血浆外泌体中Hsa_circ_0004071作为结直肠癌新诊断标志物的研究

目的筛选结直肠癌(CRC)患者血浆外泌体中差异表达的circRNA,验证其作为CRC新诊断标志物的可行性。方法选取2019年10月—2020年7月于徐州医科大学附属医院诊治的48例CRC患者血浆样本作为观察组,再选取同期收治的48例非癌症人群血浆样本作为对照组。初步筛选差异circRNA,再进行血浆外泌体提取、总RNA提取、逆转录及RT-PCR定量分析,选取最终目标circRNA进行深入验证。结果通过生物信息学分析初步筛选出15条差异表达circRNA。采用RT-PCR定量分析发现Hsa_circ_0004071在CRC患者与非癌症对照组血浆外泌体中显著差异表达,诊断性分析结果显示合并灵敏度为77%,特异度为71%,ROC曲线下面积(AUC)为0.7552,表明Hsa_circ_0004071对CRC患者具有较高的诊断效能,且异常表达的Hsa_circ_0004071与CRC TNM分期、远处转移呈正相关。结论Hsa_circ_0004071在CRC患者血浆外泌体中高表达,且和TNM分期、远处转移相关,可能成为新的CRC诊断标志物。

秸秆降解菌株的筛选、鉴定及生物学特性研究

为筛选优良秸秆降解菌株,解析不同菌株降解秸秆的生物学过程。本研究利用以秸秆为唯一碳源的筛选方法从土壤中获得3株具有秸秆降解能力的菌株yj1、yj2和yj3。根据8d的秸秆降解率确定菌株降解秸秆的最优温度和pH,并测定和比较参与秸秆降解的内切葡聚糖酶(EG)、β-葡萄糖苷酶(BG)、木聚糖酶、木质素过氧化物酶(LiP)、锰过氧化物酶(MnP)和漆酶(Lac)的活性。结果表明:1)筛选得到的yj1、yj2和yj3菌株分别属于假单胞菌属、芽孢杆菌属和短杆菌属。2)3种菌株分别在最适温度37、30和37℃以及最适pH 8、8和7时培养8d后,秸秆降解率达到峰值,在偏碱性条件下菌株yj2的秸秆降解率为26.61%。3)菌株yj1和yj3无木聚糖酶的活性,但LiP、MnP和Lac酶活性较高。菌株yj2的6种酶均具有较高的活性,协同完成秸秆降解。因此,菌株yj2可以作为碱性土壤条件下秸秆降解的候选菌株。