期刊文献+
共找到16篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
A+C群脑膜炎球菌多糖疫苗免疫效果观察 被引量:6
1
作者 郭雪 朱宝兰 +9 位作者 杨天英 陈锐 吴传华 刘全银 李凤祥 杜宗利 李亚楠 袁曾麟 汪燕 武玉 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2000年第4期249-250,共2页
目的 观察法国A +C群脑膜炎球菌多糖疫苗对 7~ 14岁儿童接种后的安全性、免疫原性和免疫持久性。方法 观察组 6 0人 ,接种剂量为 10 0 μg/ 0 .5ml/人 ,对照组 30人接种维生素B1;免疫前、免疫后 1月、1年、2年和 3年分别收集血液标... 目的 观察法国A +C群脑膜炎球菌多糖疫苗对 7~ 14岁儿童接种后的安全性、免疫原性和免疫持久性。方法 观察组 6 0人 ,接种剂量为 10 0 μg/ 0 .5ml/人 ,对照组 30人接种维生素B1;免疫前、免疫后 1月、1年、2年和 3年分别收集血液标本 ,用ELISA方法进行抗体水平检测。结果 疫苗接种后人体反应轻微 ,6 0人中仅 2人(3.3% )出现中度发烧 ,有 3人 (5 % )出现局部红晕 ,48h后反应全部消失。免疫后 1个月 ,A群和C群抗体 4倍增长率分别为 94.4%和 96 .3% ;免疫后 1年、2年和 3年 ,A群和C群抗体 4倍增长率均为 10 0 %。结论 该疫苗较安全 ,免疫原性较强 ,且更具免疫持久性。 展开更多
关键词 脑膜炎球菌多糖疫苗 免疫原性 免疫持久性
下载PDF
致病性钩端螺旋体的多位点序列分型研究 被引量:3
2
作者 李喆 张影 +3 位作者 杜宗利 辛晓芳 叶强 徐颖华 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期95-101,共7页
目的通过对致病性钩端螺旋体(简称钩体)多位点序列分型(MLST)分析,了解国内与全球致病性钩体种群结构及其分子进化。方法应用16S rRNA基因测序和MLST分析方法对不同来源、不同时期国内钩体分离菌株与国际参考菌株进行分析,并与国内7株... 目的通过对致病性钩端螺旋体(简称钩体)多位点序列分型(MLST)分析,了解国内与全球致病性钩体种群结构及其分子进化。方法应用16S rRNA基因测序和MLST分析方法对不同来源、不同时期国内钩体分离菌株与国际参考菌株进行分析,并与国内7株疫苗株结果平行比较,同时收集已公开的来自不同国家和不同时期1238株致病性钩体的基因种与MLST数据进行种群结构分析。结果16S rRNA基因测序分析结果显示7株钩体国际参考菌株和47株国内菌株基因种主要为问号基因种,分别占比71.4%和59.6%。7株国际参考菌株呈现7种不同ST型。而在47株中国钩体分离株中,发现15种ST型及24种尚未报道的新ST型。MLST聚类分析发现问号、波氏和卫氏基因种菌株均各自形成单独分支。7株不同ST的疫苗株也位于问号基因种内不同亚分支中。系统发育进化树表明世界范围内近百年分离的1238株钩体菌株主要包括16个进化簇,分别为ST17、ST34、ST149、ST1和ST37等,而中国236株钩体菌株可分为4个主要进化簇,主要流行基因型为ST1、ST128、ST17和ST143;不同国家流行菌株的基因种和ST型不尽相同。致病性钩体可在不同宿主物种广泛地交叉感染,不同国家间相互传播。结论获得我国致病性钩体基因种和MLST基因多态性资料,并系统地了解国内和全球致病性钩体种群结构和遗传进化关系,为后续致病性钩体监测和溯源提供科学指导。 展开更多
关键词 致病性钩体 多位点序列分型 16S rRNA基因测序 进化簇 系统发育
下载PDF
乳酶生生产用菌种的全基因组序列分析研究 被引量:5
3
作者 王珊珊 石继春 +4 位作者 杜宗利 石刚 龙新星 徐颖华 叶强 《中国医药生物技术》 2020年第6期577-583,共7页
