糖尿病肾病中与铁死亡相关中枢基因的识别

目的通过生物信息学分析,识别在糖尿病肾病(DN)进展中发挥重要作用的铁死亡相关基因,为DN的治疗提供新见解。方法对RNA测序数据集GSE142025进行DN差异表达基因(DEGs)的分析和筛选,并进行了基因本体论(GO)功能注释和基因集富集分析(GSEA)。随后,构建加权基因共表达网络分析(WGCNA)来识别关键基因。通过韦恩图将DEGs和关键基因所共有的铁死亡相关基因(FRGs)确立为中枢(hub)基因。应用受试者操作特征(ROC)曲线验证hub基因的临床诊断价值,并采用免疫组织化学染色(IHC)法检测hub基因在3例DN患者及3例正常肾组织中的表达量。结果在DN组和对照组(NC组)筛选出1916个DEGs。GO功能富集分析显示,DEGs主要参与炎症相关的生物过程,GSEA分析提示DEGs在铁离子结合的生物过程中显著富集。WGCNA构建的12个共表达模块中,grey60、turquoise和grey模块与DN的相关性最高。根据筛选标准从3个模块中挑选出188个关键基因,其中与DEGs共有的FRGs有2个,分别为铜蓝蛋白(CP)基因和脂质运载蛋白-2(LCN2)基因。ROC曲线验证二者皆具有良好的临床诊断价值。IHC结果显示,2个基因在DN患者组织样本中表达均上调(P均<0.05),与生物信息学的分析结果相一致。结论CP和LCN2可能通过抑制肾组织中的铁死亡参与DN疾病的发展,可作为DN潜在的生物标志物和治疗的新靶点。

CCL20通过IL-17信号通路调控糖尿病肾病炎症进展

目的基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别糖尿病肾病(DN)外周血中的关键基因,探讨DN的发病机制,为其发生、发展提供新的见解。方法通过基因表达总库(GEO)下载数据集GSE142153进行差异表达基因(DEGs)筛选,应用京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析DEGs参与的分子生物学过程。通过构建WGCNA识别关键模块和中枢(hub)基因,应用验证集GSE65561分析受试者操作特征曲线从而验证hub基因潜在的临床诊断价值;随后采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测hub基因在DN患者外周血中的相对表达量。结果数据集GSE142153包含23例DN患者、10例健康对照者。根据筛选标准,DN组有181个DEGs,其中106个基因表达上调和75个基因表达下调。KEGG富集分析聚焦于IL-17、核因子-κB、酪氨酸蛋白激酶/信号转导及转录激活因子等炎症通路激活。WGCNA识别了16个模块,其中,turquoise模块被认为对DN最具临床意义,选择turquoise模块中的基因与DEGs、IL-17信号通路基因相交得C-C趋化因子配体20(CCL20)、IL-1β、C-X-C趋化因子配体1、基质金属蛋白酶-9、FOS样抗原1基因。临床DN患者外周血RT-qPCR验证,结果与生物信息学分析一致。结论CCL20等hub基因可能通过调控IL-17信号通路促进DN的炎症发展,该类基因有助于确定DN的潜在生物标志物和治疗靶点。

SMILE和PRK的生物力学特性对比

目的探讨飞秒激光小切口透镜提取术(SMILE)和准分子激光角膜切削术(PRK)对角膜生物力学的影响。方法选取广州视献眼科屈光手术中心2019年10月至2020年1月收治的中低度近视(等效球镜小于-6.00 D)患者20例(40眼),根据患者意愿分为SMILE组(10例,20眼)和PRK组(10例,20眼)。使用角膜生物力学分析仪测量术前及术后1个月角膜在空气脉冲作用下的形变参数。结果在等效球镜和角膜厚度等基线条件相近的情况下,SMILE组角膜切削量显著高于PRK组,差异有统计学意义(t=3.502,P=0.02)。术前和术后1个月,2组患者反向曲率半径(Radius)、第一次压平时间(AT1)、第一次压平角膜长度(Length1)、峰值距离(Peak Distance)和变形幅度比(DA Ratio)组内分别比较,差异有统计学意义(P<0.05)。SMILE组和PRK组ΔDA Ratio、ΔLength2、ΔAT2和ΔPeak Distance比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论角膜屈光手术改变了角膜的生物力学性能,角膜对变形的阻力变小,角膜硬度降低。SMILE组术后Peak Distance和DA Ratio生物力学参数较PRK组明显增加,说明SMILE术对角膜生物力学影响更大。

