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皮质醇作用下人体T细胞再循环的数学模型 被引量:4
1
作者 李方廷 漆安慎 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期586-594,共9页
根据人体免疫系统昼夜节律的实验数据 ,提出了皮质醇作用于T淋巴细胞再循环过程途径的假设 ,建立了皮质醇作用下的人体T细胞在淋巴器官与血液之间再循环过程的数学模型。讨论了皮质醇作用的强度及其它再循环参量的取值范围及理论结果对... 根据人体免疫系统昼夜节律的实验数据 ,提出了皮质醇作用于T淋巴细胞再循环过程途径的假设 ,建立了皮质醇作用下的人体T细胞在淋巴器官与血液之间再循环过程的数学模型。讨论了皮质醇作用的强度及其它再循环参量的取值范围及理论结果对参数的敏感性。模型能够较好地解释再循环的T淋巴细胞在淋巴器官与血液中的稳定振荡行为 ,得到的数值模拟结果与免疫系统生物节律实验结果相符合。 展开更多
关键词 免疫系统 昼夜节律 T细胞再循环 皮质醇
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再循环T细胞昼夜节律现象的数学模型 被引量:1
2
作者 李方廷 漆安慎 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第5期670-676,共7页
根据人体和小鼠免疫细胞昼夜节律实验结果 ,提出皮质类激素对淋巴结和脾脏中T细胞再循环产生不同作用的假设 ,建立了皮质类激素作用下的T细胞在不同外周淋巴器官 (淋巴结、脾脏 )与血液之间再循环过程的数学模型 ,讨论了皮质类激素作用... 根据人体和小鼠免疫细胞昼夜节律实验结果 ,提出皮质类激素对淋巴结和脾脏中T细胞再循环产生不同作用的假设 ,建立了皮质类激素作用下的T细胞在不同外周淋巴器官 (淋巴结、脾脏 )与血液之间再循环过程的数学模型 ,讨论了皮质类激素作用的强度、有关参量的取值范围和模型对参数的依赖性 .模型能够解释参与再循环的T细胞在淋巴结、脾脏与血液中的稳定振荡行为 。 展开更多
关键词 免疫细胞 昼夜节律 T细胞再循环 皮质类激素 数学模型
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再循环B淋巴细胞昼夜节律现象的数学模型
3
作者 李方廷 漆安慎 《北京师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期321-326,共6页
根据免疫系统中参与再循环过程的B淋巴细胞昼夜节律现象的实验结果 ,提出皮质类激素作用于B淋巴细胞再循环过程的假设 ,建立了皮质类激素作用下的B细胞在骨髓、外周淋巴器官 (淋巴结、脾脏 )与血液之间再循环过程的数学模型 ,讨论了皮... 根据免疫系统中参与再循环过程的B淋巴细胞昼夜节律现象的实验结果 ,提出皮质类激素作用于B淋巴细胞再循环过程的假设 ,建立了皮质类激素作用下的B细胞在骨髓、外周淋巴器官 (淋巴结、脾脏 )与血液之间再循环过程的数学模型 ,讨论了皮质类激素作用的强度及有关参量的取值范围及模型对参数的依赖性 .模型能够解释参与再循环的B细胞在骨髓、淋巴结、脾脏和血液中的稳定振荡行为 ,而且对皮质激素在骨髓与外周血中B细胞迁移过程中的作用进行了定量研究 .理论结果与实验结果基本一致 . 展开更多
关键词 免疫系统 昼夜节律 再循环B淋巴细胞 皮质激素 数学模型 稳定振荡 免疫应答
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胸腺内双阴胸腺细胞重建动态的数学模型
4
作者 李方廷 漆安慎 《北京师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期649-653,共5页
根据小鼠的胸腺细胞实验数据 ,建立了描述胸腺细胞 (thymocyte)发育过程的数学模型 .该模型考虑了胸腺细胞与胸腺基质细胞 (thymicstromalcell,TSC)之间的相互作用 ,能够模拟CD4 - CD8- DN细胞重建动态及正常小鼠胸腺细胞的发育过程 .... 根据小鼠的胸腺细胞实验数据 ,建立了描述胸腺细胞 (thymocyte)发育过程的数学模型 .该模型考虑了胸腺细胞与胸腺基质细胞 (thymicstromalcell,TSC)之间的相互作用 ,能够模拟CD4 - CD8- DN细胞重建动态及正常小鼠胸腺细胞的发育过程 .研究表明 ,模型中的一些参数应该是含有时间延迟的 .通过模型研究了胸腺细胞与TSC之间亲和力在胸腺选择过程中的阳性与阴性选择中的差异 .理论预言与实验数据基本一致 . 展开更多