目的了解我国乳酶生的生产用菌种全基因组分子特征。方法将乳酶生的生产用菌种屎肠球菌CMCC32901培养后,依次进行形态观察、生化鉴定与16S rRNA基因序列测定,并应用高通量测序技术,对生产用菌种CMCC32901进行全基因组序列测定,分析基因... 目的了解我国乳酶生的生产用菌种全基因组分子特征。方法将乳酶生的生产用菌种屎肠球菌CMCC32901培养后,依次进行形态观察、生化鉴定与16S rRNA基因序列测定,并应用高通量测序技术,对生产用菌种CMCC32901进行全基因组序列测定,分析基因组基本特征、基因功能、同源性及致病性。结果分析结果显示,发现CMCC32901菌株与NCBI数据库中收录的不同屎肠球菌菌株的16Sr RNA基因序列相似度大于99.5%,与其他肠球菌菌株之间的16S rRNA基因序列相似度均大于92.0%。屎肠球菌CMCC32901染色体全基因组序列全长为2 394 726 bp,平均GC含量为39.1%,共含有2718个基因,其中具有COG功能2059个,参与KEGG代谢通路1402个。同源性分析显示其基因组中编码2589个屎肠球菌特异性蛋白。细菌的致病性预测分析发现在CMCC32901菌株中发现5种对人潜在致病性相关蛋白。结论首次获得了我国乳酶生生产用菌种——屎肠球菌CMCC32901全基因组的基本特征,为后续乳酶生的生产工艺优化和生产用菌种的质量控制奠定了基础。 展开更多
关键词 乳酶生 屎肠球菌 生产用菌种 全基因组序列 质量控制
下载PDF
粪肠球菌核酸检测试剂国家参考品的研制 被引量:1
4
作者 王春娥 石继春 +5 位作者 徐潇 刘茹凤 杜宗利 龙新星 徐颖华 叶强 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2021年第12期4801-4806,共6页
目的研制粪肠球菌核酸检测试剂的国家参考品。方法将9株粪肠球菌和8株非粪肠球菌参考品候选菌株分别在各自适宜的培养条件下培养,收集新鲜培养物进行计数、灭活、稀释和分装,并对参考品进行均匀性和稳定性评估。组织3家实验室对研制的... 目的研制粪肠球菌核酸检测试剂的国家参考品。方法将9株粪肠球菌和8株非粪肠球菌参考品候选菌株分别在各自适宜的培养条件下培养,收集新鲜培养物进行计数、灭活、稀释和分装,并对参考品进行均匀性和稳定性评估。组织3家实验室对研制的参考品进行了协作标定。结果研制了由9份阳性候选参考品、8份阴性候选参考品、重复性参考品和最低检出限参考品组成的粪肠球菌参考品。阳性参考品、最低检出限参考品和重复性参考品循环阈值(cycle threshold, Ct)的变异系数(coefficient of variation, CV)均在5.0%以内,分装均匀性良好;参考品各成分的稳定性良好(P值均小于0.05);协作标定结果显示阳性参考品符合率及阴性参考品符合率均为100%,重复性参考品检测Ct值的CV均在5.0%以内,参考品最低检出限为1.0×10^(3)个/mL。结论研制的参考品可用于粪肠球菌核酸检测试剂的质量评价。 展开更多
关键词 粪肠球菌 核酸 国家参考品 均匀性 稳定性 协作标定
下载PDF
铅黄肠球菌CMCC(B)32220的鉴定和全基因组分析 被引量:1
5
作者 石继春 陈驰 +6 位作者 梁丽 杜宗利 龙新星 郑锐 孙文媛 徐颖华 叶强 《临床检验杂志》 CAS 2022年第2期116-119,共4页
