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中药调节DNA高甲基化用药规律的网络药理学及数据挖掘研究
被引量:
1
1
作者
郭宵飞
李智飘
+1 位作者
李静静
张平
《中国中医急症》
2022年第10期1693-1697,共5页
目的 探索中药干预DNA高甲基化的物质基础及用药规律。方法 首先,整合GeneCards、OMIM、GenCLip 3等数据库,从中获取可作用于DNA高甲基化的相关靶点,然后利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出类药性≥0.18的靶点,并收集其...
目的 探索中药干预DNA高甲基化的物质基础及用药规律。方法 首先,整合GeneCards、OMIM、GenCLip 3等数据库,从中获取可作用于DNA高甲基化的相关靶点,然后利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出类药性≥0.18的靶点,并收集其相关化合物及中药,构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络,分析靶点、化合物、中药之间的相关性。另外,匹配中药的性味归经等信息,分析用药规律。最后,将网络中核心靶点与化合物进行分子对接,以验证预测结果及进一步挖掘潜在的化合物靶点组合。结果 共得到189个可作用于DNA高甲基化的靶点,其中有35个靶点可匹配到候选化合物且类药性≥0.18,匹配到1 188个候选化合物,共408味中药。频数统计结果显示,干预DNA高甲基化的中药药味以苦、辛、甘为主,药性以温居多,主要归肝、肺二经。结论 本研究通过系统探讨中药干预DNA高甲基化的物质基础及用药规律,可为中药去甲基化的理论研究及临床应用提供新思路。
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关键词
DNA
高甲基化
中药
网络药理学
用药规律
新药研发
下载PDF
职称材料
阿尔茨海默病嗅觉障碍中药用药规律的网络药理学研究
被引量:
1
2
作者
李智飘
郭宵飞
+1 位作者
徐国杰
刘缨
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
2023年第6期628-632,共5页
目的利用网络药理学及数据挖掘方法初步探索中药调节阿尔茨海默病(AD)嗅觉障碍的物质基础及用药规律。方法通过OMIM、GeneCards、CTD等数据库分别获得AD和嗅觉障碍的相关靶点,取两者的交集靶点后,以在中药系统药理学数据库与分析平台(TC...
目的利用网络药理学及数据挖掘方法初步探索中药调节阿尔茨海默病(AD)嗅觉障碍的物质基础及用药规律。方法通过OMIM、GeneCards、CTD等数据库分别获得AD和嗅觉障碍的相关靶点,取两者的交集靶点后,以在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中类药性≥0.18且可匹配到相应的化合物为条件,进一步筛选获得AD嗅觉障碍的潜在作用靶点。应用TCMSP数据库收集潜在作用靶点的相关化合物、中药,在Cytoscape软件中构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络,根据度值大小获得核心潜在作用靶点、核心候选化合物及核心候选中药。将获得的核心候选化合物及核心潜在作用靶点进行分子对接,初步验证预测结果。建立中药数据库,通过数据分析获得AD嗅觉障碍的中药用药规律。结果共获得AD及嗅觉障碍的疾病相关靶点2919、2358个,两者的交集靶点共946个;其中,符合类药性≥0.18且能匹配到相关化合物的靶点共245个,候选化合物1172个,候选中药406味。候选中药的药味以苦、辛、甘为主,药性主要为温,归经以肝、肺二经为要主。结论以网络药理学及数据挖掘的方法,较为系统的探索了中药调节AD嗅觉障碍的物质基础,获得了中药治疗AD嗅觉障碍的用药规律,为该病的治疗提供了理论依据及用药指导。
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关键词
阿尔茨海默病
嗅觉障碍
网络药理学
数据挖掘
分子对接
用药规律
中药系统药理学数据库分析平台
中药
原文传递
核糖水平异常升高导致小鼠热痛敏改变及机制探究
3
作者
薛林
李智飘
+3 位作者
康念欣
刘晓玲
徐国杰
刘缨
《药物生物技术》
CAS
2023年第4期337-341,共5页
实验室前期发现内源性核糖水平升高是阿尔兹海默症发生的风险因素,但其对认知外的其它神经功能的影响尚待研究,本文探索核糖水平异常升高对小鼠热痛觉的影响及机制。36只雄性C57小鼠随机分为三组:生理盐水阴性对照组、核糖组和半乳糖诱...
