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金黄色葡萄球菌Cna基因的生物信息学分析及原核表达
1
作者
黄怡婕
褚诗钒
+16 位作者
陈智豪
许毅
叶锦津
傅子玲
黄悦
金枫影
陈焰焰
冯丹羽
陈其冠
李晨蕙
刘晓罡
姚俊杰
陈淑倩
计敏
李佳佳
何文迪
陈新江
《生物技术》
CAS
2020年第4期335-340,317,共7页
[目的]对金黄色葡萄球菌的Cna基因进行生物信息学分析,并进行克隆和原核表达,为金黄色葡萄球菌重组疫苗的研发提供参考数据。[方法]使用Protparam、PSORT、Signal P-5.0、TMpred、Net Phos 3.1 Server、PSIPRED、SWISSMODEL等在线生物...
[目的]对金黄色葡萄球菌的Cna基因进行生物信息学分析,并进行克隆和原核表达,为金黄色葡萄球菌重组疫苗的研发提供参考数据。[方法]使用Protparam、PSORT、Signal P-5.0、TMpred、Net Phos 3.1 Server、PSIPRED、SWISSMODEL等在线生物信息软件,分析Cna蛋白的理化性质、亚细胞定位、跨膜区域、磷酸化修饰位点、二级结构和三维结构。以基因组DNA为模板扩增Cna基因编码N1-N2子域的片段,扩增产物经酶切回收后与载体pET-32a(+)相连接,构建重组表达质粒,将该重组质粒转化E.coli TG1,经菌落PCR、测序鉴定后,增菌培养并抽提质粒,再转化E.coli BL21(DE3),经IPTG诱导表达后进行SDS-PAGE分析。[结果]Cna蛋白由1 183个氨基酸残基组成,相对分子质量为133 006.82 Da,等电点为5.89,负电荷氨基酸残基数为180个,正电荷氨基酸残基数为167个,分子式:C5863H9241-N1569O1936S10,原子总数18 619个,是一种稳定的亲水蛋白质,定位于细胞膜上,第4~23、1 158~1 177位氨基酸残基分别形成一个典型的跨膜区,具有148个潜在的磷酸化修饰位点,二级结构中无规则卷曲和β折叠占较大比例,三维结构与二级结构预测结果相符。成功构建了重组表达质粒pET-32a(+)-Cna,经IPTG诱导后重组蛋白(N1-N2子域)获得了表达,重组蛋白相对分子质量为52.1 kDa。[结论]Cna基因的生物信息学分析及该基因的成功表达,为研究Cna蛋白在免疫保护中的作用奠定了一定的基础。
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关键词
金黄色葡萄球菌
Cna基因
生物信息学
原核表达
Cna蛋白
原文传递
题名
金黄色葡萄球菌Cna基因的生物信息学分析及原核表达
1
作者
黄怡婕
褚诗钒
陈智豪
许毅
叶锦津
傅子玲
黄悦
金枫影
陈焰焰
冯丹羽
陈其冠
李晨蕙
刘晓罡
姚俊杰
陈淑倩
计敏
李佳佳
何文迪
陈新江
机构
宁波卫生职业技术学院医学技术学院
出处
《生物技术》
CAS
2020年第4期335-340,317,共7页
基金
浙江省教育厅科研项目(Y201941484)
浙江省教育科学规划课题(2019SCG114)
宁波市教育科学规划重点课题(2018YZD035)。
文摘
[目的]对金黄色葡萄球菌的Cna基因进行生物信息学分析,并进行克隆和原核表达,为金黄色葡萄球菌重组疫苗的研发提供参考数据。[方法]使用Protparam、PSORT、Signal P-5.0、TMpred、Net Phos 3.1 Server、PSIPRED、SWISSMODEL等在线生物信息软件,分析Cna蛋白的理化性质、亚细胞定位、跨膜区域、磷酸化修饰位点、二级结构和三维结构。以基因组DNA为模板扩增Cna基因编码N1-N2子域的片段,扩增产物经酶切回收后与载体pET-32a(+)相连接,构建重组表达质粒,将该重组质粒转化E.coli TG1,经菌落PCR、测序鉴定后,增菌培养并抽提质粒,再转化E.coli BL21(DE3),经IPTG诱导表达后进行SDS-PAGE分析。[结果]Cna蛋白由1 183个氨基酸残基组成,相对分子质量为133 006.82 Da,等电点为5.89,负电荷氨基酸残基数为180个,正电荷氨基酸残基数为167个,分子式:C5863H9241-N1569O1936S10,原子总数18 619个,是一种稳定的亲水蛋白质,定位于细胞膜上,第4~23、1 158~1 177位氨基酸残基分别形成一个典型的跨膜区,具有148个潜在的磷酸化修饰位点,二级结构中无规则卷曲和β折叠占较大比例,三维结构与二级结构预测结果相符。成功构建了重组表达质粒pET-32a(+)-Cna,经IPTG诱导后重组蛋白(N1-N2子域)获得了表达,重组蛋白相对分子质量为52.1 kDa。[结论]Cna基因的生物信息学分析及该基因的成功表达,为研究Cna蛋白在免疫保护中的作用奠定了一定的基础。
关键词
金黄色葡萄球菌
Cna基因
生物信息学
原核表达
Cna蛋白
Keywords
Staphylococcus aureus
Cna gene
bioinformatics analysis
prokaryotic expression
Cna protein
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
金黄色葡萄球菌Cna基因的生物信息学分析及原核表达
黄怡婕
褚诗钒
陈智豪
许毅
叶锦津
傅子玲
黄悦
金枫影
陈焰焰
冯丹羽
陈其冠
李晨蕙
刘晓罡
姚俊杰
陈淑倩
计敏
李佳佳
何文迪
陈新江
《生物技术》
CAS
2020
0
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