7号具有高油酸、抗逆性强、适应性广等特点。对该品种的选育过程、特征特性、产量表现和栽培技术要点进行了介绍。

优质高糖水果型花生新品种蜀花9号的选育及配套栽培技术

为应对消费者对优质可口食用型花生的需求,利用四川省成都市金堂县的鲜食型红花生地方品种自然变异单株,通过连续5年的系谱选育,培育出适宜四川地区种植的优质高糖水果型花生新品种“蜀花9号”。2022年8月通过农业农村部非主要农作物品种登记,登记编号GDP花生(2022)510121。该品种蛋白质含量26.75%,脂肪含量43.54%,油酸含量39.25%,亚油酸含量36.68%,油亚比1.07。2019~2020年参加四川省多点试验,荚果平均产量3839.70kg/hm2,籽仁平均产量2809.80kg/hm2,适宜在四川非青枯病、叶斑病高发花生产区春季、麦/油后直播种植。

41株戈登菌的系统发育学分析及其基因组功能的挖掘

目的探讨41株戈登菌的系统发育学及其基因组中含碳水化合物活性酶、次级代谢产物生物合成基因簇的种类及多样性。方法以公开发表的41株戈登菌全基因组数据为研究对象,利用原核生物泛基因组学分析的自动化软件对泛基因组特征进行分析,结合直系同源蛋白分组对数据库、碳水化合物活性酶数据库和基因组次级代谢产物分析工具对基因组进行预测;提取19株戈登菌基因组DNA,采用16S小亚基核糖体RNA(16S rRNA)通用引物进行PCR扩增,并构建系统发育树。结果戈登菌基因组平均大小为4941636.42 bp,预测的基因数均数4370.46,G+C平均含量为67.25%,蛋白质编码区平均为4445.60;平均核苷酸多态性、DNA-DNA杂交值和16S rRNA基因序列分析表明戈登菌分类地位明确;戈登菌具有开放型泛基因组,核心基因组基因数目会稳定在1036个左右;所有菌株基因序列中含有丰富的糖基转移酶和糖苷水解酶;聚酮合酶、非核糖体肽合成酶和萜烯类生物合成基因簇在戈登菌属中占比较高,且土壤来源的菌株含生物合成基因簇最长。结论戈登菌基因组具有多样性,含丰富的碳水化合物活性酶,能产生多种抗菌和抗肿瘤的次级代谢产物。

新疆青海中度嗜盐放线菌生物多样性初步研究

从我国新疆、青海等地采集数份盐碱土样或泥样 ,采用淀粉 -酪素琼脂培养基、甘油天门冬酰胺琼脂培养基、土壤浸汁琼脂培养基分别从中分离到 8株、32株中度嗜盐放线菌菌株。经形态、生理学特性与全细胞壁氨基酸组分分析结果比较 ,选取其中的 1 4株进行 1 6SrDNA序列分析。就物种多样性而言 ,新疆、青海分离到中度嗜盐放线菌分布至少有 3个科 ,5个属。其中有拟诺卡氏菌科 (Nocardiopsaceae)的拟诺卡氏菌属 (Nocardiopsis)和链单孢菌属 (Streptomonospora) ;假诺卡氏菌科 (Pseudonocardiaceae)的普氏菌属 (Prauserella)和糖单孢菌属 (Saccharomonospora) ;链霉菌科 (Streptomycetaceae)的链霉菌属 (Streptomyces)。就地区分布来讲 。

极端环境中的放线菌资源

由于极端微生物具有独特的基因类型 ,特殊的生理机制及特殊的代谢产物 ,因此是一类新型的且具有很大开发潜力的生物资源。重点介绍了国内外在极端环境下的微生物尤其是放线菌资源的研究状况。

几种主要稀有放线菌的选择性分离

放线菌是具有巨大工业价值的一类微生物 ,但一百多年来人们只分离到自然界实有总数的 10 %～2 0 %。之所以绝大多数的微生物未被发现 ,主要原因是受分离条件和技术的限制。因此放线菌尤其是稀有放线菌的选择分离技术仍然是放线菌生物学研究和资源开发中的重大课题。作者根据自己在放线菌分离方面的多年经验 ,对一些主要的可产生生物活性物质的稀有放线菌 (小单孢菌、小双孢菌、小四孢菌 ,链孢囊菌、指孢囊菌 ,游动放线菌 ,马杜拉放线菌 ,双孢放线菌 )

