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题名基于转录组分析白术倍半萜生物合成的相关基因
被引量:9
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作者
杨国
李鸿慧
金叶飞
董丽佳
莫亿伟
罗洁
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机构
绍兴文理学院生命科学学院
绍兴文理学院元培学院
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出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期1827-1838,共12页
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基金
国家自然科学基金(31700476)
浙江省教育厅项目(Y2019-41025)
绍兴市教学建设与改革项目(SXSKG2018069).
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文摘
本研究通过GC-MS分析了白术挥发油中倍半萜的种类,同时利用Illumina高通量测序技术对白术叶、茎、块根和花的混合样品进行了测序,最后对白术萜类骨架合成酶以及倍半萜合成酶有关基因的表达进行了实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析。研究结果显示,白术倍半萜成分主要为苍术酮和8,9-去氢新异长叶烯,转录组测序共获得了23099928条有效短读序,组装后获得100037条Unigene,Q30值为93.48%,N50长度为1027.2bp。将拼装所得到的Unigene序列利用BLAST工具分别与NR、Swiss-Prot、KEGG、KOG、COG和GO数据库进行比对,共有54471条Unigene序列被注释,占总序列数的54.45%。对注释得到的Unigene进行KEGG代谢通路分析,共涉及133个KEGG代谢通路,其中81条Unigene参与了萜类骨架生物合成,18条Unigene参与了倍半萜生物合成。利用MISA软件发现12124个SSR,其中单碱基重复SSR共6028个,双碱基重复SSR共3866个。本研究对6个倍半萜合成相关的基因进行qRT-PCR分析,发现其中4个在白术块根中的表达量显著高于叶、茎和花中的表达量。
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关键词
白术
挥发油
倍半萜
转录组测序
SSR
QRT-PCR
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Keywords
Atractylodes macrocephala
volatile oil
sesquiterpenes
RNA-seq
SSR
qRT-PCR
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分类号
S567.239
[农业科学—中草药栽培]
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题名朋友
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作者
李鸿慧
林丙程(指导老师)
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机构
浙江瑞安市塘下镇起点文学社
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出处
《中国少年儿童(小记者版)》
2013年第5期37-37,共1页
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文摘
小男孩因为一场车祸,双腿残疾。爸妈把家搬到了山脚下的竹林边,让他每天都能够听到风吹过竹林的沙沙声。
一天,阳光灿烂,小男孩摇着轮椅到竹林里去透气,他抚摸着自己的双腿,感到一丝惆怅。这时,竹林中传出了沙沙的声音。绿色的竹叶被分开了,一只毛色黑白相问的动物出现了。熊猫!小男孩很高兴,但又有点害怕,他曾经在教科书上了解到,熊猫是杂食动物,挺凶的。
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关键词
朋友
竹林
男孩
教科书
动物
熊猫
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分类号
Q95
[生物学—动物学]
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