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梨小食心虫雄成虫、蛹和幼虫的转录组比较分析 被引量:4
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作者 李亦松 杜兴辉 +1 位作者 张子旭 蔡登鑫 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1320-1330,共11页
为挖掘杀虫剂靶标及解毒代谢和抗药性相关基因,利用高通量测序技术对梨小食心虫Grapholita molesta雄成虫、蛹和幼虫进行转录组测序和数据组装,并对转录组数据进行功能注释和比较分析。结果表明,对梨小食心虫雄成虫、蛹和幼虫测序所得... 为挖掘杀虫剂靶标及解毒代谢和抗药性相关基因,利用高通量测序技术对梨小食心虫Grapholita molesta雄成虫、蛹和幼虫进行转录组测序和数据组装,并对转录组数据进行功能注释和比较分析。结果表明,对梨小食心虫雄成虫、蛹和幼虫测序所得高质量reads组装得到195473个转录本,含有158206条unigene,其中有71762条unigene在至少1个数据库中能获得功能注释,有8186条unigene在所有数据库中均能获得注释,分别占unigene总数的45.36%和5.17%。在GO数据库中共有45810条unigene的注释划分到56个不同功能区中,鉴定到240个与解毒代谢相关的基因,包括61个羧酸酯酶(carboxylesterases,CarE)基因、38个谷胱甘肽-S-转移酶(glutathione S-transferase,GST)基因、92个细胞色素P450酶基因和49个ABC转运蛋白基因。雄成虫和蛹之间共注释到262个代谢通路,包括42143个基因,其中差异表达基因有1561个;蛹和4龄幼虫之间共注释到232个代谢通路,包括39127个基因,其中差异表达基因有1095个;雄成虫和4龄幼虫之间共注释到235个代谢通路,包括41436个基因,其中差异表达基因有1582个。选择ABC转运蛋白基因进行深入分析,可划分为8个亚家族;对6个ABC转运蛋白基因进行实时荧光定量PCR验证,显示其表达情况与转录组分析结果基本一致,表明转录组分析结果可靠。 展开更多
关键词 梨小食心虫 发育阶段 转录组 基因注释 抗药性
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