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利用全基因组测序技术鉴定宁夏彭阳县利木赞牛的群体遗传结构
1
作者
何亮宏
李昱姗
+3 位作者
邓占钊
王楠
梁小军
雷初朝
《中国牛业科学》
2024年第4期1-5,共5页
[目的]通过全基因组测序技术分析宁夏彭阳县11头利木赞牛的群体遗传结构及遗传多样性,以揭示其遗传背景和血统纯度。[方法]利用全基因组重测序、主成分分析、系统发育树构建及祖先成分分析等生物信息学方法。[结果]在宁夏彭阳县11头利...
[目的]通过全基因组测序技术分析宁夏彭阳县11头利木赞牛的群体遗传结构及遗传多样性,以揭示其遗传背景和血统纯度。[方法]利用全基因组重测序、主成分分析、系统发育树构建及祖先成分分析等生物信息学方法。[结果]在宁夏彭阳县11头利木赞牛基因组中,10头利木赞牛含有东亚普通牛、欧洲普通牛与中国瘤牛血统,其中欧洲普通牛占比最大,平均约占60%,东亚普通牛血统平均约占28%,中国瘤牛血统平均约占12%,表明10头利木赞牛与宁夏地方黄牛群体秦川牛与固原牛存在不同程度的杂交;还有1头为纯种利木赞牛。[结论]利用全基因组测序技术和生物信息学方法对宁夏彭阳县11头利木赞牛进行鉴定,其中1头为纯种利木赞牛,其余10头均为杂种利木赞牛。
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关键词
利木赞牛
全基因组测序
群体遗传结构
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职称材料
不同吞咽任务时老年人舌运动特征的超声学研究
被引量:
2
2
作者
黄昭莹
招少枫
+3 位作者
林锦烈
王楚婷
李昱姗
邓学
《中华物理医学与康复杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期69-72,共4页
目的比较不同吞咽任务时老年健康个体舌运动的超声影像学特征。方法招募56例健康老年受试者(男28例,女28例),要求其完成唾液吞咽、5 ml水吞咽以及15 ml水吞咽任务。通过B+M型超声采集受试者吞咽过程中舌运动特征,提取舌上升期(IIa期)的...
目的比较不同吞咽任务时老年健康个体舌运动的超声影像学特征。方法招募56例健康老年受试者(男28例,女28例),要求其完成唾液吞咽、5 ml水吞咽以及15 ml水吞咽任务。通过B+M型超声采集受试者吞咽过程中舌运动特征,提取舌上升期(IIa期)的垂直运动幅度、速率和舌运动时长参数,对不同任务间和性别间的舌运动数据进行统计学分析。结果唾液吞咽时的舌运动幅度显著低于5 ml水吞咽和15 ml水吞咽,差异均有统计学意义(P<0.05),5 ml水吞咽时的舌运动幅度显著低于15 ml水吞咽,差异亦有统计学意义(P<0.05)。5 ml和15 ml水吞咽时的舌运动速率显著快于唾液吞咽,差异均有统计学意义(P<0.001)。完成3种吞咽任务时,IIa期男性的舌运动幅度均大于女性,但差异均无统计学意义(P>0.05);IIa期男性的舌运动速率均快于女性,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论B+M型超声成像的舌垂直运动幅度和速率可以反映老年人不同吞咽任务时舌运动学特征,并可能作为吞咽障碍临床超声检查中有意义的指标。
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关键词
吞咽
舌运动
超声
老年人
吞咽障碍
原文传递
威宁牛和关岭牛Y染色体基因组遗传多样性研究
3
作者
吴道义
李昱姗
+4 位作者
阎卉萱
王明进
曾继晶
雷初朝
马金萍
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
2024年第19期34-37,45,共5页
为了从全基因组水平上探究威宁牛与关岭牛Y染色体基因组遗传多样性及其父系起源,试验利用生物信息学方法对10头关岭牛公牛与20头威宁牛公牛进行全基因组重测序,并对其Y染色体雄性特异区(MSY区)进行扫描与分析,对获得的Y染色体基因组数...
