Copines蛋白家族在肾透明细胞癌中的潜在预后价值

目的探讨Copines蛋白家族(CPNEs)在肾透明细胞癌(KIRC)中的潜在预后价值。方法在GEPIA、HPA、Kapian-Meier Plotter、cBioPortal GeneMANIA、STRING、TIMER2.0等数据库中对KIRC患者的CPNEs表达差异、生存预后、临床分期、基因突变、蛋白互作、免疫浸润等数据进行生物信息学分析和整理。结果CPNE1、CPNE2、CPNE5、CPNE7、CPNE8在KIRC组织中表达水平均显著升高(P<0.05),CPNE3、CPNE4、CPNE6在KIRC组织中表达水平均显著降低(P<0.05),CPNE1、CPNE3、CPNE7的mRNA的表达水平与KIRC的临床分期明显相关(P<0.05)。高表达CPNE1、CPNE7的KIRC患者的总体生存率(OS)明显低于低表达的患者(P<0.05),低表达CPNE3、CPNE6的KIRC患者的OS明显低于高表达的患者(P<0.05)。此外,差异表达的CPNEs的功能主要依赖于钙依赖性磷脂结合蛋白参与的信号通路的跨膜运输和与蛋白质的相互作用。CPNEs在KIRC中的表达与多种免疫细胞的浸润显著相关,包括B细胞、CD8^(+)T细胞、CD4^(+)T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞等6种类型。结论CPNE1、CPNE3、CPNE7可能是KIRC预后潜在的生物标志物。

CENPW基因在肾透明细胞癌中的表达特征及预后评估价值

目的分析着丝粒蛋白W(CENPW)基因在肾透明细胞癌(KIRC)中的表达特征及预后评估价值。方法从TCGA数据库获取KIRC患者的CENPW基因表达转录本测序数据和临床资料;使用Wilcoxon rank sum检验和Wilcoxon signed rank检验分析CENPW基因在KIRC正常组织和肿瘤组织中的表达;运用Kaplan-Meier方法分析CENPW基因的表达与KIRC患者总体生存率关系;通过Kruskal-Wallis检验和Wilcoxon rank sum检验分析CENPW基因表达与KIRC患者临床病理参数的关系;采用COX回归分析CENPW基因表达水平在KIRC预后中的价值;RT-qPCR检测CENPW基因mRNA在KIRC细胞系和正常肾上皮细胞系表达差异。结果与正常肾组织相比,CENPW基因在KIRC组织中高表达(P<0.001);在KIRC组织中CENPW基因高表达组的总体生存率明显低于低表达组(P<0.001),且其表达水平与肿瘤分级、临床分期、病理T分期、病理N分期、病理M分期均显著相关(P<0.001);COX回归分析提示CENPW基因是KIRC预后的独立危险因素;RT-qPCR结果显示CENPW基因在KIRC细胞系中高表达(P<0.05)。结论CENPW基因在KIRC组织中高表达,与肿瘤进展相关,可能是预测KIRC的分子标记物。