清肺消炎丸基于炎症相关靶点的计算药理学研究

目的:研究清肺消炎丸化学成分抗炎相关靶点的作用,并在分子层面上阐释了多靶点效应。方法:借助与计算机辅助药物设计相关技术(以分子对接为主),探讨该复方化合物与炎症相关靶标间作用关系。结果:清肺消炎丸含有17个具有高生物利用度及类药性良好的化合物,其化学成分对环氧合酶-2(COX-2)、3α-羟基类固醇脱氢酶(3α-HSD)、磷脂酶A2(Phospholipase A2)、细胞色素p450-cam(CYP450-cam)、外膜磷脂酶(OMPLA)、对羟基苯甲酸羟化酶(PHBH)等多个靶点起作用。结论:该实验从分子层次上阐述了该复方在炎症治疗方面的计算药理学和化合物多靶点作用,研究为揭示清肺消炎丸缓解哮喘的作用机制提供了依据。

传统中药中H7N9病毒神经氨酸酶抑制剂的计算机虚拟筛选

目的:运用计算机虚拟筛选技术从传统中药数据库(TCM database@Taiwan)中快速搜索H7N9亚型流感病毒神经氨酸酶(neuraminidase,NA)的中药小分子抑制剂。方法:采用Auto Dock Vina软件对蛋白质晶体结构数据库PDB中NA与小分子抑制剂扎那米韦形成的复合物(PDB代码为4MWX)三维结构活性部位进行分析,基于传统中药配体库进行分子对接初次筛选。综合运用传统中药系统药理学数据库及分析平台TCMSP及Accelrys公司开发的Discovery Studio 2.5分子模拟软件包内TOPKAT模块计算药代动力学参数和毒性预测对分子对接结果进行2次筛选。结果:以原配体(扎那米韦)的自由结合能为阈值,筛选出中国传统中药数据库中3个类药性良好的化学成分与NA亲和力高于上市的抗流感药物扎那米韦的天然小分子化合物,并且确定了它们的中草药来源。结论:该研究结果可促进从传统中药库中提取、设计及实验合成新抗H7N9流感病毒药物。

传统中药中H7N9病毒神经氨酸酶抑制剂的计算机虚拟筛选

目的用分子对接方法从传统中药数据库(TCM Database@Taiwan)中筛选H7N9病毒神经氨酸酶抑制剂。方法流感病毒中神经氨酸酶作为一个已经被证明的抗流感药物靶点,从蛋白晶体结果数据库(Protein Data Bank,PDB)中提取晶体结构文件,对其三维结构活性部位进行分析,采用对接软件Auto Dock Vina与数据库中药物小分子进行高通量分子对接。结果得到3个亲和力高于上市的抗流感药物扎那米韦(Zanamivir)的天然小分子化合物,并确定了它们的中草药来源。结论该结果可促进从传统中药中提取、设计以及实验合成新的抗H7N9流感病毒药物。