高温放线菌属两菌株的化学分类和分子分类研究

从云南温泉和火山口分离出两株嗜热放线菌YIM60013和YIM60032。对其形态、生理生化特性、细胞壁化学组分以及16SrDNA序列进行了研究,并与高温放线菌的已知种进行了比较,初步认为这是高温放线菌属的两个新种,分别命名为白色高温放线菌(Thermoactinomycesalbussp.nov)和云南高温放线菌(Thermoactinomycesyunnanensissp.nov)。两个新种在气生菌丝和基内菌丝上均产生单孢子,纯细胞壁和全细胞糖分析表明含meso DAP和半乳糖、阿拉伯糖、木糖及少量的葡萄糖。菌丝体自溶或非自溶,气生菌丝白色或灰色,碳源利用类型有所不同。

微波法快速提取放线菌基因组DNA

原有的放线菌基因组DNA提取方法费时、费力、费用高 ,且对极端环境放线菌成功率较低。利用微波热振惊提取固体培养基表面放线菌菌落基因组DNA ,具有快速、简便、费用低廉等优点。所得的基因组DNA可作为PCR反应的模板进行 1 6SrRNA基因有效扩增。

植物内生菌资源

植物内生菌是一类重要的微生物资源,近年来成为微生物资源研究的热点之一。对内生菌的多样性和开发利用的研究进展以及值得研究的问题等方面进行评述。

具抗肿瘤活性放线菌菌株YIM 90022的分离和系统发育分析

从青海盐碱土壤样品中分离到一株兼性嗜碱放线菌YIM 90022，该菌株的发酵产物具有很强的体外抗胃癌、肺癌、乳腺癌、皮肤癌、肾癌和子宫癌肿瘤细胞株活性。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明，菌株YIM 90022属于拟诺卡氏属（Nocardiopsis）的成员，与该属的4个有效发表种N．exhalans DSM 44407^T，N．prasina DSM 43845^T，N．metallicus DSM 44598^T和N．listeri DSM 40297^T系统发育关系最密切，与其分别以98．8％，98．5％，98．4％和97．8％的16S rRNA基因核苷酸序列相似性聚为一簇。但菌株YIM 90022不与这4个有效种中任何一个单独相聚，形成了一个独立亚分枝。结合形态特征、生理生化特性、细胞化学分类特征，以及rep-PCR基因指纹分析等方面的研究结果，菌株YIM 90022可能为拟诺卡氏菌属的一个潜在新种。菌株YIM 90022在大多数培养基上生长良好，气生菌丝和基内菌丝丰富，在酵母膏麦芽膏琼脂、燕麦片琼脂等培养基中产生可溶性色素。生长pH范围6．0．12．0，最适pH8．5；能在含0—15％NaCl（W／V）的培养基上生长。

产生大环聚酮类天然产物放线菌的分子筛选研究

目的 建立一套简便、快速、高效的大环聚酮类化合物产生菌基因筛选体系 ,为聚酮类药物筛选搭建一个新的技术平台 ;认识 PKS- I基因在不同环境放线菌群中的分布规律 ,为新药筛选中微生物资源的定向分离提供依据。方法 通过对大环聚酮类化合物生物合成途径所用的 I型聚酮合成酶氨基酸和核苷酸序列的同源性比较分析 ,设计了一对引物用于扩增 KS/ AT功能域约 1.6 kb目的基因片段 ,依据放线菌基因组中 I型 PKS合成酶基因的存在与否标定可能的大环聚酮类天然产物产生菌。结果 利用建立的大环聚酮类化合物产生菌基因筛选体系对 98株嗜碱放线菌、99株链霉菌、46株嗜盐放线菌和 75 7株稀有放线菌进行了筛选 ,研究表明嗜碱放线菌、链霉菌、嗜盐放线菌和稀有放线菌 I型聚酮合成酶基因的阳性率分别为 2 6 .5 %、2 0 .4%、15 .2 %和 9.35 %。结论 利用组合放线菌基因组 DNA快速提取技术和 PKS- I基因兼并引物 PCR扩增技术建立了快速、简便、高效的大环聚酮类化合物产生菌基因筛选体系 ,并对不同环境条件的放线菌菌群的PKS- I基因分布进行了研究 ,结果不仅表明了放线菌 PKS I聚酮合成酶分布的广泛性 ,而且表明极端环境放线菌 ,尤其是嗜碱放线菌是大环聚酮类化合物潜在的丰富资源 ,为新药筛选有效菌源的确定提供了?

