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细角螺微卫星DNA富集文库构建及特征分析 被引量:1
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作者 李清荟 陈晓姣 +3 位作者 黎中宝 曹媛钰 陈丽娜 戴刚 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期1-5,共5页
采用生物素磁珠富集法,用生物素标记的(GT)15和(CT)15两种探针与细角螺基因组MseI酶切的300~1200bp片段杂交,杂交复合物与链霉亲和素磁珠结合,捕获含有重复序列的微卫星片段。最后将磁珠捕获到的重复序列与PMD19-T载体连接后克隆到DH5... 采用生物素磁珠富集法,用生物素标记的(GT)15和(CT)15两种探针与细角螺基因组MseI酶切的300~1200bp片段杂交,杂交复合物与链霉亲和素磁珠结合,捕获含有重复序列的微卫星片段。最后将磁珠捕获到的重复序列与PMD19-T载体连接后克隆到DH5α中构建微卫星基因组文库。通过PCR检测出354个阳性克隆,从中随机选取248个片段大于500bp的阳性克隆进行测序,结果显示,在220个成功测序的阳性克隆中共获得278个微卫星序列,其中完美型171个,占61.5%;非完美型81个,占29.1%;复合型26个,占9.4%。除探针使用的GT和CT的重复序列外,还筛选到三碱基GTT、TGG、GAA、CAA;四碱基TCTA、ACAG、TAGA、GTGA、GTCT、GATA及五碱基TTTTG的重复序列。在278条序列中共有82条可以设计引物。 展开更多
关键词 细角螺(Hemifusus ternatanus) 磁珠富集 微卫星 构建 DNA文库
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中国鲎基因组微卫星富集文库的构建及分析 被引量:3
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作者 宁晔凤 黎中宝 +2 位作者 戴刚 上官静波 李清荟 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期15-20,共6页
本研究旨在从DNA分子水平上研究中国鲎(Tachypleus tridentatus)种群遗传多样性及种群结构等相关信息,以期为保护其野生群体种质资源提供科学依据。本研究通过生物素—磁珠富集法筛选微卫星标记,构建中国鲎基因组微卫星文库。基因组DNA... 本研究旨在从DNA分子水平上研究中国鲎(Tachypleus tridentatus)种群遗传多样性及种群结构等相关信息,以期为保护其野生群体种质资源提供科学依据。本研究通过生物素—磁珠富集法筛选微卫星标记,构建中国鲎基因组微卫星文库。基因组DNA经Fast Digest Tru1I酶切后,选取400 bp^1000 bp片段,用生物素标记的(GT)15、(CT)15混合探针与其杂交,杂交复合物与链霉亲和素磁珠结合,捕获含有重复序列的微卫星片段,纯化后连接PMD19-T载体克隆,构建基因组微卫星文库。从334个阳性克隆中随机选取196个片段大于400 bp的阳性克隆进行测序,共获得127个微卫星序列,其中完美型占69.3%、非完美型占11.0%、复合型占19.7%。除探针使用的GT和CT的重复序列外,还筛选到多碱基GCT、TGG、AAAC、ACAA、GATTT、TTTTA的重复序列。根据微卫星序列设计选择合成40对引物,结果显示其中3对具有较高多态性,可作为进一步评价中国鲎野生种质资源等遗传信息的有效遗传标记。 展开更多
关键词 中国鲎(Tachypleus tridentatus) 磁珠富集 微卫星文库
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在农业绿色发展背景下稻渔综合种养的意义和前景分析
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作者 李清荟 《中文科技期刊数据库(全文版)农业科学》 2021年第4期185-186,共2页
稻渔综合种养能有效利用稻田独特的空间环境和水体资源,大幅度减少农药和化肥的使用,使稻田生态系统内的能量和物质资源进行良性循环。稻渔综合种养可以实现稻米品质好,水产品质量安全、口感鲜甜,满足市场对有机农产品的需求。根据实际... 稻渔综合种养能有效利用稻田独特的空间环境和水体资源,大幅度减少农药和化肥的使用,使稻田生态系统内的能量和物质资源进行良性循环。稻渔综合种养可以实现稻米品质好,水产品质量安全、口感鲜甜,满足市场对有机农产品的需求。根据实际情况,推广适宜的稻渔综合种养模式意义重大,前景广阔。 展开更多
关键词 稻渔综合种养 绿色农业 意义 前景
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