目的应用多种方法对CMCC(B)32220鉴定和分析,了解其全基因组的分子特征。方法将待鉴定菌株CMCC(B)32220复苏培养后,依次进行形态学、全自动生化鉴定、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析、16S rRNA基因以及全基因序列... 目的应用多种方法对CMCC(B)32220鉴定和分析,了解其全基因组的分子特征。方法将待鉴定菌株CMCC(B)32220复苏培养后,依次进行形态学、全自动生化鉴定、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析、16S rRNA基因以及全基因序列测定,应用生物信息学方法分析其基因组基本特征,并预测基因功能、耐药性及致病性。结果经全自动生化和MALDI-TOF-MS鉴定分析菌株CMCC(B)32220均为铅黄肠球菌。CMCC(B)32220菌株与NCBI数据库中已发表2株代表性铅黄肠球菌16S rRNA基因序列相似度分别为99.4%和98.9%,而与不同肠球菌16S rRNA基因序列相似度为94.8%~98.7%。CMCC(B)32220染色体全基因组序列全长为3195952 bp,包含3054个基因,其中具有直系同源簇(COG)功能2453个,参与KEGG代谢通路1622个。而基于全基因组水平的平均核苷酸一致性(ANI)分析证实CMCC(B)32220菌株与已发表的铅黄肠球菌的ANI值为95.1%,而与其他3株肠球菌属不同种(屎肠球菌、鸡肠球菌和粪肠球菌)代表性菌株基因组的ANI值均小于80%。预测蛋白质同源性分析表明其基因组中编码2772个(占93.7%)铅黄肠球菌特异性蛋白质。其基因组仅含2种耐药基因,并存在5种对人潜在致病性相关蛋白质。结论应用多种不同原理方法成功系统鉴定CMCC(B)32220符合铅黄肠球菌特征,并获得其全基因组的基本特征资料,为细菌标准菌株提供更多背景数据。 展开更多
关键词 铅黄肠球菌 平均核苷酸一致性 全基因组序列 标准菌株
下载PDF
不同血清群致病性钩端螺旋体PFGE分析研究
6
作者 李喆 张影 +3 位作者 杜宗利 叶强 徐颖华 辛晓芳 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期481-485,共5页
目的了解不同血清群致病性钩体的脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)带型特征。方法应用PFGE方法对65株不同血清群致病性钩体国际、国内参考菌株和疫苗株进行分型,并以此聚类分析,同时与菌株的多位点序列分型(multi... 目的了解不同血清群致病性钩体的脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)带型特征。方法应用PFGE方法对65株不同血清群致病性钩体国际、国内参考菌株和疫苗株进行分型,并以此聚类分析,同时与菌株的多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、多位点串联重复序列数变化分析(multilocus VNTR analysis,MLVA)分型结果进行比较研究。结果不同血清群致病性钩体基因组DNA经NotⅠ酶切电泳后,获得了较高清晰度酶切图谱,各条带分离良好。65株钩体菌株分为61种PFGE型别。相同的血清群的钩体菌株的PFGE型别不尽相同。比较分析结果显示尽管PFGE、MLST和MLVA之间的分型结果不尽相同,但都具有较高的分辨率。聚类分析显示这些菌株可形成11个大小不一进化簇,呈现多点分散进化特征。结论获得致病性钩体分子分型的第一手资料,为后续钩体分子溯源及流行病学研究提供科学指导。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型 多位点串联重复序列数变化分析 聚类分析
下载PDF
中国肺炎链球菌分型及其感染的研究
7
作者 丁绍卿 叶人邦 +1 位作者 袁曾麟 杜宗利 《医学研究杂志》 1989年第6期28-29,共2页
肺炎链球菌是引起肺炎、脑膜炎、中耳炎、心内膜炎、关节炎。以及化脓性疾患的重要病原菌,对人群的健康有严重的危害性,尤其对老年人及婴幼儿危害更大,病死率较高。耐药菌株的不断出现,已成为临床治疗中十分棘手的问题。近年来世界卫生... 肺炎链球菌是引起肺炎、脑膜炎、中耳炎、心内膜炎、关节炎。以及化脓性疾患的重要病原菌,对人群的健康有严重的危害性,尤其对老年人及婴幼儿危害更大,病死率较高。耐药菌株的不断出现,已成为临床治疗中十分棘手的问题。近年来世界卫生组织及许多国家对防治肺炎链球菌的感染极为关注,并研制成功了肺炎链球菌多糖菌苗,世界卫生组织还专门组织进行了全球性肺炎链球菌的菌型监测。 展开更多
