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远志及其近缘种的ITS序列分析及鉴定
被引量:
4
1
作者
樊杰
白妍
束明月
《山西中医学院学报》
2014年第4期30-31,34,共3页
目的:对远志属3种药用植物进行分子鉴定。方法:利用PCR直接测序法对远志ITS序列进行测定,结合Genbank中远志、卵叶远志和瓜子金的ITS序列,经Clustalx比对后,用软件MEGA3.1计算了Kimura 2-Parameter(K2P)距离,并构建了NJ(邻接)树。结果:...
目的:对远志属3种药用植物进行分子鉴定。方法:利用PCR直接测序法对远志ITS序列进行测定,结合Genbank中远志、卵叶远志和瓜子金的ITS序列,经Clustalx比对后,用软件MEGA3.1计算了Kimura 2-Parameter(K2P)距离,并构建了NJ(邻接)树。结果:远志属3种药用植物ITS1长度为269 bp^271 bp,ITS2长度为216 bp^217 bp,变异位点26个,信息位点1个;瓜子金与其他样品的遗传距离最大,卵叶远志与远志2个Genbank样品遗传距离最小。结论:ITS序列无法区别卵叶远志和远志,但可以作为瓜子金的分子鉴定依据。
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关键词
远志属
ITS序列
DNA条形码
物种鉴别
下载PDF
职称材料
远志属4种药用植物不同干燥方法叶材料DNA提取方法研究
被引量:
1
2
作者
樊杰
申飞翔
+4 位作者
何益
马全级
箫迪
白妍
束明月
《山西中医学院学报》
2014年第5期35-37,共3页
目的:以远志属药用植物为例,对经过不同干燥方法的叶片材料进行DNA提取方法优化研究。方法:在改良CTAB法的基础上,对水浴时间、水浴温度、沉淀时间进行优化。结果:降低水浴温度为45℃,延长水浴时间为5 h,延长沉淀时间为1 h,可以从常温...
目的:以远志属药用植物为例,对经过不同干燥方法的叶片材料进行DNA提取方法优化研究。方法:在改良CTAB法的基础上,对水浴时间、水浴温度、沉淀时间进行优化。结果:降低水浴温度为45℃,延长水浴时间为5 h,延长沉淀时间为1 h,可以从常温干燥并保存1年的叶片材料和腊叶标本叶材料中提取到用于PCR反应的DNA。结论:硅胶干燥叶片用改良CTAB法可以得到满足后续PCR反应的DNA;对常温干燥并保存1年的干叶片和腊叶标本叶材料,一定时间的低温水浴是提取到满足后续PCR实验DNA的关键。
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关键词
远志属
DNA提取
改良CTAB法
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职称材料
远志属7种药用植物ITS1和ITS2序列分析
被引量:
15
3
作者
樊杰
白妍
束明月
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期562-565,共4页
目的采用ITS序列进行远志属7种药用植物的分子鉴定。方法通过测定远志Polygala tenuifolia、卵叶远志P.sibirica、瓜子金P.japonica、华南远志P.glomerata、蓼叶远志P.persicariifolia、肾果小扁豆P.furcata和小花远志P.arvensis的ITS1...
