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题名条纹斑竹鲨不同组织线粒体DNA拷贝数差异分析
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作者
李明僧
张耀仁
徐胜勇
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机构
浙江海洋大学水产学院
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出处
《浙江海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
2024年第5期453-458,共6页
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基金
国家自然科学基金项目(32200413)。
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文摘
线粒体DNA(mitochondrial DNA, mtDNA)拷贝数在不同组织器官中存在一定差异,并与多种重要疾病的发生密切相关。mtDNA拷贝数的稳定性对于维持线粒体功能和细胞代谢至关重要,因此,准确监测mtDNA拷贝数对生物学及生物医学研究具有重要意义。然而,目前常用的分析方法只能对mtDNA拷贝数进行相对定量分析,无法准确评估mtDNA含量。本研究尝试利用高通量测序数据和生物信息学分析软件NOVOPlasty建立了一种定量评估mtDNA拷贝数的方法,并采用该方法对条纹斑竹鲨肌肉与血液组织样品中mtDNA拷贝数开展比较分析。结果表明血液组织的mtDNA含量明显少于肌肉组织的含量,1×全基因组测序深度时肌肉组织的mtDNA拷贝数均值为339,而血液组织约为15,提示肌肉细胞较血细胞的mtDNA含量高约22倍。研究结果表明条纹斑竹鲨肌肉和血液的mtDNA含量存在明显的组织特异性,同时初步验证了该研究建立的mtDNA拷贝数定量分析方法的可行性。该研究可为mtDNA含量相关的生物医学和生理生态研究提供参考资料。
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关键词
线粒体DNA拷贝数
条纹斑竹鲨
定量分析
组织特异性
高通量测序
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Keywords
mitochondrial DNA copy number
Chiloscyllium plagiosum
quantitative analysis
tissue specificity
high-throughput sequencing
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分类号
Q173
[生物学—水生生物学]
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