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海七鳃鳗(Petromyzon marinus)anoctaimin-1蛋白的生物信息学分析
1
作者
郭思呈
赵丹
+2 位作者
杜树亮
崔楠
李铁松
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期11-17,共7页
七鳃鳗是现存的最原始的无颌类脊椎动物之一,也是连接无脊椎动物与脊椎动物的重要环节,对生物的起源与进化有很高的研究价值。anoctamin-1蛋白(ANO1)是一种重要的跨膜蛋白,与细胞内阴离子的跨膜运输相关。以海七鳃鳗为例,利用不同软件...
七鳃鳗是现存的最原始的无颌类脊椎动物之一,也是连接无脊椎动物与脊椎动物的重要环节,对生物的起源与进化有很高的研究价值。anoctamin-1蛋白(ANO1)是一种重要的跨膜蛋白,与细胞内阴离子的跨膜运输相关。以海七鳃鳗为例,利用不同软件对海七鳃鳗ANO1蛋白的理化性质、结构域、蛋白结构特征、物种进化保守性以及系统进化关系进行生物信息学分析表明:海七鳃鳗ANO1的开放阅读框为2 373 bp,编码791个氨基酸,属于anoctamin蛋白家族,具有7个跨膜区;二级结构含有无规则卷曲、α螺旋和β折叠。将海七鳃鳗与其他物种的ANO1氨基酸序列进行同源比对,并构建系统进化树,以确认海七鳃鳗ANO1基因的保守性和进化地位。对ANO1基因及蛋白的生物信息学分析为ANO1基因及蛋白的相关研究提供了重要的信息基础。
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关键词
七鳃鳗
ANO1
生物信息学
进化树
原文传递
题名
海七鳃鳗(Petromyzon marinus)anoctaimin-1蛋白的生物信息学分析
1
作者
郭思呈
赵丹
杜树亮
崔楠
李铁松
机构
辽宁师范大学生命科学学院七鳃鳗研究中心生物技术与分子药物研发省重点实验室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期11-17,共7页
基金
全国大学生创新创业训练计划项目(No.201710165000017)
国家自然科学基金项目(No.31501907)
辽宁省教育厅科学研究一般项目(No.2015287)共同资助。
文摘
七鳃鳗是现存的最原始的无颌类脊椎动物之一,也是连接无脊椎动物与脊椎动物的重要环节,对生物的起源与进化有很高的研究价值。anoctamin-1蛋白(ANO1)是一种重要的跨膜蛋白,与细胞内阴离子的跨膜运输相关。以海七鳃鳗为例,利用不同软件对海七鳃鳗ANO1蛋白的理化性质、结构域、蛋白结构特征、物种进化保守性以及系统进化关系进行生物信息学分析表明:海七鳃鳗ANO1的开放阅读框为2 373 bp,编码791个氨基酸,属于anoctamin蛋白家族,具有7个跨膜区;二级结构含有无规则卷曲、α螺旋和β折叠。将海七鳃鳗与其他物种的ANO1氨基酸序列进行同源比对,并构建系统进化树,以确认海七鳃鳗ANO1基因的保守性和进化地位。对ANO1基因及蛋白的生物信息学分析为ANO1基因及蛋白的相关研究提供了重要的信息基础。
关键词
七鳃鳗
ANO1
生物信息学
进化树
Keywords
Petromyzon marinus(Sea lampery)
ANO1
Bioinformatics
Phylogenetic tree
分类号
Q953 [生物学—动物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海七鳃鳗(Petromyzon marinus)anoctaimin-1蛋白的生物信息学分析
郭思呈
赵丹
杜树亮
崔楠
李铁松
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020
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