基于iTRAQ技术的碘难治型甲状腺癌与分化型甲状腺癌的比较蛋白质组学研究

目的寻找碘难治型甲状腺癌和分化型甲状腺癌之间的差异蛋白,探讨碘难治型甲状腺癌发生的机制,探索可能的核素分子治疗靶点。方法收集2018年6月至2019年3月本科收治的碘难治型甲状腺癌和分化型甲状腺癌患者颈部转移淋巴结各3例,利用iTRAQ技术联合质谱分析得到差异蛋白,并通过生物信息学方法对差异蛋白进行GO功能注释、KEGG通路分析,并利用TCGA、TCPA数据库对部分差异蛋白进行验证。结果鉴定得到的差异蛋白共665个,其中显著上调的蛋白327个,显著下调的蛋白338个。ECM1、CHI3L1、LAMA5、14-3-3 eta、CDC42、RAC2、MYL9等差异蛋白广泛参与肿瘤血管生成、侵袭转移及细胞失分化过程。同时,差异蛋白富集于包括代谢通路、黏着斑及其他多条信号通路。结论碘难治型甲状腺癌和分化型甲状腺癌的差异蛋白较多,其主要功能涉及调节转运体活性及酶活性等,参与细胞代谢等多个生物过程。ECM1、CHI3L1及CDC42通过与MAPK通路中部分蛋白相互作用促进肿瘤发展,可能成为核素治疗的潜在靶点。

99mTc-GE11分子探针在荷人肺腺癌裸鼠体内分布及受体显像研究

目的制备靶向肺腺癌细胞跨膜表达蛋白表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)的核素分子探针99mTc-GE11,鉴定其理化性质并探讨其在荷瘤裸鼠体内分布及显像情况。方法采用氯化亚锡氧化还原法对GE11进行99mTc标记,初步鉴定其标记率、比活度、放化纯度及稳定性等,并观察多肽标记物在荷瘤裸鼠体内的生物分布及显像情况。结果 99mTc-GE11标记率为(93.12±0.83)%,比活度为(24.21±0.42)TBq/mmol。体外室温放置6、12 h后,其放化纯度仅下降了2.14%、3.11%。Sephadex G50柱层析后,其与血浆蛋白结合率为4.8%;与不同浓度半胱氨酸37℃温育1 h后,未结合99mTc含量无明显变化;脂/水分配系数lgP为(-1.87±0.05);荷瘤裸鼠体内生物分布及SPECT显像示:99mTc-GE11在血液、肾脏中的放射性清除迅速,肿瘤组织可以选择性浓聚99mTc-GE11,在注射1.0 h时,肿瘤/肌肉比值达到最大,且肿瘤组织显影最清晰。结论制备的99mTc-GE11小分子多肽探针理化特性理想,在荷人肺腺癌裸鼠模型中显像较好。

长链非编码RNA-核富集转录本1对创伤性脑损伤小鼠的神经保护作用及其可能机制

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)核富集转录本1(NEAT1)的表达对创伤性脑损伤(TBI)后神经功能和神经元凋亡的影响及其可能机制。方法将90只C57BL/6J小鼠按随机数字表法分为假手术组、空白对照组、空载病毒1组和2组及NEAT1上调组和NEAT1下调组,每组15只。构建小鼠控制性皮层撞击(CCI)模型模拟TBI状态,并通过侧脑室内注射腺病毒载体对NEAT1水平进行干预。采用神经功能缺失评分(NSS)及Morris水迷宫试验评估空白对照组、NEAT1上调组和NEAT1下调组小鼠伤后1周内及14~21d时神经功能变化。Western blot检测空白对照组小鼠皮层含死亡结构域的p53诱导蛋白1(Pidd 1)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶(caspase)-2、caspase-9和caspase-3在伤后6 h、1,3,7 d的表达。TUNEL法检测空白对照组、NEAT1上调组和NEAT1下调组伤后第3天小鼠神经元凋亡情况及免疫荧光半定量分析Pidd1的表达及定位。Western blot检测假手术组、空白对照组、空载病毒组、NEAT1上调组及NEAT1下调组小鼠伤后第3天Pidd1、caspase-2、细胞色素c(Cyt c)和caspase-3蛋白表达量。结果与空白对照组[(4.9±1.0)分]比较,NEAT1上调组伤后第1天NSS[(3.5±0.7)分]显著降低(P<0.01),NEAT1下调组[(5.0±1.5)分]显著升高(P<0.01)。Morris水迷宫试验显示,与空白对照组[(20.1±5.6)s]比较,伤后第19天NEAT1上调组寻找平台时间[(10.9±2.8)s]缩短(P<0.05),NEAT1下调组寻找平台时间[(30.7±6.2)s]延长(P<0.01)。Western blot提示,空白对照组Pidd1、caspase-2、caspase-9和caspase-3在伤后第3天表达明显升高(P<0.01)。通过TUNEL得到伤后第3天NEAT1上调组神经元凋亡率[(18.0±2.7)%]明显下降,而NEAT1下调组[(63.0±8.6)%]明显升高(P<0.01)。伤后第3天免疫荧光提示,与空白对照组比较,NEAT1上调组神经元胞质中Pidd1蛋白表达[(22.7±2.2)%]减少(P<0.01),而NEAT1下调组[(72.7±7.0)%]显著增加(P<0.01)。伤后第3天Western blot显示,与空白对照组比较,NEAT1上调组Pidd1(0.5±0.0)、capsase-2(0.3±0.0)、Cyt c(0.5±0.0)及caspase-3(0.4±0.0)的表达明显减少(P<0.01);而NEAT1下调组结果则完全相反。结论TBI后NEAT1通过调控Pidd1-caspase-2-Cyt c,减少caspase-3活化,抑制神经元凋亡,这可能是TBI后NEAT1保护神经功能的机制之一。

基于免疫基因的RNA-seq数据构建结直肠癌预后生存预测模型

目的筛选结直肠癌预后相关免疫基因并构建预后预测模型。方法从ImmPort数据库中收集免疫相关基因。来自The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库的Colon adenocarcinoma(COAD)数据集用于识别预后基因特征并构建预后生存预测模型,该特征在来自Gene Expression Omnibus(GEO)数据集中得到验证。进行基因功能富集分析。结果差异表达分析共得到362个在结直肠癌患者中差异表达的免疫相关基因;单因素COX回归筛选得到32个预后相关免疫基因,功能富集结果显示其与T细胞介导的免疫,T细胞介导的细胞毒性的上调等正相关;多因素COX回归最终确定SCTR、XCL1、NGF、CD1B、EREG为结直肠癌关键预后风险免疫基因,通过5个基因构建的预后生存预测模型对结直肠癌患者的预后情况具有良好的预测率。结论免疫相关的五基因特征是COAD患者的可靠预后指标,可为个性化癌症管理提供见解。