实验室前期发现内源性核糖水平升高是阿尔兹海默症发生的风险因素,但其对认知外的其它神经功能的影响尚待研究,本文探索核糖水平异常升高对小鼠热痛觉的影响及机制。36只雄性C57小鼠随机分为三组:生理盐水阴性对照组、核糖组和半乳糖诱导衰老组,每组各12只。以腹腔注射方式连续给药60 d,期间测量0、20、40、60 d的50%机械缩足反射阈值(50%PWMT)和热缩足反射潜伏期(PWL)。60 d后取背根神经节(DRG)组织,ELISA法检测AGES、TNF-α、IL-1β、IL-6、NGF及TRPV1含量,Western blot法检测海马与皮肤中NF-κB与TRPV1的蛋白表达。注射第60 d,与注射生理盐水阴性对照与半乳糖诱导衰老组对照相比:(1)核糖组小鼠热痛敏感度显著升高;(2)核糖组小鼠的DRG中AGEs与TRPV1表达呈升高趋势;(3)核糖组皮肤TRPV1和NF-κB表达上调;(4)核糖组与半乳糖组处理20 d,热痛敏升高加速,小鼠海马TRPV1和NF-κB表达一致上调。核糖代谢异常可导致小鼠热痛觉敏感性升高,其机制与核糖代谢失调导致的具有细胞毒性AGEs在DRG、皮肤内的过度累积、NF-κB激活和TRPV1表达上调相关。同时,核糖诱导海马出现类似半乳糖诱导的NF-κB和TRPV1上调衰老炎性特征。这些结果提示核糖代谢异常对热痛觉损伤的风险,由此为核糖代谢异常的AD患者的相关神经损伤防治提供线索和依据。
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关键词
阿尔兹海默病
D-核糖
炎症因子
痛觉过敏
TRPV1
DRG神经元
原文传递
题名
中药调节DNA高甲基化用药规律的网络药理学及数据挖掘研究
被引量:
1
1
作者
郭宵飞
李智飘
李静静
张平
机构
中国中医科学院望京医院
北京中医药大学
出处
《中国中医急症》
2022年第10期1693-1697,共5页
基金
中国中医科学院科技创新工程(CI2021A05054)
中国中医科学院科技创新工程(CI2021A01818)
+1 种基金
国家自然科学基金项目(82174415)
中国中医科学院望京医院院级科研项目(WJYY2020-19)。
文摘
目的 探索中药干预DNA高甲基化的物质基础及用药规律。方法 首先,整合GeneCards、OMIM、GenCLip 3等数据库,从中获取可作用于DNA高甲基化的相关靶点,然后利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出类药性≥0.18的靶点,并收集其相关化合物及中药,构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络,分析靶点、化合物、中药之间的相关性。另外,匹配中药的性味归经等信息,分析用药规律。最后,将网络中核心靶点与化合物进行分子对接,以验证预测结果及进一步挖掘潜在的化合物靶点组合。结果 共得到189个可作用于DNA高甲基化的靶点,其中有35个靶点可匹配到候选化合物且类药性≥0.18,匹配到1 188个候选化合物,共408味中药。频数统计结果显示,干预DNA高甲基化的中药药味以苦、辛、甘为主,药性以温居多,主要归肝、肺二经。结论 本研究通过系统探讨中药干预DNA高甲基化的物质基础及用药规律,可为中药去甲基化的理论研究及临床应用提供新思路。
关键词
DNA
高甲基化
中药
网络药理学
用药规律
新药研发
Keywords
DNA
Hypermethylation
Chinese Medicine
Network pharmacology
Medication rule
New drug research and development
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
阿尔茨海默病嗅觉障碍中药用药规律的网络药理学研究
被引量:
1
2
作者
李智飘
郭宵飞
徐国杰
刘缨
机构
北京中医药大学生命科学学院
中国中医科学院望京医院
出处
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
2023年第6期628-632,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(批准号:81903738)
北京中医药大学新教师启动基金项目(2022-JYB-XJSJJ-031)。
文摘
