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不结球白菜Ty1-copia类逆转座子序列的克隆及表达
被引量:
7
1
作者
肖栋
侯喜林
+3 位作者
马景蕃
王枫
齐莉
李音孜
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期643-649,共7页
参照Tyl-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物,分别从10个不结球白菜(Brassica campestris ssp.chinensis)品种的全基因组中均扩增出260bp左右的目标条带。将目的条带回收、克隆和测序后进行分析,DNAstar分析发现,这些...
参照Tyl-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物,分别从10个不结球白菜(Brassica campestris ssp.chinensis)品种的全基因组中均扩增出260bp左右的目标条带。将目的条带回收、克隆和测序后进行分析,DNAstar分析发现,这些序列存在高度的异质性,28个核苷酸序列变化范围为224~278bp,同源性范围为16.7%~83.0%。28条序列通过核苷酸聚类分为8个家族。推导氨基酸序列有移框突变、终止子突变或二者兼有;与已登录的不同物种同一类型逆转录酶氨基酸系统进化树分析表明,不结球白菜Tyl-copia类逆转座子与芥菜型油菜、拟南芥、芜菁、甜菜可能有共同的起源。半定量和实时定量PCR检测表明,水杨酸(salicylicacid)和Peronospora parasitica均能激活不结球白菜Tyl-copia类逆转座子,逆转座子在不结球白菜叶片中的表达特征说明它可能参与寄主对病原菌的抗性。
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关键词
不结球白菜
Ty1-copia类逆转座子
逆转录酶
异质性
活性分析
下载PDF
职称材料
题名
不结球白菜Ty1-copia类逆转座子序列的克隆及表达
被引量:
7
1
作者
肖栋
侯喜林
马景蕃
王枫
齐莉
李音孜
机构
南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期643-649,共7页
基金
江苏省自然科学基金创新学者攀登项目(BK2008035)
文摘
参照Tyl-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物,分别从10个不结球白菜(Brassica campestris ssp.chinensis)品种的全基因组中均扩增出260bp左右的目标条带。将目的条带回收、克隆和测序后进行分析,DNAstar分析发现,这些序列存在高度的异质性,28个核苷酸序列变化范围为224~278bp,同源性范围为16.7%~83.0%。28条序列通过核苷酸聚类分为8个家族。推导氨基酸序列有移框突变、终止子突变或二者兼有;与已登录的不同物种同一类型逆转录酶氨基酸系统进化树分析表明,不结球白菜Tyl-copia类逆转座子与芥菜型油菜、拟南芥、芜菁、甜菜可能有共同的起源。半定量和实时定量PCR检测表明,水杨酸(salicylicacid)和Peronospora parasitica均能激活不结球白菜Tyl-copia类逆转座子,逆转座子在不结球白菜叶片中的表达特征说明它可能参与寄主对病原菌的抗性。
关键词
不结球白菜
Ty1-copia类逆转座子
逆转录酶
异质性
活性分析
Keywords
Brassica campestris ssp. chinensis
Ty1-copia-like retrotransposons
reverse transcriptase
heter- ogeneity
experssion analysis
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不结球白菜Ty1-copia类逆转座子序列的克隆及表达
肖栋
侯喜林
马景蕃
王枫
齐莉
李音孜
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
7
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