山羊ESR1·TENM1和THEM4多态性及其与繁殖性状相关性研究

[目的]分析ESR1、TENM1和THEM4单核苷酸多态性(SNPs)与山羊繁殖性状的相关性。[方法]采用MassARRAY SNP分型技术对ESR1、TENM1和THEM4 SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊3个群体中的遗传学特征,并对其多态性与山羊繁殖性状(产羔数、初生窝重、断奶窝重)进行相关性分析。[结果]群体遗传学分析结果表明,ESR1 g.76097125C>T位点在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为低度多态(PIC<0.25),在云上黑山羊中为中度多态(0.25<PIC<0.50);ESR1 g.76139051A>G在云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊中为中度多态(0.25<PIC<0.50)。TENM1 g.17333655C>T和g.17372494A>G位点在3个山羊群体中表现为低度多态(PIC<0.25);TENM 1 g.17236451G>C和g.17586866T>C位点在3个山羊群体中的多态性(PIC)为0.05~0.36。THEM4 g.101275605G>A位点在3个山羊群体中为低度多态(PIC<0.25)。卡方检验结果表明,ESR1 g.76139051 A>G、THEM4 g.101275605G>A位点在云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。相关分析结果表明,ESR1 g.76097125C>T位点CT和TT型山羊的初生窝重显著高于CC型(P<0.05);TENM1 g.17236451G>C位点GC型山羊的产羔数和断奶窝重显著高于GG型(P<0.05),g.17333655C>T位点CC型山羊产羔数显著高于CT型(P<0.05);其余位点多态性与云上黑山羊产羔数、初生窝重和断奶窝重无显著相关(P>0.05)。[结论]TENM1 g.17236451G>C位点可作为云上黑山羊产羔数和断奶窝重选择的潜在分子标记;TENM1 g.17333655C>T位点可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记;ESR1 g.76097125C>T位点可作为云上黑山羊初生窝重选择的潜在分子标记。该研究结果可为山羊分子育种和标记辅助选择提供理论基础。

山羊EGR4、KDM4C和KDM6A多态性及其与繁殖性能关联分析

本研究旨在分析EGR4、KDM4C和KDM6A单核苷酸多态性(SNPs)与山羊繁殖性状的关联。利用MassARRAY?SNP分型技术对EGR4、KDM4C和KDM6A的SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传学特征,并将其多态性与繁殖性状表型(产羔数、初生窝重、断奶窝重)进行关联分析。群体遗传学结果表明,EGR4 g.11029053G>T和g.11029600T>A位点在云上黑山羊中为中度多态(0.25 A位点在3种山羊群体中为低度多态(PIC<0.25);KDM4C g.37764228T>A位点在济宁青山羊中为中度多态(0.25 A和g.37768026C>G位点在3种山羊群体中为低度多态(PIC<0.25);KDM6A g.27177505C>A在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为中度多态(0.25 A、g.11029053G>T和g.11029600T>A位点在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);KDM4C g.37764228T>A、g.37767773T>A和g.37768026C>G在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);KDM6A g.27102554T>A和g.27177505C>A位点分别在辽宁绒山羊中和济宁青山羊中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05),在云上黑山羊中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,在云上黑山羊中EGR4 g.11029600T>A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(P<0.05);KDM4C g.37764228T>A位点TT和TA型的产羔数、初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(P<0.05);KDM6A g.27177505C>A位点CC型产羔数显著高于CA型和AA型(P<0.05),g.27102554T>A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(P<0.05)。综上所述,EGR4 g.11029600T>A、KDM4C g.37764228T>A和KDM6A g.27102554T>A位点可作为云上黑山羊窝重选择的潜在分子标记;KDM4Cg.37764228T>A和KDM6Ag.27177505C>A位点可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记。