关键词 链球菌分型 肺炎链球菌 菌型 耐药菌 体液标本 胆汁溶菌试验 敏感试验 心内膜炎 标准菌种 菌血症
下载PDF
腐生性钩端螺旋体Potoc菌株全基因组学分析
8
作者 张影 石刚 +3 位作者 李彬 杜宗利 辛晓芳 徐颖华 《中国医药生物技术》 2022年第6期497-502,共6页
目的 了解腐生性钩端螺旋体(简称钩体)Potoc菌株的全基因组分子特征。方法 将腐生性钩体Potoc菌株培养后,应用高通量测序技术进行全基因组序列测定和比较基因组学分析,并将Potoc菌株灭活菌液与国内15种不同血清群致病性钩体代表菌株的... 目的 了解腐生性钩端螺旋体(简称钩体)Potoc菌株的全基因组分子特征。方法 将腐生性钩体Potoc菌株培养后,应用高通量测序技术进行全基因组序列测定和比较基因组学分析,并将Potoc菌株灭活菌液与国内15种不同血清群致病性钩体代表菌株的兔血清进行免疫印迹分析。结果 腐生性钩体Potoc菌株全基因组序列全长为3 942 789 bp,共含有编码基因3685个,其中具有直系同源簇功能2052个,其平均GC含量为39.0%。比较基因组学分析发现Potoc菌株与国外已发表的腐生性钩体Ames菌株基因组核苷酸一致性高,同时也证实其基因组中并不存在O抗原生物合成基因簇(rfb)序列或类似基因。与问号基因种、波氏基因种和中间型L.licerasiae菌株存在共有基因1110个,而Potoc菌株基因组中所含有特有的基因共计2278个。免疫印迹分析结果发现Potoc菌株与致病性钩体中存在种属特异性的蛋白抗原成分。此外,基于全基因组水平的系统发育进化树显示,不同致病性钩体分为不同进化分支,具有特定进化历程。结论 获得了腐生性钩体Potoc菌株基因组的基本特征,探究了钩体属特异性抗原,揭示了不同基因种钩体基因组多样性,为后续致病性钩体的诊断和进化等研究奠定一定基础。 展开更多
关键词 腐生性钩端螺旋体 Potoc菌株 全基因组序列 诊断
下载PDF
中国肺炎链球菌标准菌株的筛选和建立
9
作者 张丽娟 袁曾麟 +2 位作者 杜宗利 肖忆梅 丁绍卿 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1990年第5期389-392,共4页
对我国自行分离的737株肺炎链球菌,依据生物学特性、地区分布及血清学分型进行筛选,选出297株具有典型特征的肺炎链球菌,建立了我国肺炎链球菌标准菌株。共分成42个群(型),其中有我国自行分离并保藏的二株国际上首次发现的新型10C 和16A... 对我国自行分离的737株肺炎链球菌,依据生物学特性、地区分布及血清学分型进行筛选,选出297株具有典型特征的肺炎链球菌,建立了我国肺炎链球菌标准菌株。共分成42个群(型),其中有我国自行分离并保藏的二株国际上首次发现的新型10C 和16A 致病性肺炎链球菌,以及国际上多年来未见到的19C 型、22A 型和仅在亚洲分离到的33C 型菌株。研究肺炎链球菌的血清学分型(群),建立标准分型菌株不仅有分类学的重要价值,而且对研究肺炎链球菌疾病的防治具有重要意义。 展开更多
关键词 肺炎链球菌 菌型
下载PDF
A群C群脑膜炎球菌结合疫苗的免疫效果 被引量:10
10
作者 李亚南 莫少军 +5 位作者 周富昌 梁丽 农艺 唐静 杜宗利 叶强 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2014年第8期1048-1051,共4页