关键词 胸腺基质细胞 数学模型 细胞重建
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胰岛炎症导致的2型糖尿病发病过程的动力学模型及治疗策略 被引量:12
5
作者 林智立 雷蕾 +1 位作者 李长润 李方廷 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第2期199-208,共10页
为了揭示胰岛炎症导致2型糖尿病发生发展的机制,建立胰岛β细胞和巨噬细胞相互作用的数学模型,包括IL-1β的产生和巨噬细胞的浸润过程,研究高浓度葡萄糖和游离脂肪酸对IL-1β的共同作用,揭示胰岛炎症在2型糖尿病进程中的动力学机理。通... 为了揭示胰岛炎症导致2型糖尿病发生发展的机制,建立胰岛β细胞和巨噬细胞相互作用的数学模型,包括IL-1β的产生和巨噬细胞的浸润过程,研究高浓度葡萄糖和游离脂肪酸对IL-1β的共同作用,揭示胰岛炎症在2型糖尿病进程中的动力学机理。通过对模型中动力学参数的敏感性分析,提出针对不同患病情况的可能的优化治疗策略。 展开更多
关键词 2型糖尿病 胰岛炎症 动力学模型 巨噬细胞浸润 IL-1Β
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前列腺癌的演化动力学模型以及治疗策略的优化
6
作者 高鑫 史书毓 李方廷 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第6期987-994,共8页
前列腺癌是男性常见的恶性肿瘤。临床上常用的干扰雄激素的治疗药物是阿比特龙,但长期高剂量的阿比特龙治疗常导致患者前列腺肿瘤细胞进化至药物抵抗。为了揭示前列腺癌发展的动力学机制,本文引入给药剂量因素,建立二变量的肿瘤演化定... 前列腺癌是男性常见的恶性肿瘤。临床上常用的干扰雄激素的治疗药物是阿比特龙,但长期高剂量的阿比特龙治疗常导致患者前列腺肿瘤细胞进化至药物抵抗。为了揭示前列腺癌发展的动力学机制,本文引入给药剂量因素,建立二变量的肿瘤演化定量模型。通过分析固定给药和适应性给药策略的动力学性质,并绘制势能景观图,从动力学角度展示适应性给药策略的优势,揭示高剂量药物导致体系演化为不可逆药物抵抗状态的动力学机理。此外还构建治疗策略的评分体系,以便优化治疗策略。 展开更多
关键词 前列腺癌 阿比特龙 药物抵抗 动力学模型 策略优化
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芽殖酵母细胞周期过程不同时期的定量观测
7
作者 张志温 李方廷 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第4期609-614,共6页
在芽殖酵母中构建CDC10-mCherry和SPC42-mCherry荧光蛋白,作为酵母细胞周期不同时期的报告系统。根据酵母细胞中芽环(CDC10-mCherry)的产生和消失以及纺锤体极体(SPC42-mCherry)的复制和分离,可以测量细胞周期中G1期、S期、EarlyM期和La... 在芽殖酵母中构建CDC10-mCherry和SPC42-mCherry荧光蛋白,作为酵母细胞周期不同时期的报告系统。根据酵母细胞中芽环(CDC10-mCherry)的产生和消失以及纺锤体极体(SPC42-mCherry)的复制和分离,可以测量细胞周期中G1期、S期、EarlyM期和LateM期的时间长度。在此报告系统的基础上,分别构建S期细胞周期蛋白CLB5-GFP和M期细胞周期蛋白CLB2-GFP菌株,实现单细胞观测,检验报告系统工作的稳定性和准确性。该报告系统可作为研究酵母细胞周期不同时期时间长度等定量生物学问题的背景菌株。 展开更多
关键词 芽殖酵母 单细胞观测 细胞周期 时间标记
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芽殖酵母S期检验点通路定量生物学研究
8
作者 贾勇强 李方廷 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第5期805-811,共7页
