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题名甜高粱叶绿体基因组特征及密码子偏好性分析
被引量:5
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作者
洪森荣
林顺来
李盈萍
李芸芸
李和月
张庆宝
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机构
上饶师范学院生命科学学院
上饶农业技术创新研究院
上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室
上饶市薯芋类作物种质保存与利用重点实验室
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出处
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期3636-3650,共15页
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基金
国家自然科学基金资助目(31960079)
江西省科技厅重点研发计划一般项目(20202BBG73010)
+3 种基金
江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ201704,GJJ211729)
江西省现代农业产业技术体系建设专项(JXARS-13-赣东站)
上饶市科技局平台载体建设项目(2020 J001)
上饶师范学院2023年大学生创新创业训练计划项目(202310416013)资助。
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文摘
本研究采用高通量测序技术对甜高粱叶绿体基因组进行测序,对组装和注释后的叶绿体基因组进行结构、基因组成及密码子偏好性分析。结果表明,甜高粱(Sorghum bicolor)叶绿体基因组长度为140644 bp,编码86个CDS基因、38个tRNA基因和8个rRNA基因,检测到31个SSR位点和42个Long repeat序列。甜高粱及其14个近缘种的叶绿体基因组变化不大,IR区边界未发生明显的收缩与扩张。甜高粱叶绿体基因组密码子偏好以A,U结尾,其密码子使用偏性很大程度上受自然选择的影响,而受突变压力的影响小。甜高粱叶绿体基因组的最优密码子14个(ACU,UAG,CCU,CUA,GCU,AGU,GAU,UUA,CGU,GAA,GUU,UCA,CAU,UGU)。甜高粱与高粱Sorghum bicolor MT333845(产地:韩国,栽培种Donganme)、MT333848(产地:韩国,栽培种Sodam Chal)、MT459453(产地:韩国,栽培种ATx623)亲缘关系较近。研究结果将为完善高粱属植物分子育种技术和探究高粱属植物系统发育提供参考。
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关键词
甜高粱
叶绿体基因组
序列特征
密码子偏好性
最优密码子
系统发育分析
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Keywords
Sweet sorghum
Chloroplast genome
Sequence characteristics
Codon bias
Optimal codons
Phylogenetic analysis
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分类号
S344.13
[农业科学—作物栽培与耕作技术]
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题名植物组织培养教学设计
被引量:3
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作者
洪森荣
管盈
李盈萍
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机构
上饶师范学院生命科学学院
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出处
《现代农业研究》
2022年第12期77-83,共7页
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基金
2021年度江西省高等学校省级教学改革研究课题“本科层次技术技能型人才培养视域下植物组织培养ADI教学模式的应用研究”(项目编号:JXJG-21-16-2)。
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文摘
本文研究了本科层次技术技能型人才培养视域下植物组织培养教学设计,对植物组织培养教学内容进行了梳理,设计了植物组织培养教学的步骤,提供了植物组织培养教学的辅助工具,最后对植物组织培养教学提出了一些实施建议。本研究结果可为其他农林生物类课程在本科层次职业教育视角下有效应用教学模式提供一些理论参考。
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关键词
本科层次技术技能型人才培养视域
植物组织培养
教学
设计
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Keywords
perspective of cultivating technical skilled talents at undergraduate level
plant tissue culture
teaching
design
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分类号
G642.0
[文化科学—高等教育学]
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