目的建立饮用水中贾第鞭毛虫和隐孢子虫的数字PCR定量检测方法。方法过滤水样,收集贾第鞭毛虫和隐孢子虫,提取DNA,分别选择β-Giardin和18S r RNA基因作为靶基因,设计合成特异性引物与探针,使用数字PCR技术进行检测,计算两种靶基因的浓...目的建立饮用水中贾第鞭毛虫和隐孢子虫的数字PCR定量检测方法。方法过滤水样,收集贾第鞭毛虫和隐孢子虫,提取DNA,分别选择β-Giardin和18S r RNA基因作为靶基因,设计合成特异性引物与探针,使用数字PCR技术进行检测,计算两种靶基因的浓度,进而对贾第鞭毛虫和隐孢子虫个数进行定量。结果数字PCR法的检出限为0.02~0.03个/L,加标回收率>20%,RSD为12.81%~15.35%。结论该方法具有较高的灵敏度和特异性,可应用于饮用水中极少数量贾第鞭毛虫和隐孢子虫的测定。展开更多
分子生物学的发展推动了分子技术在病原体检测诊断中的应用,建立成熟可靠的饮用水中隐孢子虫的分子检测方法也迫在眉睫.本研究直接提取饮用水浓缩液DNA,对隐孢子虫卵囊目的基因进行定量PCR(quantitative PCR,简称qPCR)检测,并对该体系...分子生物学的发展推动了分子技术在病原体检测诊断中的应用,建立成熟可靠的饮用水中隐孢子虫的分子检测方法也迫在眉睫.本研究直接提取饮用水浓缩液DNA,对隐孢子虫卵囊目的基因进行定量PCR(quantitative PCR,简称qPCR)检测,并对该体系进行了综合优化.本研究比较了不同冻融处理及不同DNA提取试剂盒对隐孢子虫卵囊DNA提取效果,结果显示,QIAamp DNA Mini kit配合冻融前处理(液氮/沸水5个循环)提取DNA含量较高,用这种方法可以提取到(4±1)个隐孢子虫卵囊DNA.本研究比较了隐孢子虫SYBR green染料法及Taqman探针法qPCR,结果显示,探针法和染料法均可以检测到10个18S rRNA基因拷贝(一个隐虫卵囊含有20个18S rRNA基因拷贝).采用该检测体系测定的去离子水和水源水中隐孢子虫的加标回收率分别达到了55%和46%;本研究提供了饮用水中隐孢子虫检测的一种可行性分子方法.展开更多
文摘目的建立饮用水中贾第鞭毛虫和隐孢子虫的数字PCR定量检测方法。方法过滤水样,收集贾第鞭毛虫和隐孢子虫,提取DNA,分别选择β-Giardin和18S r RNA基因作为靶基因,设计合成特异性引物与探针,使用数字PCR技术进行检测,计算两种靶基因的浓度,进而对贾第鞭毛虫和隐孢子虫个数进行定量。结果数字PCR法的检出限为0.02~0.03个/L,加标回收率>20%,RSD为12.81%~15.35%。结论该方法具有较高的灵敏度和特异性,可应用于饮用水中极少数量贾第鞭毛虫和隐孢子虫的测定。
文摘分子生物学的发展推动了分子技术在病原体检测诊断中的应用,建立成熟可靠的饮用水中隐孢子虫的分子检测方法也迫在眉睫.本研究直接提取饮用水浓缩液DNA,对隐孢子虫卵囊目的基因进行定量PCR(quantitative PCR,简称qPCR)检测,并对该体系进行了综合优化.本研究比较了不同冻融处理及不同DNA提取试剂盒对隐孢子虫卵囊DNA提取效果,结果显示,QIAamp DNA Mini kit配合冻融前处理(液氮/沸水5个循环)提取DNA含量较高,用这种方法可以提取到(4±1)个隐孢子虫卵囊DNA.本研究比较了隐孢子虫SYBR green染料法及Taqman探针法qPCR,结果显示,探针法和染料法均可以检测到10个18S rRNA基因拷贝(一个隐虫卵囊含有20个18S rRNA基因拷贝).采用该检测体系测定的去离子水和水源水中隐孢子虫的加标回收率分别达到了55%和46%;本研究提供了饮用水中隐孢子虫检测的一种可行性分子方法.