构建由羟基脲(HU)诱导的芽殖酵母S期检验点激活和调控DNA复制的理论模型。模拟结果表明,对于不同浓度HU的刺激,检验点激活和调控系统的反应存在霍普夫分岔,其中的分岔点对应于检验点激活的HU阈值浓度;而且发现该通路的激活过程在较大参... 构建由羟基脲(HU)诱导的芽殖酵母S期检验点激活和调控DNA复制的理论模型。模拟结果表明,对于不同浓度HU的刺激,检验点激活和调控系统的反应存在霍普夫分岔,其中的分岔点对应于检验点激活的HU阈值浓度;而且发现该通路的激活过程在较大参数范围内会出现振荡现象。同时,利用构建了Rnr3-GFP荧光蛋白的酵母菌株,在不同的HU浓度刺激下,测量酵母菌Rnr3蛋白多时间点的表达水平,得到酵母菌对HU浓度的实验反应阈值,与理论结果相符合。这一工作构建了酵母S期检验点定量研究的基本框架,可为进一步的理论和实验研究提供线索。 展开更多
关键词 S期检验点 自磷酸化 双稳态 霍普夫分岔
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Dynamical Analysis of Protein Regulatory Network in Budding Yeast Nucleus
9
作者 李方廷 贾珣 《Chinese Physics Letters》 SCIE CAS CSCD 2006年第8期2307-2310,共4页
Recent progresses in the protein regulatory network of budding yeast Saccharomyces cerevisiae have provided a global picture of its protein network for further dynamical research. We simplify and modularize the protei... Recent progresses in the protein regulatory network of budding yeast Saccharomyces cerevisiae have provided a global picture of its protein network for further dynamical research. We simplify and modularize the protein regulatory networks in yeast nucleus, and study the dynamical properties of the core 37-node network by a Boolean network model, especially the evolution steps and final fixed points. Our simulation results show that the number of fixed points N(k) for a given size of the attraction basin k obeys a power-law distribution N(k) χ k^-2.024. The yeast network is more similar to a scale-free network than a random network in the above dynamical properties. 展开更多
关键词 CELL-CYCLE TRANSCRIPTIONAL REGULATION GENES
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莒县河滩杨树丰产林受旱情况调查
10
作者 李环子 郭同竹 +4 位作者 陈瑞荣 尉春平 李方廷 陈冬 李忠臣 《山东林业科技》 北大核心 1993年第1期21-23,共3页
1992年上半年,是莒县有气象资料记载以来旱情最严重的一段时间。据气象站资料,1991年10~12月及1992年1~6月共降水102.1mm,是历年同期平均降水量的32.5%,而同期蒸发量达到826.0mm。尤其是杨树进入生长季节后的5~6月份,仅降水22.5mm... 1992年上半年,是莒县有气象资料记载以来旱情最严重的一段时间。据气象站资料,1991年10~12月及1992年1~6月共降水102.1mm,是历年同期平均降水量的32.5%,而同期蒸发量达到826.0mm。尤其是杨树进入生长季节后的5~6月份,仅降水22.5mm。全县河水断流,库塘干涸,地下水位平均下降2~5m。许多河滩上的杨树丰产林落叶严重,甚至有的小枝干枯,生长受到严重影响。为了解河滩土壤、水分条件对杨树生长的影响。 展开更多
关键词 杨树 干旱 河滩
