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基于网络药理学和分子对接探究喻氏凉茶抗炎的作用机理
1
作者
张津浩
陈彦超
+5 位作者
徐楠
喻文定
李鸣翰
饶力群
彭国平
汪启明
《特产研究》
2024年第1期62-71,共10页
本研究旨在通过网络药理学的方法,解析喻氏凉茶清热解毒的关键靶点及分子作用机制。通过TCMSP数据库挖掘获得喻氏凉茶中药材的有效成分,运用Uniprot和GeneCards数据库获得与药效成分互作的炎症靶点基因,对交集靶点进行GO功能富集分析以...
本研究旨在通过网络药理学的方法,解析喻氏凉茶清热解毒的关键靶点及分子作用机制。通过TCMSP数据库挖掘获得喻氏凉茶中药材的有效成分,运用Uniprot和GeneCards数据库获得与药效成分互作的炎症靶点基因,对交集靶点进行GO功能富集分析以及KEGG信号通路分析。利用Cytoscape 3.7.2软件构建“药材-成分-靶点”网络关系图。通过STRING平台构建蛋白-蛋白互作网络(Protein-protein interaction,PPI),利用Cytoscape 3.7.2进行拓扑分析,确定喻氏凉茶抗炎的核心靶点。利用AutoDockTools-1.5.7将喻氏凉茶抗炎核心靶点与对应的药物有效成分进行分子对接,运用Discovery Studio 2019可视化。从喻氏凉茶10种药材中共获得139种有效成分,297个作用靶点基因。PPI互作网络的核心靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、过氧化物酶体增殖受体(PPARG)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、过氧化氢酶(CAT)、信号传导及转录激活蛋白3(STAT3)。GO功能富集分析与KEGG信号通路分析表明,靶点基因涉及876个生物过程,83个分子功能、36个细胞组分以及119条通路。分子对接结果表明,核心靶点与相应的有效成分有结合活性。本研究初步探究了喻氏凉茶抗炎的多成分、多靶点、多通路的作用机制,为解析喻氏凉茶清热解毒功效提供了理论支撑,为后续的深入开发利用奠定了基础。
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关键词
网络药理学
喻氏凉茶
消炎
有效成分
分子机制
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接探究喻氏凉茶抗炎的作用机理
1
作者
张津浩
陈彦超
徐楠
喻文定
李鸣翰
饶力群
彭国平
汪启明
机构
湖南农业大学生物科学技术学院
湖南喻氏健康产业有限公司
出处
《特产研究》
2024年第1期62-71,共10页
基金
湖南省高层次聚集工程创新创业人才项目(2021RC5006)
湖南农业大学“双一流”建设基金项目(SYL2019021)。
文摘
本研究旨在通过网络药理学的方法,解析喻氏凉茶清热解毒的关键靶点及分子作用机制。通过TCMSP数据库挖掘获得喻氏凉茶中药材的有效成分,运用Uniprot和GeneCards数据库获得与药效成分互作的炎症靶点基因,对交集靶点进行GO功能富集分析以及KEGG信号通路分析。利用Cytoscape 3.7.2软件构建“药材-成分-靶点”网络关系图。通过STRING平台构建蛋白-蛋白互作网络(Protein-protein interaction,PPI),利用Cytoscape 3.7.2进行拓扑分析,确定喻氏凉茶抗炎的核心靶点。利用AutoDockTools-1.5.7将喻氏凉茶抗炎核心靶点与对应的药物有效成分进行分子对接,运用Discovery Studio 2019可视化。从喻氏凉茶10种药材中共获得139种有效成分,297个作用靶点基因。PPI互作网络的核心靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、过氧化物酶体增殖受体(PPARG)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、过氧化氢酶(CAT)、信号传导及转录激活蛋白3(STAT3)。GO功能富集分析与KEGG信号通路分析表明,靶点基因涉及876个生物过程,83个分子功能、36个细胞组分以及119条通路。分子对接结果表明,核心靶点与相应的有效成分有结合活性。本研究初步探究了喻氏凉茶抗炎的多成分、多靶点、多通路的作用机制,为解析喻氏凉茶清热解毒功效提供了理论支撑,为后续的深入开发利用奠定了基础。
关键词
网络药理学
喻氏凉茶
消炎
有效成分
分子机制
Keywords
network pharmacology
Yu's herbal tea
anti-inflammatory
active ingredients
molecular mechanism
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
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1
基于网络药理学和分子对接探究喻氏凉茶抗炎的作用机理
张津浩
陈彦超
徐楠
喻文定
李鸣翰
饶力群
彭国平
汪启明
《特产研究》
2024
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