山羊AMH和AMHR2基因多态性及其与产羔数关联分析

本研究旨在分析抗苗勒氏激素(AMH)和抗苗勒氏激素II型受体(AMHR2)基因单核苷酸多态性(SNPs)与山羊产羔性状的关联性。通过MassARRAY?SNP分型技术对AMH基因和AMHR2基因SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传学特征,并将其多态性与产羔性能(产羔数、初生窝重、断奶窝重)进行关联分析。群体遗传学结果表明,AMH基因g.89172108T>G和AMHR2基因g.26334739A>G在3个群体中为中度多态(0.25T在3种山羊中为低度多态(PIC<0.25)。卡方检验显示,AMH基因g.89172108T>G在济宁青山羊中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05),在云上黑山羊和辽宁绒山羊中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);AMHR2基因g.26334739A>G在辽宁绒山羊、g.26335365C>T在济宁青山羊中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05),其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,云上黑山羊中,AMH基因和AMHR2基因候选位点均对产羔数无显著影响,候选位点对初生窝重和断奶窝重均无显著影响。综上所述,AMH基因和AMHR2基因的候选位点不适合作为山羊产羔数选择的潜在分子标记,也不适合窝重选择。

山羊DNMT3B和KHDRBS2多态性及其与繁殖性能关联分析

本研究旨在分析DNMT3B和KHDRBS2单核苷酸多态性(SNPs)与山羊繁殖性状的关联。通过MassARRAY>SNP分型技术对DNMT3B和KHDRBS2SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传学特征,并将其多态性与繁殖性能(产羔数、初生窝重和断奶窝重)进行关联分析。群体遗传学分析表明,DNMT3B g.61480806G>A位点在云上黑山羊中为中度多态(0.25<PIC<0.5),在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为低度多态(PIC<0.25)-DNMT3B g.61491787C>T在云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊中均为低度多态(PIC<0.25);卡方适合性检验表明g.61480806G>A和g.61491787C>T两个位点在云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05).KHDRBS2 g.48441364C>T位点在3种山羊中均为中度多态(0.25<PIC<0.5),KHDRBS2 g.47872502C>T、g.48441325T>C和g.48610246G>C位点在3种山羊中均为低度多态(PIC<0.25);卡方检验表明,KHDRBS2g.48610246G>C位点在3个群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)KHDRBS2 g.47872502C>T、g.48441325T>C和g.48441364C>T 3个位点在云上黑山羊中处于Hardy-Weinberg平衡状态(.P>0.05)关联分析结果表明,DNMT3Bg.61491787C>T位点TC型的初生窝重和断奶窝重显著高于TT型(P<0.05);KHDRBS2 g.47872502C>T位点CC型的产羔数显著高于CT型(P<0.05),g.48441364C>T位点CC型产羔数显著高于CT型和TT型(P<0.05)综上所述,DNMT3Bg.61491787C>T位点或可作为筛选云上黑山羊初生窝重和断奶窝重的潜在分子标记,KHDRBS2 g.47872502C>T和g.48441364C>T位点或可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记。

山羊ADCY1和CYM基因多态性及其与产羔数关联分析

[目的]分析腺苷酸环化酶1(ADCY1)和胰凝乳蛋白酶(CYM)基因单核苷酸多态性(SNPs)与山羊产羔性状的关联。[方法]通过MassARRAY SNP分型技术对ADCY1和CYM基因SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传学特征,并将其多态性与产羔性能(产羔数、初生窝重、断奶窝重)进行关联分析。[结果]群体遗传学结果表明,ADCY1基因4个突变在云上黑山羊、济宁青山羊、辽宁绒山羊中均为低度多态(PIC≤0.25);CYM基因g.87624254G>A和g.87627082G>A 2个位点在3种山羊中均为中度多态(0.25<PIC<0.50);卡方检验显示,除ADCY1 g.43996583C>T在辽宁绒山羊中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05),ADCY1基因其余位点和CYM基因g.87624269 G>A、g.87627082G>A 2个位点在3个群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,在云上黑山羊中ADCY1基因g.43979904G>A、g.43974472G>A,CYM基因g.87624254G>A位点多态性与产羔数存在显著关联(P<0.05);ADCY1基因g.43996550G>A、g.43996583C>T,CYM基因g.87624254G>A、g.87627082G>A位点多态性与初生窝重存在显著关联(P<0.05)。[结论]ADCY1基因g.43974472G>A和g.43979904G>A位点可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记。ADCY1基因g.43996550G>A、g.43996583C>T位点,CYM基因g.87627082G>A位点可作为云上黑山羊初生窝重选择的潜在分子标记;CYM基因g.87624254G>A位点可作为云上黑山羊窝重选择的潜在分子标记。