珠江口海域叶绿素a质量浓度SAR反演模型

以珠江口海域的Radarsatt-2全极化SAR数据和海域表层水面叶绿素a质量浓度实测数据为基础,利用微波散射原理及Cloude Pottier理论对SAR图像进行分解,得到平均散射角a、散射熵H及VH、VV、HH、HV等6个参数;采用BP人工神经网络模型建立上述6个参数与叶绿素a质量浓度的数学关系模型,并结合实测数据对叶绿素a质量浓度进行分类。结果表明:当隐含层节点数为9,输入层和隐含层传递函数分别为tansig和logsig,学习速率和动量系数均为0.2时的网络结构对叶绿素质量浓度反演取得了较好的效果,叶绿素a质量浓度实测值与预测值之间的决定系数(R^2)为0.826。将模型应用于不同时期的2幅图像进行验证,效果良好,与实际情况基本相符。

8个Gilbert综合征家系UGT1A1变异谱调查及分析

目的研究中国人群Gilbert综合征与UGT1A1基因变异的关系。方法选取8个Gilbert综合征家系成员外周静脉血提取基因组DNA,采用聚合酶链反应（PCR）扩增UGT1A1基因上游的启动子TATA盒及第1-5外显子序列,PCR产物测序后行遗传变异分析;并对先症者进行1年以上的随访观察。结果在6个完整的核心家系中,先症者双亲的发病率仅为25%（〈50%）。4例先症者各有1名兄妹,其中1例先症者的同卵双胎也发病,而其余3例先症者只有1例的弟弟发病。1个家系第2代4名女性中只有1人发病。共检测到3个错义突变位点（c.211G〉A,p.G71R,rs4148323;c.686C〉A,p.P229Q,rs35350960;c.1091C〉T,p.P364L,rs34946978）和1个位于启动子区TATA盒的2个额外碱基TA插入变异（c.-40_-39ins TA,rs3064744）。所有15例患者中（包括8例先症者和7个家系成员）,12例携带UGT1A1的纯合变异或2个无连锁（1个来自父亲,1个来自母亲）的杂合变异（12/15）,3例患者仅携带单个UGT1A1基因的杂合变异;而携带单个杂合变异的14个家系成员中仅有1人表现为Gilbert综合征,其余13人胆红素水平均正常。结论 Gilbert综合征与UGT1A1的变异相关,并呈现出叠加效应,携带纯合变异或2个不连锁杂合（c.-40_-39ins TA/c.211G〉A;c.211G〉A/c.1091C〉T）变异者容易表现为Gilber综合征,而大多数携带单个杂合变异者则表现为正常。

P364L突变降低UGT1A1酶对非结合胆红素的催化活性

目的研究尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶1A1的P364L突变型(c.1091 C>T)对催化非结合胆红素葡糖醛酸化的影响。方法构建含有UGT1A1编码序列的野生型和P364L突变型质粒,转染HEK293细胞,表达野生型与突变型蛋白;Western blot验证野生型和P364L突变型蛋白表达情况;超声裂解细胞提取表达蛋白;设计两组反应,野生型为对照组,P364L突变型为实验组,分别催化非结合胆红素反应,HPLC定量检测两组中非结合胆红素浓度变化情况。结果对照组中非结合胆红素的浓度随着时间的延长呈逐渐下降的趋势,而结合胆红素的浓度随时间延长逐渐升高;实验组中非结合胆红素浓度下降程度远小于对照组,未见明显的结合胆红素峰值;反应30 min时计算酶的活性P364L突变型为野生型的14.2%。结论突变酶UGT1A1-P364L催化非结合胆红素能力较野生型明显降低。

基于多极化后向散射系数的海洋悬浮物反演研究

以珠江口东岸香港海域为研究对象,准同步获取实测悬浮物浓度和Radarsat-2影像数据。对影像进行滤波处理和掩模处理后,利用Radarsat-2四种极化下的后向散射系数建立悬浮物浓度单极化回归模型;通过多极化后向散射系数构造多个遥感参数,运用相关性分析得到4个敏感因子,建立悬浮物浓度多极化回归模型。最终得到研究区域悬浮物浓度的反演模型为:SSC=11.08+0.06(HH+VV)-0.002(HH+VV)2,R2=0.84,其中SSC为悬浮物浓度,HH和VV为该极化下的后向散射系数,R2为决定系数。研究表明:HH和VV极化的后向散射系数之和对研究区域悬浮物反演最为敏感,得到的反演模型能较好预测海洋悬浮物的分布情况。

