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松材线虫VAP家族成员结构分析
被引量:
1
1
作者
潘佳亮
王巧申
+3 位作者
李长强
李理栎
姚洪锡
阎合
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2022年第5期583-591,共9页
类毒液过敏原蛋白(VAP)是一类高度保守的线虫分泌物,在线虫侵染寄主植物早期发挥重要作用.运用生物信息学方法在松材线虫(Bx)基因组中共鉴定出14个VAP家族成员,对其理化性质、保守基序和二、三级结构等生物学特性进行分析,并构建了系统...
类毒液过敏原蛋白(VAP)是一类高度保守的线虫分泌物,在线虫侵染寄主植物早期发挥重要作用.运用生物信息学方法在松材线虫(Bx)基因组中共鉴定出14个VAP家族成员,对其理化性质、保守基序和二、三级结构等生物学特性进行分析,并构建了系统发育进化树.结果显示:不同Bx-VAPs的氨基酸组成数量和相对分子质量存在很大差异;14个Bx-VAPs基因的进化相对保守,所有蛋白均含有代谢产物活化蛋白(CAP)结构域;该家族成员有明显的胞外蛋白形态特征,属于分泌蛋白.研究结果可为揭示松材线虫入侵、定殖和致病的机制奠定一定理论基础.
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关键词
松材线虫病
VAP基因家族
蛋白质结构
生物信息学
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职称材料
题名
松材线虫VAP家族成员结构分析
被引量:
1
1
作者
潘佳亮
王巧申
李长强
李理栎
姚洪锡
阎合
机构
国家林业和草原局生物灾害防控中心/林业有害生物监测预警国家林业和草原局重点实验室
东北林业大学林学院
荣成市国有成山林场
出处
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2022年第5期583-591,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2021YFD1400900)
国家林业和草原局重大应急科技项目(ZD202001).
文摘
类毒液过敏原蛋白(VAP)是一类高度保守的线虫分泌物,在线虫侵染寄主植物早期发挥重要作用.运用生物信息学方法在松材线虫(Bx)基因组中共鉴定出14个VAP家族成员,对其理化性质、保守基序和二、三级结构等生物学特性进行分析,并构建了系统发育进化树.结果显示:不同Bx-VAPs的氨基酸组成数量和相对分子质量存在很大差异;14个Bx-VAPs基因的进化相对保守,所有蛋白均含有代谢产物活化蛋白(CAP)结构域;该家族成员有明显的胞外蛋白形态特征,属于分泌蛋白.研究结果可为揭示松材线虫入侵、定殖和致病的机制奠定一定理论基础.
关键词
松材线虫病
VAP基因家族
蛋白质结构
生物信息学
Keywords
pine wilt disease
venom allergen-like protein
protein structure
bioinformatics
分类号
S763.18 [农业科学—森林保护学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
松材线虫VAP家族成员结构分析
潘佳亮
王巧申
李长强
李理栎
姚洪锡
阎合
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2022
1
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职称材料
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