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酵母蛋白质网络的动力学性质 被引量:1
11
作者 李方廷 吕莹 +2 位作者 龙涛 欧阳颀 汤超 《物理》 CAS 北大核心 2003年第10期678-681,共4页
蛋白质 -蛋白质、蛋白质 -DNA相互作用网络决定了细胞中各种关键功能的执行 .基于芽殖酵母 (bud dingyeastsaccharomycescerevisiae)的蛋白质 -蛋白质相互作用网络数据和相关的实验文献 ,我们建立了调控细胞周期和生命周期 (cellcyclean... 蛋白质 -蛋白质、蛋白质 -DNA相互作用网络决定了细胞中各种关键功能的执行 .基于芽殖酵母 (bud dingyeastsaccharomycescerevisiae)的蛋白质 -蛋白质相互作用网络数据和相关的实验文献 ,我们建立了调控细胞周期和生命周期 (cellcycleandlifecycle)的蛋白质网络 ,并利用离散模型研究了该网络的动力学性质 .研究表明 :细胞周期网络的动力学性质具有很强的稳定性 ,约 94 %的蛋白质初态将演化到对应于生物学G1基态的稳定态 ,使其成为惟一的全局吸引点 ;同时 ,绝大多数的初态的演化路径都通过由G1激发态到G1基态的细胞周期演化路径 ,使细胞周期路径成为全局性的“吸引” 展开更多
关键词 蛋白质网络动力学 细胞周期过程 芽殖酵母 离散模型 细胞周期 生物物理学
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生物系统中的非线性现象
12
作者 李方廷 欧阳颀 《物理》 CAS 北大核心 2007年第2期131-135,共5页
文章通过用非线性科学的基本概念与系统方法分析了芽殖酵母细胞周期网络的动力学行为,说明非线性科学在定量研究生命过程所可能起到的重要作用,同时说明非线性科学现有的分析手段在研究生命系统中的局限性.这样利用非线性动力学研究生... 文章通过用非线性科学的基本概念与系统方法分析了芽殖酵母细胞周期网络的动力学行为,说明非线性科学在定量研究生命过程所可能起到的重要作用,同时说明非线性科学现有的分析手段在研究生命系统中的局限性.这样利用非线性动力学研究生物系统的动力学问题,不但可以为系统生物学的研究提供强大的数学工具,同时也可以推动非线性科学本身的发展.这项研究从另一个角度显示了交叉学科的生命力. 展开更多
关键词 网络动力学 非线性动力学 芽殖酵母 细胞周期
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封面说明
13
作者 李方廷 《物理》 CAS 北大核心 2004年第8期557-557,共1页
关键词 芽殖酵母 细胞周期 DNA复制 纺锤体
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2型糖尿病发病过程中胰岛炎症的动力学机理 被引量:15
14
作者 雷蕾 林智立 +3 位作者 王琳琳 赵德 王友 李方廷 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第35期4139-4148,共10页
2型糖尿病是一种以慢性高血糖为主要特征的代谢性疾病,其发病机制复杂.近年来的研究发现,糖脂代谢紊乱造成的慢性炎症可引起机体胰岛损伤,与2型糖尿病发生发展密切相关.但是,由代谢紊乱诱发的胰岛炎症如何发展并最终导致胰岛功能不可逆... 2型糖尿病是一种以慢性高血糖为主要特征的代谢性疾病,其发病机制复杂.近年来的研究发现,糖脂代谢紊乱造成的慢性炎症可引起机体胰岛损伤,与2型糖尿病发生发展密切相关.但是,由代谢紊乱诱发的胰岛炎症如何发展并最终导致胰岛功能不可逆性损伤的机制尚未完全阐明.本研究,首先选取自发性2型糖尿病GK大鼠和转基因动物IDOL小鼠,建立了胰岛炎症实验模型并对相关炎症因子变化进行检测,结果显示巨噬细胞与胰岛炎症进程相关.随后建立相应的定量数学模型描述胰岛β细胞和巨噬细胞相互作用,理论模型的结果表明,胰岛β细胞和巨噬细胞之间的正反馈回路可能导致IL-1β的激活过程存在不可逆双稳态和磁滞回线效应,并导致胰岛炎症的不可逆性发展.本研究提出了胰岛炎症过程中动力学机理,希望能够为2型糖尿病发病机制的深入研究和治疗药物的研发提供新的思路和有益的帮助. 展开更多
关键词 2型糖尿病 胰岛炎症 糖毒性 脂毒性 巨噬细胞浸润
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