原发性肝细胞癌是全世界常见的恶性肿瘤之一,每年一半的新发肝癌发生在中国。大量临床研究和实践证明早筛和早诊可有效降低肝癌的5年总病死率。因此探索建立适合中国国情的肝癌筛查策略极其迫切。全国多中心前瞻性肝癌极早期预警筛查项...原发性肝细胞癌是全世界常见的恶性肿瘤之一,每年一半的新发肝癌发生在中国。大量临床研究和实践证明早筛和早诊可有效降低肝癌的5年总病死率。因此探索建立适合中国国情的肝癌筛查策略极其迫切。全国多中心前瞻性肝癌极早期预警筛查项目(Prospective suRveillance for very Early hepatoCellular cARcinoma,PreCar)专家组基于国内外主要相关指南、临床实践和PreCar项目研究最新进展,提出了中国早期肝癌筛查策略和具体流程,旨在为早期肝癌筛查和诊断提供实际方法,提高我国防控水平。展开更多
目的评估自噬相关蛋白5(autophagy-related protein 5,ATG5)在结肠癌中的表达及其与临床病理特征的关系,分析ATG5对结肠癌细胞迁移及侵袭能力的影响。方法运用在线分析工具cProsite分析ATG5 mRNA以及ATG5蛋白在结肠癌组织及癌旁正常组...目的评估自噬相关蛋白5(autophagy-related protein 5,ATG5)在结肠癌中的表达及其与临床病理特征的关系,分析ATG5对结肠癌细胞迁移及侵袭能力的影响。方法运用在线分析工具cProsite分析ATG5 mRNA以及ATG5蛋白在结肠癌组织及癌旁正常组织中的表达水平。使用Kaplan-Meier Plotter分析ATG5表达水平对结肠癌患者预后的影响。免疫组织化学法检测100例结肠癌组织中ATG5表达,χ2和Fishers检验分析ATG5表达水平与临床病理特征的相关性。转染质粒或小干扰过表达或敲低ATG5后,Western blotting检测转染效率及自噬相关标记物微管相关蛋白轻链3(microtubule-associated protein light chain 3,LC3)的变化,Transwell实验评估过表达或敲低ATG5后结肠癌细胞的迁移及侵袭能力。使用LinkedOmics数据库分析结肠癌中与ATG5相关的差异表达基因,并进行基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。结果结肠癌组织中ATG5 mRNA及蛋白的表达水平均低于癌旁正常组织(P<0.001)。低表达ATG5的结肠癌患者无复发生存期明显短于高表达ATG5的结肠癌患者(P<0.001)。免疫组化结果表明,结肠癌组织中ATG5的表达水平与淋巴结转移相关,低表达ATG5的结肠癌患者更容易发生淋巴结转移(P=0.027)。Western blotting及Transwell实验显示在SW1116细胞中过表达ATG5后,LC3Ⅱ/LC3Ⅰ增加,细胞的迁移侵袭能力减弱(PATG5=0.001;PLC3Ⅱ/LC3Ⅰ=0.04;P迁移<0.001,P侵袭<0.001);反之,在DLD1细胞中敲低ATG5后,LC3Ⅱ/LC3Ⅰ降低,细胞的迁移侵袭能力增加(PATG5#1=0.021,PATG5#2<0.001;PLC3Ⅱ/LC3Ⅰ#1=0.013,PLC3Ⅱ/LC3Ⅰ#2=0.02;P迁移<0.001,P侵袭<0.001)。ATG5相关的差异表达基因富集分析结果显示,结肠癌中ATG5可能通过影响DNA损伤反应、染色质重排及Notch信号通路等途径影响结肠癌的转移。结论ATG5在结肠癌中低表达,并与患者淋巴结转移及预后显著相关,结肠癌细胞中ATG5能够增加细胞自噬水平并抑制细胞侵袭转移,提示ATG5及其调控的自噬过程可能成为结肠癌临床治疗的新靶点。展开更多
文摘原发性肝细胞癌是全世界常见的恶性肿瘤之一,每年一半的新发肝癌发生在中国。大量临床研究和实践证明早筛和早诊可有效降低肝癌的5年总病死率。因此探索建立适合中国国情的肝癌筛查策略极其迫切。全国多中心前瞻性肝癌极早期预警筛查项目(Prospective suRveillance for very Early hepatoCellular cARcinoma,PreCar)专家组基于国内外主要相关指南、临床实践和PreCar项目研究最新进展,提出了中国早期肝癌筛查策略和具体流程,旨在为早期肝癌筛查和诊断提供实际方法,提高我国防控水平。