新疆塔里木盆地可培养嗜盐放线菌系统发育多样性

应用纯培养手段和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析,对从塔里木盆地高盐环境土壤样品中分离的18株可培养嗜盐放线菌多样性进行了研究。实验结果表明,18株嗜盐放线菌可归为3个科(Glycomycetaceae、Pseudonocardineae和Nocardiopsaceae),在有效发表的5个属的嗜盐放线菌中有4个属的嗜盐放线菌被分离到。多数菌株属于Actinopolyspora属(38.9%)、Nocardiopsis属(27.8%)和Streptomonospora属(22.2%),是塔里木盆地高盐环境中嗜盐放线菌的优势类群。这些分离菌株中,菌株YIM 92370与最近种的相似性为92%,在Glycomycetaceae科内形成一个独立的分支,极有可能代表Glycomycetaceae科的一个新属。研究结果表明塔里木盆地高盐环境中存在有较为丰富的嗜盐放线菌系统发育多样性,并且潜藏着新类型的放线菌资源。

硝尔库勒湖沉积物中非培养放线菌多样性

【目的】认识和了解盐湖沉积环境中放线菌的多样性,为今后的开发和利用奠定基础。【方法】应用免培养技术和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对新疆硝尔库勒盐湖沉积物中放线菌的多样性进行了研究。实验采用SDS-CTAB法提取土样中总DNA,利用放线菌特异性引物对土样总DNA进行16S rRNA基因扩增,并构建16S rRNA基因克隆文库;对随机挑选的160个克隆通过酶切筛选出51个不同图谱的重组克隆,并对其测序。【结果】所获得的51个克隆序列属于39个OTUs,其中52.9%的克隆序列分布于放线菌门(phylum Actinobacteria)放线菌亚(Actinobacteridae)的5个亚目和酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)中,并且在这两个亚纲中有大量克隆序列属于放线菌的新类群,另外47.1%的克隆序列以极高的自展值在放线菌门内支持形成一个独立的大分支,极有可能代表一个新亚目或更高级分类单元的类群。【结论】这些研究结果说明硝尔库勒盐湖中存在有较为丰富的放线菌系统发育多样性,并且潜藏着新类型的放线菌资源。

青海盐碱环境中具抗肿瘤活性放线菌的筛选和多样性研究

从我国青海省采集盐碱土样或泥样,用添加1.0~3.0mol/L NaCl的GPY琼脂培养基和ISP2琼脂培养基分离到145株典型放线菌菌株。采用6种肿瘤细胞株对分离菌株的发酵产物进行体外筛选,得到26株抗肿瘤活性阳性菌株（17.9%）,19株为拟诺卡氏属（Nocardiopsis）菌株,7株为链霉菌属（Streptomyces）菌株。在抗肿瘤活性、形态特征、生理生化特性和全细胞水解物氨基酸组分分析等实验结果的基础上,选取差异较大的8株抗肿瘤活性阳性菌株进行16S rRNA基因序列测定和系统发育多样性分析。结果表明,2株属于链霉菌属（Streptomyces）的1个已知物种和1个潜在新种;6株属于拟诺卡氏菌属（Nocardiopsis）,可能代表该属的4个新种。研究表明青海盐碱环境中存在产生抗肿瘤活性物质的重要放线菌资源,也提示其中蕴藏着较丰富的微生物多样性。

青海两盐湖细菌多样性研究

用DGGE法和纯培养法 ,对青海柯柯盐湖、茶卡盐湖底泥及周边土壤样品的细菌多样性进行了研究。结果显示 ,两个盐湖存在大量的未知细菌 ,分离到的纯培养仅占实有细菌的小部分。采用多相分类方法 ,鉴定了 1 2株纯培养细菌 ,属 5个可能的新种 ,另有一株菌可能成立一个新属。认为提出新思路、设计新程序 ,从自然极端环境取样 ,分离未知菌 。