目的 观察A群C群脑膜炎球菌结合疫苗对6~23月龄、24~35月龄婴幼儿的免疫原性和免疫持久性。方法 选择广西壮族自治区崇左市400名婴幼儿,其中6~23月龄和24~35月龄两个年龄段各200名,分别接种A群C群脑膜炎球菌结合疫苗2剂和1剂。分别... 目的 观察A群C群脑膜炎球菌结合疫苗对6~23月龄、24~35月龄婴幼儿的免疫原性和免疫持久性。方法 选择广西壮族自治区崇左市400名婴幼儿,其中6~23月龄和24~35月龄两个年龄段各200名,分别接种A群C群脑膜炎球菌结合疫苗2剂和1剂。分别于免疫前、全程免疫后1个月、1年采血,血清体外杀菌试验(serum bactericidal assay,SBA)检测血清抗体水平,评价其免疫原性和免疫持久性。结果 免后1个月和1年,两个年龄组婴幼儿A群、C群抗体阳性率和GMT均较免疫前显著提高(P均&lt;0.001);免后1年,两个年龄组婴幼儿A群、C群抗体GMT低于免后1个月,但仍高于免前;免后1个月和1年,24~35月龄组婴幼儿A群、C群抗体GMT和增长倍数均但,仍高于免前高于6~23月龄组;两个年龄组龄婴幼儿易感者和非易感者A群、C群抗体阳性率和GMT均显著提高。结论A群C群脑膜炎球菌结合疫苗对6~35月龄婴幼儿具有良好的免疫原性和免疫持久性。 展开更多
关键词 脑膜炎球菌结合疫苗 免疫原性 持久性
原文传递
钩端螺旋体疫苗菌种分子遗传质量控制方法的建立 被引量:2
11
作者 徐颖华 李喆 +3 位作者 张影 杜宗利 辛晓芳 叶强 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2018年第8期865-868,共4页
目的建立钩端螺旋体(简称钩体)疫苗菌种分子遗传质量的控制方法。方法采用PCR扩增7株钩体的7种管家基因序列,进行多序列位点分析(multilocus sequence typing,MLST),并系统评价不同传代次数菌种的分子遗传稳定性。同时组织协作标定,验证... 目的建立钩端螺旋体(简称钩体)疫苗菌种分子遗传质量的控制方法。方法采用PCR扩增7株钩体的7种管家基因序列,进行多序列位点分析(multilocus sequence typing,MLST),并系统评价不同传代次数菌种的分子遗传稳定性。同时组织协作标定,验证MLST方法用于疫苗菌种分子遗传质控的适用性。结果 7种钩体疫苗株呈现7种不同序列基因型。疫苗菌种在动物增毒前、后及在体外连续传代20代,细菌MSLT序列基因型未发生改变,证明钩体疫苗菌种具有良好的分子遗传稳定性。协作标定研究结果也表明,该方法具有良好的重复性,且结果易于标准化。结论建立了评价钩体疫苗菌种的分子遗传质控方法,疫苗菌株MLST序列基因型可作为一项候选的质量控制标准,完善了当前疫苗质控监管体系。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 疫苗菌种 质量控制 分子遗传 稳定性
原文传递
中国15群钩端螺旋体代表菌株分群血清参考品的研制 被引量:2
12
作者 徐颖华 李喆 +3 位作者 张影 杜宗利 辛晓芳 叶强 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2018年第9期974-976,共3页
目的研制中国15群钩端螺旋体代表菌株的分群血清参考品。方法制备1批冻干钩端螺旋体15群候选分群参考血清,与国内15株代表菌株进行显微镜凝集试验,同时组织协作标定,并对冻干候选制剂进行稳定性分析。结果冻干的血清候选参考品外观色泽... 目的研制中国15群钩端螺旋体代表菌株的分群血清参考品。方法制备1批冻干钩端螺旋体15群候选分群参考血清,与国内15株代表菌株进行显微镜凝集试验,同时组织协作标定,并对冻干候选制剂进行稳定性分析。结果冻干的血清候选参考品外观色泽均匀、形态饱满,水分含量均<3%。每个协作实验室检测结果的室内和室间变异系数(CV)均低于15%。各血清候选参考品于-20℃保存24个月的抗体滴度与协作标定及于-20℃保存12个月的结果差异无统计学意义(P>0.05)。结论研制的中国15群钩端螺旋体代表菌株分群血清参考品具有良好的稳定性,可用于钩体菌株血清分群和菌体疫苗鉴别试验。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 血清参考品 显微镜凝集试验 稳定性