文摘目的评估自噬相关蛋白5(autophagy-related protein 5,ATG5)在结肠癌中的表达及其与临床病理特征的关系,分析ATG5对结肠癌细胞迁移及侵袭能力的影响。方法运用在线分析工具cProsite分析ATG5 mRNA以及ATG5蛋白在结肠癌组织及癌旁正常组织中的表达水平。使用Kaplan-Meier Plotter分析ATG5表达水平对结肠癌患者预后的影响。免疫组织化学法检测100例结肠癌组织中ATG5表达,χ2和Fishers检验分析ATG5表达水平与临床病理特征的相关性。转染质粒或小干扰过表达或敲低ATG5后,Western blotting检测转染效率及自噬相关标记物微管相关蛋白轻链3(microtubule-associated protein light chain 3,LC3)的变化,Transwell实验评估过表达或敲低ATG5后结肠癌细胞的迁移及侵袭能力。使用LinkedOmics数据库分析结肠癌中与ATG5相关的差异表达基因,并进行基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。结果结肠癌组织中ATG5 mRNA及蛋白的表达水平均低于癌旁正常组织(P<0.001)。低表达ATG5的结肠癌患者无复发生存期明显短于高表达ATG5的结肠癌患者(P<0.001)。免疫组化结果表明,结肠癌组织中ATG5的表达水平与淋巴结转移相关,低表达ATG5的结肠癌患者更容易发生淋巴结转移(P=0.027)。Western blotting及Transwell实验显示在SW1116细胞中过表达ATG5后,LC3Ⅱ/LC3Ⅰ增加,细胞的迁移侵袭能力减弱(PATG5=0.001;PLC3Ⅱ/LC3Ⅰ=0.04;P迁移<0.001,P侵袭<0.001);反之,在DLD1细胞中敲低ATG5后,LC3Ⅱ/LC3Ⅰ降低,细胞的迁移侵袭能力增加(PATG5#1=0.021,PATG5#2<0.001;PLC3Ⅱ/LC3Ⅰ#1=0.013,PLC3Ⅱ/LC3Ⅰ#2=0.02;P迁移<0.001,P侵袭<0.001)。ATG5相关的差异表达基因富集分析结果显示,结肠癌中ATG5可能通过影响DNA损伤反应、染色质重排及Notch信号通路等途径影响结肠癌的转移。结论ATG5在结肠癌中低表达,并与患者淋巴结转移及预后显著相关,结肠癌细胞中ATG5能够增加细胞自噬水平并抑制细胞侵袭转移,提示ATG5及其调控的自噬过程可能成为结肠癌临床治疗的新靶点。
文摘目的:探讨基于外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)的DNA差异甲基化修饰位点在肺良恶性结节临床鉴别诊断中的价值。方法:采用850k甲基化芯片检测20例良性肺结节和34例恶性肺结节患者PBMCs的全基因组甲基化状态,初步构建PBMCs来源的良恶性肺结节特异性甲基化图谱并获得差异甲基化位点(differentially methylated positions,DMPs),对DMPs所在的基因进行基因本体(gene ontology,GO)分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。利用LASSO回归分析方法对DMPs进行统计筛选。将36例良性肺结节患者和84例恶性肺结节患者随机分成2组队列(测试队列和验证队列),通过焦磷酸测序方法对所选的位点进行分析验证,并采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线进行分析,计算ROC曲线下面积(area under the curve,AUC),评估其对肺良恶性结节的预测效能。结果:发现队列的良恶性肺结节患者PBMCs差异甲基化图谱具有明显差异。以Δβ>0.06,adjust P<0.01作为预筛选条件共得到421个DPMs。使用LASSO回归分析进一步筛选得到6个CpG位点。根据Pearson相关分析,以及进一步去除具有引物错配风险及引物合成困难的位点,得到cg05460181(AUC=0.793,P<0.0001)和cg08721802(AUC=0.893,P<0.0001)2个位点。测试阶段,通过焦磷酸测序测试2个位点在16例良性肺结节患者及34例恶性肺结节患者中的甲基化水平,发现cg08721802位点对肺良恶性结节具有较高的诊断价值(AUC=0.778,敏感度=85.29%,特异度=56.25%,P<0.01)。验证阶段,在另一个包含20例良性肺结节患者及50例恶性肺结节患者的独立样本集中对cg08721802的甲基化水平进行检测,发现其对区分良恶性肺结节仍具有临床价值(AUC=0.768,敏感度=84%,特异度=50%,P<0.01),cg08721802位点诊断效能明显高于传统肿瘤标志物,cg08721802位点与CEA结合明显提高了对大小为6~20 mm的结节诊断价值。结论:cg08721802甲基化水平在良恶性结节患者中具有明显差异,可以作为良恶性肺结节鉴别诊断的新型分子标志物。