Gilbert综合征UGT1A1致病变异的连锁关系研究

目的明确Gilbert综合征患者(Gilbert syndrome,GS)UDP-葡萄糖醛酸基转移酶1A1基因(UDP-glucuronyl transferase 1A1 gene,UGT1A1)致病变异的连锁关系,进一步明确GS的遗传机制。方法对46例GS患者与80名健康对照者UGT1A1基因的增强子PBREM、启动子TATA盒、PE、DE及外显子进行直接测序,把所测得的SNP进行连锁不平衡分析、并构建单体型和单体基因型进行分析。结果共测到c.-3279T>G、c.-1352C>A、c.-40_-39insTA、c.211G>A、c.686C>A、c.1456T>G等6个SNP位点,对该6个SNP位点进行连锁不平衡分析表明c.-3279T>G和c.-1352C>A的D’值和r^2均等于1,呈完全的连锁不平衡;进一步构建单体型表明c.-40_-39insTA和c.-3279T>G呈连锁关系、c.211G>A和c.-1352C>A呈连锁关系,他们所构成的单体基因型在病例组中的频率高达0.717,而在对照组中的频率仅为0.005,两者具有显著的统计学差异,P<0.000。结论 Gilbert综合征的发生与来源于不同同源染色体的c.-40_-39insTA和c.211G>A的两两变异相关,而c.-3279T>G和c.-1352C>A与它们的各自连锁发挥了剂量效应作用。

利用PROSPECT+SAIL模型反演植物生化参数的植被指数优化模拟

分析3个植被生化参数(叶绿素含量、叶片含水量和叶面积指数)对冠层光谱反射率变化的敏感程度以及影响波段区间,选择3个植被指数作为代价函数的优化比较对象,然后运用微粒群算法和PROSPECT+SAIL模型分别反演叶绿素含量、叶片含水量和叶面积指数.结果表明:基于植被指数作为优化比较对象的模型反演效率较全波段方法有所提高;叶绿素含量、叶片含水量和叶面积指数反演值与实测值的复相关系数分别为90.8%、95.7%和99.7%,均方根误差分别为4.73μg·cm-2、0.001g·cm-2和0.08.采用植被指数作为优化比较对象可有效地提高基于PROSPECT+SAIL模型反演植被生化参数的精度和效率.

Spatial-time continuous changes simulation of crop growth parameters with multi-source remote sensing data and crop growth model

本文将遥感信息与作物模型同化实现作物生长参数的时空域连续模拟,进而监测生长参数的时空域变化。首先将作物模型WOFOST(World food studies)与冠层辐射传输模型PROSAIL耦合构建WOPROSAIL模型,利用微粒群算法(PSO)通过最小化从CCD数据获取的土壤调节植被指数观测值SAVI(soil adjusted vegetation index)与耦合模型得到的模拟值SAVI’之间差值优化作物模型初始参数。通过MODIS数据反演实现参数的区域化,并将区域参数作为优化后作物模型输入参数驱动模型逐像元计算生长参数,实现生长参数的时空域连续模拟与监测,最终建立区域尺度遥感-作物模拟同化框架模型RS-WOPROSAIL。结果表明:同化模型解决了作物模型模拟空间域和遥感信息时间域的不连续问题。模型模拟的叶面积指数(LAI)、穗重(WSO)、地上总生物量(TAGP)等生长参数较好地体现了水稻生长状况时空域变化,研究区水稻模拟产量与实际产量的误差为27.4%。

探索1例依非韦伦相关药物性肝损伤的遗传代谢因素

目的探索1例依非韦伦(EFV)相关药物性肝损伤的获得性免疫缺陷综合征(AIDS)患者在停药2个月后仍进展为重度肝炎的遗传代谢因素。方法回顾性分析该院收治的1例已接受2个月EFV治疗(600 mg/d,口服)且停药后仍进展为重度肝炎的AIDS患者资料,对其细胞色素氧化酶P450亚型CYP2B6基因的外显子进行一代测序。结果患者CYP2B6基因存在c.516G>T的杂合变异。结论CYP2B6基因c.516G>T的杂合变异患者高剂量服用EFV可进展为重度肝炎,临床需重视患者基因型并个性化给药。