基于网络药理学探讨复方龙丹颗粒治疗EMs的作用机制研究

目的:运用网络药理学的方法,探讨复方龙丹颗粒干预子宫内膜异位症(Endometriosis, EMs)的潜在作用机制,为其新药研发及基础研究提供依据。方法:通过TCMSP、ETCM、TCM-MESH等数据库检索复方龙丹颗粒中化合物成分信息,利用SwissADME平台及PharmMapper数据库筛选出其活性成分及作用靶点;采用GeneCards、DrugBank、OMIM、DisGeNet等数据库筛出与子宫内膜异位症的相关靶点,通过BisoGenet构建PPI网络,根据网络属性值筛选出关键靶点;同时分别采用ClueGO插件及Metascape平台对关键靶点进行KEGG、GO的富集分析,得到潜在的作用通路,并构建靶点–通路网络。结果:复方龙丹颗粒中筛选得到121个活性成分,经筛选与子宫内膜异位症相关的关键作用靶点156个,涉及白细胞介素17信号、类风湿关节炎等54条相关通路,参于细胞质翻译、mRNA结合等631个相关生物过程。结论:通过网络药理学揭示了复方龙丹颗粒可通过多成分、多靶标、多信号通路治疗子宫内膜异位症,为子宫内膜异位症的治疗及机制研究提供依据和思路。

担子菌Mating-Type序列生物信息学分析

目的:以草菇为研究对象,对担子菌mating-type同源序列中的HD位点为靶标进行生物信息学初步分析。方法:应用在线生物信息学软件预测HD序列的理化性质、疏水性/亲水性、导肽、跨膜结构、三维结构、功能结构域,并构建了同亚门中其他物种该蛋白家族的系统进化树。结果:同源mating-type序列中HD基因位点的氨基酸不稳定性指数在56%左右,且无明显的信号肽、导肽和跨膜结构域,三维结构由3个α-螺旋和少数转角二级结构组成,七种食用菌在氨基酸序列呈现较低的相似性。结论:同源mating-type序列的HD1、HD2蛋白稳定性差,无信号肽、导肽、跨膜结构,无β-折叠,在N-J进化树中不同物种间该氨基酸序列相似性极低,表明HD位点具有丰富的多样性,且结构性简单。

基于网络药理学探讨吉贝咳喘汤抗炎的作用机制

目的:运用网络药理学的方法研究经验复方吉贝咳喘汤干预炎症的成分–靶点–通路作用机制,旨在为其基础研究及临床应用提供依据。方法:通过ETCM数据库、PharmMapper数据库及SwissADME平台检索筛选出吉贝咳喘汤的活性成分及作用靶点,采用GeneCards、OMIM、DisGeNet数据库筛出炎症相关靶点,取两者交集靶点,将交集靶点利用STRING11.0获得蛋白互作关系,并通过Cytoscape3.7.2构建PPI网络,分析吉贝咳喘汤抗炎的关键靶点;采用Metascape平台进行GO、KEGG基因富集分析,得到潜在作用通路,并构建靶点–通路网络。结果:吉贝咳喘汤中筛选得到145个活性成分,其中涉及炎症作用靶点316个,经分析最终筛选出34个关键靶点;KEGG富集分析关键靶点主要被富集在AGE-RAGE、NF-κB、cAMP等相关通路,涉及炎症反应、防御调节等3609个相关生物过程。结论:基于网络药理学探讨了吉贝咳喘汤抗炎成分–靶点–通路的作用特点,为进一步开展吉贝咳喘汤抗炎作用机制研究提供了新的思路和方法。

石斛属药用植物内生菌研究进展

石斛作为名贵中药材具有重要的药用价值和巨大的开发潜力,随着市场需求量的不断增加,石斛资源已变得极其匮乏。石斛内生菌在石斛的生长发育、次生代谢和环境适应等方面有很强的促进作用,对石斛的产量和品质皆有较大影响,深入研究石斛内生菌及其与宿主的关系,对石斛生产有重要借鉴意义,因此综述了石斛属植物内生菌的多样性及其应用,并对其未来研究方向进行了展望。

大血藤对溃疡性结肠炎的治疗作用及基于GEO芯片联合网络药理学的机制探讨

目的明确大血藤抗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的作用,并探讨其作用机制。方法以葡聚糖硫酸钠诱导UC小鼠模型评价大血藤抗UC作用;依据中国知网和PubMed网站获取大血藤的成分,SwissTargetPrediction数据库筛选成分靶点,GEO基因芯片提取UC差异基因,构建大血藤“成分-靶点-疾病”网络,筛选核心靶点后,进行蛋白互作与聚类分析、生物过程及通路富集分析,并以分子对接和文献初步验证网络分析的可靠性。结果大血藤能显著改善UC小鼠的疾病活动指数评分、结肠缩短和结肠组织病理变化,具有良好的抗UC作用;网络分析发现大血藤抗UC核心成分包括(+)-Dihydroguaiaretic acid、Isorhapontigenin和Pinosylvin等,核心靶点EGFR、STAT1、LCK等63个,通过调节PI3K-Akt信号通路和癌症蛋白聚糖等多条免疫抗炎和抗肿瘤相关的信号通路,影响氨基酸修饰,激酶活性调节,细胞反应和氧化应激等生物过程抗UC。分子对接和文献表明所构建网络可靠性较高。结论大血藤有良好的抗UC作用,其机制可能与调节肠道免疫炎症及细胞增殖、分化与迁移等密切相关,具备多成分、多靶点、多途径的特点。

基于HPLC指纹图谱的皂角子与滇皂角子鉴别研究

通过HPLC指纹图谱比较皂角子与滇皂角子的差异,并结合化学计量学方法为皂角子药材的鉴别提供依据。方法选用Diasonsil C18(250 mm×4.6 mm,5 m)色谱柱,以0.1%磷酸溶液-乙腈为流动相,梯度洗脱;流速为1.0 m L/min;柱温为25℃;检测波长为210 nm。采用“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”软件(2012A版)进行数据处理分析,计算皂角子及滇皂角子的相似度。结果建立的皂角子指纹图谱共确定了11个共有峰;滇皂角子整体的相似度较比皂角子样品低,在0.783~0.842之间,而皂角子样品中除亳州市外,其余产地的相似度均在0.898以上。聚类分析结果将13批皂角子和3批滇皂角子样品聚为4类,主成分分析结果与聚类分析基本一致。结论该方法能有效区分皂角子与滇皂角子,可为控制皂角子药材的质量提供参考。