为了从全基因组水平上探究威宁牛与关岭牛Y染色体基因组遗传多样性及其父系起源,试验利用生物信息学方法对10头关岭牛公牛与20头威宁牛公牛进行全基因组重测序,并对其Y染色体雄性特异区(MSY区)进行扫描与分析,对获得的Y染色体基因组数据进行单核苷酸多态性(SNPs)位点分析,计算单倍型多样度和核苷酸多样度,利用MEGA 11-64软件中的NJ法构建Y染色体基因组系统发育树,并用Network软件绘制单倍型网络图。结果表明:共获得2 553个Y-SNPs位点。威宁牛和关岭牛的Y染色体基因组单倍型多样度分别为0.947±0.034和0.978±0.054,核苷酸多样度分别为0.322±0.045和0.020±0.004。10头关岭牛共定义7种单倍型,均属Y3单倍型组,具有Y3a和Y3b 2种亚单倍型组,其中Y3a为优势亚单倍型组,占比为90%,Y3b占比为10%。20头威宁牛共定义12种单倍型,属于Y1、Y2和Y3单倍型组,其中Y1占比为10%,Y2a占比为25%,Y3a(优势亚单倍型组)占比为45%,Y3b占比为20%。10头关岭牛与20头威宁牛均主要为瘤牛血统,且优势亚单倍型组一致,但威宁牛父系起源较为复杂。说明两个黄牛品种威宁牛与关岭牛均具有较丰富的父系遗传多样性,父系遗传结构有明显差异。
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关键词
威宁牛
关岭牛
Y染色体基因组
遗传多样性
父系起源
原文传递
题名
利用全基因组测序技术鉴定宁夏彭阳县利木赞牛的群体遗传结构
1
作者
何亮宏
李昱姗
邓占钊
王楠
梁小军
雷初朝
机构
彭阳县畜牧技术推广服务中心
西北农林科技大学动物科技学院
宁夏农林科学院动物科学研究所
出处
《中国牛业科学》
2024年第4期1-5,共5页
基金
国家肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37)。
文摘
[目的]通过全基因组测序技术分析宁夏彭阳县11头利木赞牛的群体遗传结构及遗传多样性,以揭示其遗传背景和血统纯度。[方法]利用全基因组重测序、主成分分析、系统发育树构建及祖先成分分析等生物信息学方法。[结果]在宁夏彭阳县11头利木赞牛基因组中,10头利木赞牛含有东亚普通牛、欧洲普通牛与中国瘤牛血统,其中欧洲普通牛占比最大,平均约占60%,东亚普通牛血统平均约占28%,中国瘤牛血统平均约占12%,表明10头利木赞牛与宁夏地方黄牛群体秦川牛与固原牛存在不同程度的杂交;还有1头为纯种利木赞牛。[结论]利用全基因组测序技术和生物信息学方法对宁夏彭阳县11头利木赞牛进行鉴定,其中1头为纯种利木赞牛,其余10头均为杂种利木赞牛。
关键词
利木赞牛
全基因组测序
群体遗传结构
Keywords
Limousin cattle
whole genome sequencing
population genetic structure
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
不同吞咽任务时老年人舌运动特征的超声学研究
被引量:
2
2
作者
黄昭莹
招少枫
林锦烈
王楚婷
李昱姗
邓学
机构
中山大学附属第八医院(深圳福田)康复医学科
出处
《中华物理医学与康复杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期69-72,共4页
基金
国家自然科学基金青年项目(81601966)
深圳市基础研究资助项目(JCYJ20190808102001750)
深圳市福田区卫生公益性科研项目(FTWS2019007)。
文摘
目的比较不同吞咽任务时老年健康个体舌运动的超声影像学特征。方法招募56例健康老年受试者(男28例,女28例),要求其完成唾液吞咽、5 ml水吞咽以及15 ml水吞咽任务。通过B+M型超声采集受试者吞咽过程中舌运动特征,提取舌上升期(IIa期)的垂直运动幅度、速率和舌运动时长参数,对不同任务间和性别间的舌运动数据进行统计学分析。结果唾液吞咽时的舌运动幅度显著低于5 ml水吞咽和15 ml水吞咽,差异均有统计学意义(P<0.05),5 ml水吞咽时的舌运动幅度显著低于15 ml水吞咽,差异亦有统计学意义(P<0.05)。5 ml和15 ml水吞咽时的舌运动速率显著快于唾液吞咽,差异均有统计学意义(P<0.001)。完成3种吞咽任务时,IIa期男性的舌运动幅度均大于女性,但差异均无统计学意义(P>0.05);IIa期男性的舌运动速率均快于女性,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论B+M型超声成像的舌垂直运动幅度和速率可以反映老年人不同吞咽任务时舌运动学特征,并可能作为吞咽障碍临床超声检查中有意义的指标。