目的采用ITS序列进行远志属7种药用植物的分子鉴定。方法通过测定远志Polygala tenuifolia、卵叶远志P.sibirica、瓜子金P.japonica、华南远志P.glomerata、蓼叶远志P.persicariifolia、肾果小扁豆P.furcata和小花远志P.arvensis的ITS1、ITS2序列,借助Clustal X、MEGA 3.1软件比较和分析ITS1、ITS2的序列特征。结果远志属7种药用植物ITS1长度为279~291 bp,ITS2的长度为211~219 bp,变异位点232个,信息位点53个;远志与卵叶远志的遗传距离最小,华南远志与肾果小扁豆遗传距离最大,亲缘关系最远。结论远志属7种药用植物的ITS1、ITS2序列可作为分子鉴定的依据。
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关键词
远志属
ITS序列
DNA条形码
物种鉴别
ITS1
ITS2
原文传递
题名
远志及其近缘种的ITS序列分析及鉴定
被引量:
4
1
作者
樊杰
白妍
束明月
机构
山西中医学院
出处
《山西中医学院学报》
2014年第4期30-31,34,共3页
基金
山西省自然科学基金项目(2012011034-2)
山西中医学院博士科研启动基金项目(2014)
文摘
目的:对远志属3种药用植物进行分子鉴定。方法:利用PCR直接测序法对远志ITS序列进行测定,结合Genbank中远志、卵叶远志和瓜子金的ITS序列,经Clustalx比对后,用软件MEGA3.1计算了Kimura 2-Parameter(K2P)距离,并构建了NJ(邻接)树。结果:远志属3种药用植物ITS1长度为269 bp^271 bp,ITS2长度为216 bp^217 bp,变异位点26个,信息位点1个;瓜子金与其他样品的遗传距离最大,卵叶远志与远志2个Genbank样品遗传距离最小。结论:ITS序列无法区别卵叶远志和远志,但可以作为瓜子金的分子鉴定依据。
关键词
远志属
ITS序列
DNA条形码
物种鉴别
Keywords
Polygala L.
ITS sequences
DNA barcodes
identification of species
分类号
R282 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
远志属4种药用植物不同干燥方法叶材料DNA提取方法研究
被引量:
1
2
作者
樊杰
申飞翔
何益
马全级
箫迪
白妍
束明月
机构
山西中医学院
出处
《山西中医学院学报》
2014年第5期35-37,共3页
基金
山西省自然科学基金项目(2012011034-2)
山西中医学院博士科研启动基金项目(2014)
文摘
目的:以远志属药用植物为例,对经过不同干燥方法的叶片材料进行DNA提取方法优化研究。方法:在改良CTAB法的基础上,对水浴时间、水浴温度、沉淀时间进行优化。结果:降低水浴温度为45℃,延长水浴时间为5 h,延长沉淀时间为1 h,可以从常温干燥并保存1年的叶片材料和腊叶标本叶材料中提取到用于PCR反应的DNA。结论:硅胶干燥叶片用改良CTAB法可以得到满足后续PCR反应的DNA;对常温干燥并保存1年的干叶片和腊叶标本叶材料,一定时间的低温水浴是提取到满足后续PCR实验DNA的关键。
关键词
远志属
DNA提取
改良CTAB法
Keywords
Polygala L.
DNA extraction
improved CTAB method
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
远志属7种药用植物ITS1和ITS2序列分析
被引量:
15
3
作者
樊杰
白妍
束明月
机构
山西中医学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期562-565,共4页
基金
山西省自然科学基金项目(2012011034-2)
山西中医学院博士科研启动基金项目(2014)
文摘
目的采用ITS序列进行远志属7种药用植物的分子鉴定。方法通过测定远志Polygala tenuifolia、卵叶远志P.sibirica、瓜子金P.japonica、华南远志P.glomerata、蓼叶远志P.persicariifolia、肾果小扁豆P.furcata和小花远志P.arvensis的ITS1、ITS2序列,借助Clustal X、MEGA 3.1软件比较和分析ITS1、ITS2的序列特征。结果远志属7种药用植物ITS1长度为279~291 bp,ITS2的长度为211~219 bp,变异位点232个,信息位点53个;远志与卵叶远志的遗传距离最小,华南远志与肾果小扁豆遗传距离最大,亲缘关系最远。结论远志属7种药用植物的ITS1、ITS2序列可作为分子鉴定的依据。
关键词
远志属
ITS序列
DNA条形码
物种鉴别
ITS1
ITS2
Keywords
Polygala L.
ITS sequences
DNA barcodes
identification of species
ITS1
ITS2
分类号
R931 [医药卫生—生药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
远志及其近缘种的ITS序列分析及鉴定
樊杰
白妍
束明月
《山西中医学院学报》
2014
4
下载PDF
职称材料
2
远志属4种药用植物不同干燥方法叶材料DNA提取方法研究
樊杰
申飞翔
何益
马全级
箫迪
白妍
束明月
《山西中医学院学报》
2014
1
下载PDF
职称材料
3
远志属7种药用植物ITS1和ITS2序列分析
樊杰
白妍
束明月
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2015
15
原文传递
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