原文传递
Leptospira alstoni致病性钩端螺旋体的多位点序列分析研究 被引量:3
13
作者 徐颖华 李喆 +2 位作者 杜宗利 辛晓芳 叶强 《实用预防医学》 CAS 2020年第7期879-880,共2页
目的探讨分析Leptospira alstoni致病性钩端螺旋体的基因型。方法应用多位点序列分析(multilocus sequence typing,MLST)技术研究仅在我国分离发现的三株Leptospira alstoni致病性钩端螺旋体的基因型,并与MLST数据库收录的当前中国流行... 目的探讨分析Leptospira alstoni致病性钩端螺旋体的基因型。方法应用多位点序列分析(multilocus sequence typing,MLST)技术研究仅在我国分离发现的三株Leptospira alstoni致病性钩端螺旋体的基因型,并与MLST数据库收录的当前中国流行血清群进行聚类分析。结果成功将三株菌株7个管家基因扩增出来,基因测序结果通过与MLST数据库比对,发现这三株菌株MLST结果并不能匹配数据库中已有MLST基因型,表明这三株菌株具有三种不同的MLST基因型。聚类分析结果显示这三株致病性钩端螺旋体形成一个独立的进化分析,与当前在中国流行的七种致病性钩端螺旋体血清群明显不同。结论发现三种不同致病性钩端螺旋体MLST基因型,这些结果为未来致病性钩端螺旋体分子分型、溯源奠定一定理论基础。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 多位点序列分析 基因型 血清群
原文传递
钩端螺旋体疫苗部分菌种分子特性及毒力分析 被引量:2
14
作者 徐颖华 杜宗利 +1 位作者 辛晓芳 叶强 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第12期1305-1308,共4页
目的 分析钩端螺旋体(简称钩体)疫苗部分菌种的分子特性及毒力。方法 应用多位点可变数量串联重复序列分析(multi locus variable number tandem repeat analysis,MLVA)方法,结合脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE... 目的 分析钩端螺旋体(简称钩体)疫苗部分菌种的分子特性及毒力。方法 应用多位点可变数量串联重复序列分析(multi locus variable number tandem repeat analysis,MLVA)方法,结合脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)技术,分析我国4株钩体疫苗弱毒株的分子特性;通过豚鼠动物模型攻击实验分析4株弱毒株的毒力。结果 4株钩体疫苗弱毒株经MLVA分析呈现4种不同的型;PFGE分析显示,经NotⅠ酶切,染色体呈现8~13个长度不等的片段;所有经弱毒株攻击动物的主要脏器均出现典型的钩体感染病变。结论 明晰了4株钩体疫苗弱毒株的分子特性及其对豚鼠的毒力,为完善该疫苗菌种的质量控制积累了资料。 展开更多
关键词 钩端螺旋体疫苗 菌毒种 质量控制 弱毒株
原文传递
右旋糖酐生产用菌种肠膜状明串珠菌CMCC(B)34991的全基因组分析
15
作者 王珊珊 石继春 +4 位作者 杜宗利 石刚 龙新星 叶强 徐颖华 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期666-670,677,共6页