关键词
吞咽
舌运动
超声
老年人
吞咽障碍
分类号
R49 [医药卫生—康复医学]
原文传递
题名
威宁牛和关岭牛Y染色体基因组遗传多样性研究
3
作者
吴道义
李昱姗
阎卉萱
王明进
曾继晶
雷初朝
马金萍
机构
毕节市畜牧兽医科学研究所
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
2024年第19期34-37,45,共5页
基金
国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37)
贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑[2021]一般153,黔科合服企[2021]12-03号)
贵州省第七批人才基地项目(黔人领发[2020]1号)。
文摘
为了从全基因组水平上探究威宁牛与关岭牛Y染色体基因组遗传多样性及其父系起源,试验利用生物信息学方法对10头关岭牛公牛与20头威宁牛公牛进行全基因组重测序,并对其Y染色体雄性特异区(MSY区)进行扫描与分析,对获得的Y染色体基因组数据进行单核苷酸多态性(SNPs)位点分析,计算单倍型多样度和核苷酸多样度,利用MEGA 11-64软件中的NJ法构建Y染色体基因组系统发育树,并用Network软件绘制单倍型网络图。结果表明:共获得2 553个Y-SNPs位点。威宁牛和关岭牛的Y染色体基因组单倍型多样度分别为0.947±0.034和0.978±0.054,核苷酸多样度分别为0.322±0.045和0.020±0.004。10头关岭牛共定义7种单倍型,均属Y3单倍型组,具有Y3a和Y3b 2种亚单倍型组,其中Y3a为优势亚单倍型组,占比为90%,Y3b占比为10%。20头威宁牛共定义12种单倍型,属于Y1、Y2和Y3单倍型组,其中Y1占比为10%,Y2a占比为25%,Y3a(优势亚单倍型组)占比为45%,Y3b占比为20%。10头关岭牛与20头威宁牛均主要为瘤牛血统,且优势亚单倍型组一致,但威宁牛父系起源较为复杂。说明两个黄牛品种威宁牛与关岭牛均具有较丰富的父系遗传多样性,父系遗传结构有明显差异。
关键词
威宁牛
关岭牛
Y染色体基因组
遗传多样性
父系起源
Keywords
Weining cattle
Guanling cattle
Y chromosome genome
genetic diversity
paternal origin
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
Q813.4 [生物学—生物工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用全基因组测序技术鉴定宁夏彭阳县利木赞牛的群体遗传结构
何亮宏
李昱姗
邓占钊
王楠
梁小军
雷初朝
《中国牛业科学》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
不同吞咽任务时老年人舌运动特征的超声学研究
黄昭莹
招少枫
林锦烈
王楚婷
李昱姗
邓学
《中华物理医学与康复杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
原文传递
3
威宁牛和关岭牛Y染色体基因组遗传多样性研究
吴道义
李昱姗
阎卉萱
王明进
曾继晶
雷初朝
马金萍
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
2024
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