目的筛选2型糖尿病(T2DM)大鼠与正常大鼠血液中差异表达的microRNA(miRNA),通过生物信息学分析预测差异miRNA调控的靶基因及功能。方法取20只健康雄性SD大鼠随机分为空白对照组和T2DM模型组,每组10只。采用高脂饲料联合腹腔注射链脲佐菌...目的筛选2型糖尿病(T2DM)大鼠与正常大鼠血液中差异表达的microRNA(miRNA),通过生物信息学分析预测差异miRNA调控的靶基因及功能。方法取20只健康雄性SD大鼠随机分为空白对照组和T2DM模型组,每组10只。采用高脂饲料联合腹腔注射链脲佐菌素(STZ)制作T2DM大鼠模型,2周后提取糖尿病大鼠及正常大鼠全血,应用miRNA测序技术筛选差异miRNA。利用生物信息学方法对差异表达的miRNA靶基因进行基因本体(gene ontology,GO)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析。结果与空白对照组相比,T2DM模型组大鼠随机血糖均≥16.7 mmol/L且明显升高、持续稳定。与空白对照组相比,T2DM模型组大鼠血液中共有56个差异表达的miRNA,其中32个上调,24个下调。GO富集分析显示差异表达miRNA的靶基因主要集中在细胞质、细胞核、细胞膜等细胞组分,DNA及RNA的转录调控等生物学过程,与蛋白结合、金属离子结合、ATP结合等分子功能相关。KEGG通路富集分析显示差异表达miRNA的靶基因主要富集于糖尿病并发症、癌症等疾病通路,内吞、自噬等细胞功能通路,MAPK、mTOR、Ras、FoxO等信号通路。结论T2DM模型大鼠血液miRNA较正常大鼠差异表达变化明显,其差异表达的miRNA可能通过影响细胞的炎症免疫反应、增殖、生长分化等功能进而参与糖尿病及其并发症的发生发展。展开更多
目的:基于网络药理学方法分析肾炎消白颗粒治疗糖尿病肾病的潜在机制,为临床运用提供理论参考。方法:挖掘中医药系统药理学平台(TCMSP)获得肾炎消白颗粒有效成分及作用靶点,并研究相关文献进行补充,通过挖掘GeneCards、TTD、OMIM、DisGe...目的:基于网络药理学方法分析肾炎消白颗粒治疗糖尿病肾病的潜在机制,为临床运用提供理论参考。方法:挖掘中医药系统药理学平台(TCMSP)获得肾炎消白颗粒有效成分及作用靶点,并研究相关文献进行补充,通过挖掘GeneCards、TTD、OMIM、DisGeNET数据库获取其疾病潜在靶点,于STRING 11.0平台构建蛋白质互作网络,预测关键靶点并进行基因本体-生物过程分析(Gene Ontology-biological process,GP-BP)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析,构建“肾炎消白颗粒-糖尿病肾病-通路”网络图。结果:肾炎消白颗粒主要有效成分有紫杉碱、花生四烯酸、β-胡萝卜素、β-谷甾醇、联苯酸酯、芒柄花素等,其关键靶点有TNF、RELA、JUN、AKT1、MAPK3等,生物过程可调节多种介质,调控DNA结合转录因子的活性,并针对细胞进行氧化应激反应,其涉及通路主要包括白细胞介素-17(IL-17)信号通路、Toll样受体信号通路、TNF信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、细胞凋亡、MAPK信号通路、Th17细胞分化通路等。结论:肾炎消白颗粒具有多成分、多靶点、多通路作用的优势,治疗糖尿病肾病可能与炎症反应、自噬-凋亡通路等相关。展开更多
文摘目的筛选2型糖尿病(T2DM)大鼠与正常大鼠血液中差异表达的microRNA(miRNA),通过生物信息学分析预测差异miRNA调控的靶基因及功能。方法取20只健康雄性SD大鼠随机分为空白对照组和T2DM模型组,每组10只。采用高脂饲料联合腹腔注射链脲佐菌素(STZ)制作T2DM大鼠模型,2周后提取糖尿病大鼠及正常大鼠全血,应用miRNA测序技术筛选差异miRNA。利用生物信息学方法对差异表达的miRNA靶基因进行基因本体(gene ontology,GO)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析。结果与空白对照组相比,T2DM模型组大鼠随机血糖均≥16.7 mmol/L且明显升高、持续稳定。与空白对照组相比,T2DM模型组大鼠血液中共有56个差异表达的miRNA,其中32个上调,24个下调。GO富集分析显示差异表达miRNA的靶基因主要集中在细胞质、细胞核、细胞膜等细胞组分,DNA及RNA的转录调控等生物学过程,与蛋白结合、金属离子结合、ATP结合等分子功能相关。KEGG通路富集分析显示差异表达miRNA的靶基因主要富集于糖尿病并发症、癌症等疾病通路,内吞、自噬等细胞功能通路,MAPK、mTOR、Ras、FoxO等信号通路。结论T2DM模型大鼠血液miRNA较正常大鼠差异表达变化明显,其差异表达的miRNA可能通过影响细胞的炎症免疫反应、增殖、生长分化等功能进而参与糖尿病及其并发症的发生发展。
文摘目的:基于网络药理学方法分析肾炎消白颗粒治疗糖尿病肾病的潜在机制,为临床运用提供理论参考。方法:挖掘中医药系统药理学平台(TCMSP)获得肾炎消白颗粒有效成分及作用靶点,并研究相关文献进行补充,通过挖掘GeneCards、TTD、OMIM、DisGeNET数据库获取其疾病潜在靶点,于STRING 11.0平台构建蛋白质互作网络,预测关键靶点并进行基因本体-生物过程分析(Gene Ontology-biological process,GP-BP)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析,构建“肾炎消白颗粒-糖尿病肾病-通路”网络图。结果:肾炎消白颗粒主要有效成分有紫杉碱、花生四烯酸、β-胡萝卜素、β-谷甾醇、联苯酸酯、芒柄花素等,其关键靶点有TNF、RELA、JUN、AKT1、MAPK3等,生物过程可调节多种介质,调控DNA结合转录因子的活性,并针对细胞进行氧化应激反应,其涉及通路主要包括白细胞介素-17(IL-17)信号通路、Toll样受体信号通路、TNF信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、细胞凋亡、MAPK信号通路、Th17细胞分化通路等。结论:肾炎消白颗粒具有多成分、多靶点、多通路作用的优势,治疗糖尿病肾病可能与炎症反应、自噬-凋亡通路等相关。