目的对我国右旋糖酐生产用菌种肠膜状明串珠菌CMCC(B)34991的全基因组分子特征进行分析。方法将CMCC(B)34991菌种培养后,依次进行形态观察、生化鉴定、质谱分析及16S rRNA序列测定,同时应用高通量测序技术,对CMCC(B)34991菌种进行全基... 目的对我国右旋糖酐生产用菌种肠膜状明串珠菌CMCC(B)34991的全基因组分子特征进行分析。方法将CMCC(B)34991菌种培养后,依次进行形态观察、生化鉴定、质谱分析及16S rRNA序列测定,同时应用高通量测序技术,对CMCC(B)34991菌种进行全基因组序列测定和比较基因组学分析。结果CMCC(B)34991菌种与4种肠膜状明串珠菌亚种代表株的16S rRNA基因序列相似度均大于99.5%。CMCC(B)34991菌种染色体全基因组序列全长为1857684 bp,平均GC含量为38.2%,共含有2089个基因,编码基因占整个基因组序列的88.4%,其中具有直系同源簇(clusters of orthologous groups,COG)功能1621个,参与KEGG代谢通路1112个。CMCC(B)34991菌种与4种肠膜状明串珠菌亚种代表株之间核苷酸同源性很高,平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)值大于98.5%,DNA-DNA杂交(DDH)值超过89%,它们之间的共有基因1186个,而CMCC(B)34991菌种基因组特有基因247个。进化树显示,肠膜状明串珠菌与其他明串珠菌的分子进化历程不同。结论首次获得了我国右旋糖酐生产用菌种肠膜状明串珠菌CMCC(B)34991全基因组的基本特征,为后续右旋糖酐的生产工艺优化和生产用菌种的质量控制奠定了基础。 展开更多
关键词 右旋糖酐 肠膜状明串珠菌 生产用菌种 全基因组序列 质量控制
原文传递
1株致病性黄疸出血群钩端螺旋体病流行菌株与其同血清群疫苗株的比较基因组学分析
16
作者 李彬 石刚 +3 位作者 杜宗利 辛晓芳 叶强 徐颖华 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1432-1436,共5页
目的对1株致病性黄疸出血群钩端螺旋体(简称钩体)病流行菌株与其同血清群疫苗株进行比较基因组学分析。方法应用高通量测序技术对黄疸出血群钩体流行株200502(简称流行株200502)进行全基因组序列测定,并与其同血清群疫苗株56601进行比... 目的对1株致病性黄疸出血群钩端螺旋体(简称钩体)病流行菌株与其同血清群疫苗株进行比较基因组学分析。方法应用高通量测序技术对黄疸出血群钩体流行株200502(简称流行株200502)进行全基因组序列测定,并与其同血清群疫苗株56601进行比较基因组学分析;选取GenBank中已公布的包括疫苗株56601在内的9株不同基因种的代表性钩体菌株构建系统发育进化树。结果流行株200502全基因组序列全长为4543190 bp,含有编码基因3580个,其中具有直系同源簇(clusters of orthologous groups,COG)功能2192个。流行株200502与疫苗株56601基因组平均核苷酸一致性为99.2%,存在共有基因3245个,流行株200502含有特有基因242个。以疫苗株56601为参考,在流行株200502中共鉴定出2005个插入缺失(indel)和19799个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,其中编码区有8485个同义SNP位点、3484个非同义SNP位点,涉及菌株的细胞运动、信号转导机制、防御机制等相关基因。流行株200502与L.interrogans、L.noguchii和L.kirschneri 3个基因种进化亲缘性较近。结论获得了我国当前黄疸出血群流行株200502基因组的基本特征,确定了其与血清型疫苗株56601的差异,为钩体疫苗的改进提供了实验依据。 展开更多
关键词 黄疸出血群钩端螺旋体 流行菌株 疫苗菌株 全基因组序列 比较基因组学
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部