目的利用网络药理学及数据挖掘方法初步探索中药调节阿尔茨海默病(AD)嗅觉障碍的物质基础及用药规律。方法通过OMIM、GeneCards、CTD等数据库分别获得AD和嗅觉障碍的相关靶点,取两者的交集靶点后,以在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中类药性≥0.18且可匹配到相应的化合物为条件,进一步筛选获得AD嗅觉障碍的潜在作用靶点。应用TCMSP数据库收集潜在作用靶点的相关化合物、中药,在Cytoscape软件中构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络,根据度值大小获得核心潜在作用靶点、核心候选化合物及核心候选中药。将获得的核心候选化合物及核心潜在作用靶点进行分子对接,初步验证预测结果。建立中药数据库,通过数据分析获得AD嗅觉障碍的中药用药规律。结果共获得AD及嗅觉障碍的疾病相关靶点2919、2358个,两者的交集靶点共946个;其中,符合类药性≥0.18且能匹配到相关化合物的靶点共245个,候选化合物1172个,候选中药406味。候选中药的药味以苦、辛、甘为主,药性主要为温,归经以肝、肺二经为要主。结论以网络药理学及数据挖掘的方法,较为系统的探索了中药调节AD嗅觉障碍的物质基础,获得了中药治疗AD嗅觉障碍的用药规律,为该病的治疗提供了理论依据及用药指导。
关键词
阿尔茨海默病
嗅觉障碍
网络药理学
数据挖掘
分子对接
用药规律
中药系统药理学数据库分析平台
中药
Keywords
Alzheimer's disease
Olfactory disorders
Network pharmacology
Data mining
Molecular docking
Drug use rule
TCM system pharmacology database analysis platform
Traditional Chinese medicine
分类号
R96 [医药卫生—药理学]
原文传递
题名
核糖水平异常升高导致小鼠热痛敏改变及机制探究
3
作者
薛林
李智飘
康念欣
刘晓玲
徐国杰
刘缨
机构
北京中医药大学生命科学学院
出处
《药物生物技术》
CAS
2023年第4期337-341,共5页
基金
国家自然科学基金(批准号32000705),北京中医药大学中央高校基本科研业务费专项资金重点攻关课题(2020⁃JYB⁃ZDGG⁃051)。
文摘
实验室前期发现内源性核糖水平升高是阿尔兹海默症发生的风险因素,但其对认知外的其它神经功能的影响尚待研究,本文探索核糖水平异常升高对小鼠热痛觉的影响及机制。36只雄性C57小鼠随机分为三组:生理盐水阴性对照组、核糖组和半乳糖诱导衰老组,每组各12只。以腹腔注射方式连续给药60 d,期间测量0、20、40、60 d的50%机械缩足反射阈值(50%PWMT)和热缩足反射潜伏期(PWL)。60 d后取背根神经节(DRG)组织,ELISA法检测AGES、TNF-α、IL-1β、IL-6、NGF及TRPV1含量,Western blot法检测海马与皮肤中NF-κB与TRPV1的蛋白表达。注射第60 d,与注射生理盐水阴性对照与半乳糖诱导衰老组对照相比:(1)核糖组小鼠热痛敏感度显著升高;(2)核糖组小鼠的DRG中AGEs与TRPV1表达呈升高趋势;(3)核糖组皮肤TRPV1和NF-κB表达上调;(4)核糖组与半乳糖组处理20 d,热痛敏升高加速,小鼠海马TRPV1和NF-κB表达一致上调。核糖代谢异常可导致小鼠热痛觉敏感性升高,其机制与核糖代谢失调导致的具有细胞毒性AGEs在DRG、皮肤内的过度累积、NF-κB激活和TRPV1表达上调相关。同时,核糖诱导海马出现类似半乳糖诱导的NF-κB和TRPV1上调衰老炎性特征。这些结果提示核糖代谢异常对热痛觉损伤的风险,由此为核糖代谢异常的AD患者的相关神经损伤防治提供线索和依据。
关键词
阿尔兹海默病
D-核糖
炎症因子
痛觉过敏
TRPV1
DRG神经元
Keywords
Alzheimer's disease
D⁃galactose
Inflammatory factors
Hyperalgesia
TRPV1
DRG neuron
分类号
R592 [医药卫生—老年医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中药调节DNA高甲基化用药规律的网络药理学及数据挖掘研究
郭宵飞
李智飘
李静静
张平
《中国中医急症》
2022
1
下载PDF
职称材料
2
阿尔茨海默病嗅觉障碍中药用药规律的网络药理学研究
李智飘
郭宵飞
徐国杰
刘缨
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
2023
1
原文传递
3
核糖水平异常升高导致小鼠热痛敏改变及机制探究
薛林
李智飘
康念欣
刘晓玲
徐国杰
刘缨
《药物生物技术》
CAS
2023
0
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