不同屈光手术后患者满意度的研究进展

随着现代屈光手术技术的不断完善、创新和人工晶状体材料、设计的发展,屈光手术方式日新月异,越来越多的人选择屈光手术来矫正屈光不正。屈光手术是一种选择性手术,患者术后满意度与临床疗效密切相关,对患者选择个性化治疗方案具有较强的临床指导意义,笔者就不同方式屈光手术后患者满意度的研究进展作一综述。

丝氨酸-精氨酸蛋白激酶2与前列腺癌细胞周期的相关性

目的探讨丝氨酸-精氨酸蛋白激酶2(SRPK2)与前列腺癌细胞周期的相关性。方法通过皮尔森相关性分析探索癌症基因组图谱(TCGA)数据库中前列腺癌和SRPK2的相关基因集, 并进一步将SRPK2相关基因集导入蛋白质相互作用关系检索工具(STRING)蛋白互作网络在线分析网站, 通过Cytoscape软件进行可视化, 提取与SRPK2相关联蛋白子网络;将上述分析所得基因通过京都基因和基因组百科全书(KEGG)数据集分析出与SRPK2潜在相关的通路, 运用基因探针富集分析(GSEA)富集分析探索SRPK2所激活和抑制的相关通路;构建SRPK2敲低的前列腺癌细胞株DU145, 分为空白载体组(DU145-KO-NC)和敲低组(DU145-KO-SRPK2), 通过细胞周期检测试剂盒、细胞增殖-毒性检测试剂盒、划痕实验、侵袭实验检测细胞的周期变化、增殖、迁移和侵袭能力, 组间比较采用独立样本t检验。结果 TCGA数据库分析结果显示有2 158个基因在表达量上与SRPK2呈正相关, 779个基因与SRPK2呈负相关;通过STRING蛋白互作网络在线分析, SRPK2与SF3B1、SRSF10、PRPF40A、PRPF4B、DDX46、BCLAF1、NUDT21、CLASRP等基因除了在表达量上存在统计学相关性, 在蛋白层面上同样存在着相互作用的关系。对2 937个与SRPK2相关的基因进行功能和通路分析, 结果显示SRPK2与细胞周期相关通路相关, 如有丝分裂纺锤(Mitotic Spindle), G2~M期检查点(G2~M Checkpoint), E2F靶点(E2F Targets), Myc-V1靶点(Myc-V1 Targets)通路。KEGG数据集表明与SRPK2潜在相关的通路有细胞周期(Cell Cycle)、核糖体(Ribosome)、线粒体自噬(Mitophagy)、凋亡(Apoptosis)等。通过进一步GSEA富集分析, 结果显示SRPK2同样在前列腺癌中激活细胞周期相关通路, 如有丝分裂纺锤体(Mitotic Spindle), G2~M期检查点(G2~M Checkpoint), E2F靶点(E2F Targets)(NES>0)。为了进一步验证SRPK2对细胞周期的影响, 成功构建SRPK2敲低的DU145细胞株, 结果提示敲低SRPK2基因后, 敲低组的S期高于空白载体组(DU145-KO-NC比DU145-KO-SRPK2为27.053±0.860比33.297±0.883, t=-7.166, P<0.01), 而敲低组的增殖(DU145-KO-NC比DU145-KO-SRPK2为0.085±0.002比0.344±0.042, t=10.655;P<0.01)、迁移(30 h:DU145-KO-NC比DU145-KO-SRPK2为0.929±0.066比0.690±0.057, t=6.101, P<0.01)、侵袭能力(DU145-KO-NC比DU145-KO-SRPK2为81.667±4.163比42.333±7.572, t=5.750, P<0.05)低于空白载体组, 差异均具有统计学意义。结论 SRPK2可能通过促进细胞周期从而影响前列腺癌进展。