三株杀粘虫放线菌的分类鉴定

菌株YIM31331、YIM31333、YIM3135 5是从云南省丽江、中甸采集的土壤样品中分离得到的具有产杀粘虫活性物质菌株。根据其形态学特征、生理生化特性及 16SrDNA序列分析结果 ,认为菌株YIM 31331属于链霉菌属的Streptomycessubrutilus,YIM31333属于指孢囊菌属Dactylosporangiumaurantiacum ,YIM3135 5属于链孢囊菌属Streptospor angiumvulgare。

聚酮类化合物生物合成途径基因阳性菌株生物多样性研究

从中国云南省采集土样,采用GPY培养基、淀粉_酪素琼脂培养基和甘油天门冬酰胺琼脂培养基分离得到了876株细菌放线菌菌株。经聚酮类化合物基因筛选得到75株Ⅰ型和Ⅱ型聚酮类化合物生物合成基因双阳性的菌株,经抗菌活性、形态、生理等结果分析比较,选取其中的10株进行了16SrDNA序列分析。在物种多样性方面,分离到的菌分布至少有7个科,8个属。其中有链霉菌科的链霉菌属,分枝杆菌科的分枝杆菌属,链孢囊菌科的链孢囊菌属和野野村菌属,诺卡氏菌科的诺卡氏菌属,微球菌亚目的一新属、产碱杆菌科的无色杆菌属和β_亚纲中与紫色杆菌属紧邻的一革兰氏阴性菌新属。综合其表型、基因型特征,初步确定其中8株为新物种。研究表明利用新的思路和程序从自然环境分离、鉴定未知菌是微生物资源开发利用的关键。

产生芳香环聚酮类天然产物放线菌的分子筛选研究

目的建立一套简便、快速、高效的芳香环聚酮类化合物产生菌基因筛选体系,为聚酮类药物筛选搭建一个新的技术平台;认识PKS-II基因在不同环境放线菌群中的分布规律,为新药筛选中微生物资源的定向分离提供依据。方法通过对芳香环聚酮类化合物生物合成途径所用的II型聚酮合酶氨基酸和核苷酸序列的同源性比较分析,设计一对简并引物且以微波炉法提取的基因组DNA为模板扩增KS/CLF功能域约0.8kb目的基因片段,依据放线菌基因组中II型PKS合酶基因的存在与否标定可能的芳香环聚酮类天然产物产生菌。结果利用建立的芳香环聚酮类化合物产生菌基因筛选体系对99株嗜碱放线菌、100株链霉菌、47株嗜盐放线菌和776株一般放线菌进行了筛选,研究表明链霉菌、嗜碱放线菌、嗜盐放线菌和一般放线菌II型聚酮合酶基因的阳性率分别为54%、29.3%、25.5%和24.1%。结论组合放线菌基因组DNA快速提取技术和PKSII基因简并引物PCR扩增技术建立了快速、简便、高效的芳香环聚酮类化合物产生菌基因筛选体系并对不同环境条件的放线菌菌群的PKSII基因分布进行了研究。结果表明放线菌PKSII聚酮合酶分布具有广泛性;而且同时表明链霉菌是芳香环聚酮类化合物的最丰富来源;在极端环境放线菌中,嗜盐放线菌的PKSII基因在中度嗜盐放线菌分布的频率远高?

嗜盐放线菌生物学特性初步研究

通过对从新疆 ,青海等地采集的盐碱土样中分离获得的 43株嗜盐或耐盐放线菌以及4株典型菌株的NaCl耐受实验 ,对不同浓度的Na+ ,K+ ,Mg2 + ,Ca2 + 的选择性实验及pH耐受实验进行了研究。发现耐盐放线菌对Na+ ,K+ ,Mg2 + 有广泛的适应性 ,只有少数耐盐放线菌能在较低浓度的CaCl2 条件下生长 ;嗜盐放线菌对Na+ 有广泛的适应性 ,多数嗜盐放线菌生长所需的Na+ 可被K+ ,Mg2 + 所替代 ,而不能被Ca2 + 所替代 ,少数嗜盐放线菌的生长离不开Na+ ,对Na+ 有高度的专一性 ,是专嗜Na+ 的嗜盐放线菌 ,说明不同嗜盐放线菌对Na+ ,K+ ,Mg2 + ,Ca2 + 的适应有选择性。因此 ,提出自然环境中是否也存在类似的专嗜K+ 或专嗜Mg2 + 的嗜盐放线菌的推测。无论是嗜盐还是耐盐放线菌其pH生长范围都在 6 0～1 0之间 ,生长最适pH7 0～ 8 0。另外 。