基于代谢组学探究肾阳虚证患者激素代谢的变化研究

目的探究肾阳虚证患者与平和质人群的尿液代谢物水平差异,分析激素变化情况,为肾阳虚证探索出有价值的生物标志物。方法共纳入8例肾阳虚患者与4例平和质人群的尿液进行UPLC代谢组学分析,通过PCA、PLS-DA分析,筛选出有显著差异的代谢物并结合代谢通路进行分析。结果与对照组相比较,试验组尿液中11-β-羟基雄酮-3-葡萄糖醛酸、三羟基孕酮、18-羟皮质醇、醛固酮18-葡糖苷酸、4-羟基雄烯二酮葡糖苷酸等激素代谢物显著上升,硫酸雄酮、本胆烷醇酮、16-脱氢黄体酮、5b-孕二醇、氟氢可的松、雌酮、5a-二氢睾酮等显著下降。结论本研究进一步证明了肾阳虚证会导致机体多种激素代谢紊乱,降低氨基酸、脂肪酸等能量代谢,并与细胞内吞、昼夜节律夹带等通路有关。

基于网络药理学和分子对接探讨虎杖治疗肝癌的生物分子机制

目的:基于网络药理学和在线数据库研究虎杖治疗肝癌的潜在作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)、PubChem、GeneCard和OMIM数据库分别获取虎杖和肝癌的相关基因,取交集基因,通过String数据库获取交集基因的蛋白相互作用(PPI)网络,使用clusterProfiler R包对交集基因进行GO和KEGG富集分析。采用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-化合物-靶点-疾病的网络模型。利用AutoDock1.5.6软件对虎杖和相关靶点进行分子对接。Western Blot和qPCR检测木犀草素对人肝癌Huh7细胞p-AKT蛋白和mRNA表达的影响。结果:获得虎杖和肝癌交集基因131个,PPI网络图表明交集基因之间关系密切。富集分析得到GO生物学功能138个,以及相关通路155条,其中核心靶点以AKT富集最多。分子对接结果显示木犀草素与AKT靶点稳定结合。Western Blot和qPCR检测结果显示,木犀草素能够显著减低人肝癌Huh7细胞p-AKT蛋白及mRNA的含量水平。结论:虎杖及其主要成分木犀草素可能通过作用AKT靶点,介导AKT信号通路发挥治疗肝癌的作用。

基于网络药理学联合GEO数据库及分子对接技术探讨化瘀丸治疗乳腺癌的作用机制

目的 通过网络药理学联合GEO数据库差异基因分析及分子对接技术研究化瘀丸治疗乳腺癌的有效成分及作用机制。方法 利用TCMSP数据库检索化瘀丸中12味中药信息,获得化瘀丸的活性成分和分子靶点。通过GEO数据库检索“breastcancer”筛选后获得GSE139038数据,通过R软件分析得出差异基因。通过DrugBank、OMIM、TTD和CTD数据库筛选出乳腺癌的相关靶点,利用UniProt数据库对靶点进行基因注释,通过Cytoscape3.2.1软件构建化瘀丸与乳腺癌的成分-靶点网络图,使用插件BisoGenet和CytoNCA绘制核心靶点拓扑网络,并进行药物与疾病交集靶点的GO功能与KEGG通路富集分析,最后将网络中度值较高的成分与核心靶点进行分子对接。结果 从GEO数据库下载分析得到乳腺癌上调和下调最明显的差异基因40个。获得化瘀丸主要活性成分7个,包括山柰酚(kaempferol)、谷甾醇(sitosterol)、异鼠李素(isorhamnetin)、常春藤皂苷元(hederagenin)、槲皮素(quercetin)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)和豆甾醇(stigmasterol)等,作用于JUN、FOS、MYC、E2F1、E2F2等32个基因靶点。GO功能与KEGG通路富集分析表明,化瘀丸治疗乳腺癌主要通过调节氧化应激、激活转录因子结合、趋化因子受体结合等生物反应,作用于病毒感染通路、细胞衰老信号通路、IL-17信号通路、肝癌通路等发挥治疗作用。结论 化瘀丸治疗乳腺癌的活性成分为槲皮素等,主要涉及病毒感染、IL-17及其他与癌症相关的通路。