5个贵妃鸡配套系生长发育规律、屠宰性能和肉品质比较分析

旨在筛选出生长性能好、屠宰性能优良、肉品质鲜美的贵妃鸡杂交组合,为贵妃鸡的品种改良提供科学依据。本研究选择体重接近的20周龄健康贵妃鸡为母本,与河南农业大学家禽种质资源场培育的同周龄的豫农D系、豫农L系、豫农SHj系、豫农C系和豫农H系进行杂交配套试验,杂交后代分别为D×HD、L×HD、SHj×HD、C×HD、H×HD。各组合按性别选取健康雏鸡各50只,常规饲养至12周龄,每两周固定时间测定体重,采用Logistic、Gompertz和Von Bertallanffy 3种非线性生长曲线模型对其体重进行拟合,并随机挑选各组合12周龄健康试验鸡公母各6只进行屠宰,测定其生长性能、屠宰性能以及肉品质等指标,对各指标进行生物统计学分析。结果表明:Gompertz模型的拟合结果最优,拟合度均在0.998以上;在生产性能方面,C×HD组合的平均体重和体尺指标显著高于其他组合(P<0.05)且母鸡饲料报酬最高(2.59),SHj×HD组合公鸡饲料报酬最高(2.39);在屠宰性能方面,除L×HD和H×HD组合中的母鸡之外,其它组合公母鸡均达到半净膛率70%以上,全净膛率60%以上,肉用性能良好;在肉品质方面,D×HD组合的肉质较优于其他组合,但各组合滴水损失无显著差异。基于以上结果,C×HD组合在生长性能、屠宰性能、肉品质等方面大多表现优异,可以在一定程度上满足消费者的需求。此外,研究结果也为贵妃鸡遗传资源的保护、进一步开发和品种选育提供重要参考依据,为贵妃鸡的高效养殖和推广提供了有力的支持。

基于全基因组SNP标记分析中国地方鸡品种的遗传多样性和种群结构

旨在对中国地方鸡品种的遗传多样性与种群结构进行分析。本研究使用Affymetrix Axiom 600K高密度鸡基因分型芯片对来自8个品种的157只地方鸡及233只商品鸡进行基因分型,以品种作为分组来计算各分组的观测杂合度、期望杂合度、次等位基因频率、近交系数及核苷酸多样性分析地方鸡群体的遗传多样性,利用进化树、主成分分析、群体结构、MDS等方法分析鸡群体的群体结构,基于状态同源(IBS)和群体分化系数(Fst)分析种群内部与种群之间的亲缘关系,利用长纯合片段(runs of homozygosity,ROH)估算得到基于ROH的近交系数。结果表明,各群体的观测杂合度均高于期望杂合度,次等位基因频率在0.175~0.236之间,近交系数在0.018~0.205之间,核苷酸多样性在0~6×10^(-4)之间,进化树与主成分分析表明品种间出现了明显的群体分化,地方鸡群体与商品鸡群的MDS分析发现我国地方鸡与商业肉鸡品种的遗传距离较近;IBS遗传距离在0.0929~0.3199之间;各品种成对Fst分析表明,群体间呈现中高分化程度(0.09~0.22);此次分析共得到了5242个ROH,长度分布在1~41.51 Mb之间,基于ROH的近交系数在0.010~0.150之间。以上结果表明,地方鸡遗传多样性整体较为丰富,其中狼山鸡与皖南三黄鸡的遗传多样性最高。斗鸡、固始鸡及茶花鸡近交程度较高,可能经历过近交事件。不同品种间出现了较高遗传分化,该研究结果将有助于设计和实施遗传资源保护策略,促进遗传资源在保护中利用、利用中保护。

鸡RUNX3基因组织表达及生物信息学分析

为探究Runt相关转录因子3 (Runt-related transcription factors 3,RUNX3)基因潜在功能,本研究利用实时荧光定量技术(Quantitative real-time PCR, qRT-PCR)检测鸡RUNX3基因在心脏、肝脏、脾脏、腿肌和十二指肠组织中的表达,通过生物信息学软件构建RUNX3基因的系统进化树,并对该基因所编码的蛋白质理化性质和结构功能进行分析。结果表明:1)鸡RUNX3基因在脾脏和十二指肠表达量较高,显著高于其他组织(P<0.05)。2)核苷酸序列的系统进化分析表明,鸡RUNX3与火鸡的亲缘关系最近,保守性较高。3)理化性质分析显示,鸡RUNX3基因编码蛋白属于稳定、亲水性蛋白;结构域预测发现,该蛋白不存在跨膜结构,含有2个保守结构域,二级结构和三级结构主要由无规卷曲组成,预测含有58个磷酸化位点,31个丝氨酸位点、23个苏氨酸位点和4个酪氨酸位点。4)蛋白互作预测发现,RUNX3与SMAD3、CBFB、GATA3、EP300、SMAD2、CTNNB1等蛋白之间有较强互作关系。综上,鸡RUNX3在脾脏和十二指肠中高表达,其核苷酸序列在禽类中具有高度保守性,RUNX3蛋白属于稳定、亲水性的不跨膜蛋白,RUNX3与SMAD3、CBFB、GATA3等蛋白之间有较强互作关系,本研究为进一步探究鸡RUNX3在分子水平的作用机制提供理论依据。