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陆地棉TRM基因家族的鉴定及纤维品质相关优异单倍型分析
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作者 王凯迪 高晨旭 +7 位作者 裴文锋 杨书贤 张文庆 宋吉坤 马建江 王莉 于霁雯 陈全家 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期521-536,共16页
【目的】鉴定陆地棉TRM基因家族序列及理化性质,分析与棉纤维品质相关的优异单倍型基因差异。【方法】利用生物信息学分析陆地棉TRM基因家族进化关系、理化性质和聚类表达;利用基因单倍型效应分析筛选调控纤维品质性状(纤维长度、比强... 【目的】鉴定陆地棉TRM基因家族序列及理化性质,分析与棉纤维品质相关的优异单倍型基因差异。【方法】利用生物信息学分析陆地棉TRM基因家族进化关系、理化性质和聚类表达;利用基因单倍型效应分析筛选调控纤维品质性状(纤维长度、比强度、马克隆值)的候选基因。【结果】陆地棉TRM基因家族编码的氨基酸为376~1093,等电点为4.64~9.56。亚细胞定位预测发现多达60个陆地棉TRM基因家族定位于细胞核中。TRM基因家族含有较多的光响应、激素响应、胁迫响应和生长发育相关的元件。60个TRM基因家族在纤维发育时期优势表达,调控棉花纤维发育。每个基因的单倍型个数为1~8,并筛选到纤维长度、强度以及马克隆值相关的优异单倍型TRM基因分别有14、18和15个,其中有11个基因同时具有长度、强度、马克隆值3种改良纤维品质的优异单倍型。GH_D09G0775的Hap_4单倍型和GH_D03G1434的Hap_3单倍型在增加纤维长度、强度的同时降低了马克隆值。【结论】在陆地棉(Gossypium hirsutum L.)中鉴定出75个TRM基因家族成员分布在24条染色体上,系统进化将其分为ClusterⅠ~Ⅲ3个亚族。 展开更多
关键词 陆地棉 基因家族 基因表达 纤维品质 单倍型
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棉花β-tubulin基因家族的鉴定及其在纤维发育中的表达 被引量:1
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作者 党媛玥 马建江 +5 位作者 杨书贤 宋吉坤 贾冰 冯盼 陈全家 于霁雯 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第23期4585-4601,共17页
【目的】β-微管蛋白是棉纤维细胞形态建成的基本结构单位,在纤维发育过程中具有重要作用。通过鉴定棉花β-tubulin基因家族成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为深入探究β-tubulin基因在棉花纤维发育中的作用提供理论依据。【方法... 【目的】β-微管蛋白是棉纤维细胞形态建成的基本结构单位,在纤维发育过程中具有重要作用。通过鉴定棉花β-tubulin基因家族成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为深入探究β-tubulin基因在棉花纤维发育中的作用提供理论依据。【方法】利用BLAST方法,在4个棉种基因组中鉴定β-tubulin基因家族成员,并结合ProtParam tool分析理化性质、MEGA7.0构建系统进化树、Mapchart2.2绘制染色体定位图、MEME分析保守基序、PlantCARE分析启动子顺式作用元件;根据39个材料发育纤维转录组数据分析陆地棉β-tubulin基因家族的表达水平,并利用Spearman相关性分析鉴定影响纤维品质性状形成的β-tubulin基因。【结果】在陆地棉(Gossypiumhirsutum,AD1)、海岛棉(Gossypiumbarbadense,AD2)、亚洲棉(Gossypiumarboretum,A2)和雷蒙德氏棉(Gossypiumraimondii,D5)基因组中分别鉴定到36、37、19和18个β-tubulin基因,且在四倍体棉种中的数目约是二倍体棉种数目的二倍,系统进化将其分为ClusterⅠ—ClusterⅤ共5个亚组。系统进化与共线性分析发现,与陆地棉β-tubulin基因家族相比,海岛棉与二倍体亚洲棉和雷蒙德氏棉亲缘关系更近。保守结构域均具有典型的Tubulin和Tubulin-C。理化性质分析表明,该家族基因编码的氨基酸数目为421—508,等电点为4.68—5.09。启动子顺式作用元件分析获得生长发育响应相关元件、激素响应相关元件和胁迫响应相关元件等,表明β-tubulin基因参与细胞的生长调节。利用TM-1转录组数据对36个陆地棉β-tubulin基因表达模式进行聚类分析,发现有42%基因在纤维中优势表达;此外,利用海陆群体动态纤维转录组数据筛选到1、6和11个β-tubulin基因分别与纤维马克隆值、比强度和纤维长度显著相关,其中4个基因同时影响纤维长度和比强度性状。【结论】4个棉种中共鉴定出110个β-tubulin基因家族成员,氨基酸理化性质和序列高度保守而启动子序列调控元件多样;筛选出陆地棉纤维优势表达的β-tubulin基因家族成员,并发掘潜在调控纤维发育的候选基因。 展开更多
关键词 棉花 β-tubulin基因家族 生物信息学 表达分析 纤维发育
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当前我国乡村有效治理面临的挑战与对策 被引量:2
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作者 宁泽逵 孙玥 杨书贤 《石家庄学院学报》 CAS 2023年第4期130-136,共7页
党的二十大提出“全面推进乡村振兴,坚持农业农村优先发展,加快实现农业农村现代化”。乡村治理是实现乡村全面振兴的重要基础,治理有效是实现乡村治理现代化的重要保障。新时代以来,我国乡村治理在党建引领、治理有效、乡村社会治理共... 党的二十大提出“全面推进乡村振兴,坚持农业农村优先发展,加快实现农业农村现代化”。乡村治理是实现乡村全面振兴的重要基础,治理有效是实现乡村治理现代化的重要保障。新时代以来,我国乡村治理在党建引领、治理有效、乡村社会治理共同体建构以及数字化乡村建设方面取得了突出成就。但由于我国城乡传统社会结构发生了重大变革,当前乡村有效治理面临治理主体缺失、治理人才匮乏、治理模式受限以及治理方式老旧的挑战。当前应通过改善乡村治理的人口结构现状、提升乡村治理主体的综合素质、构建多元互动的乡村治理格局以及健全“三治结合”的乡村治理体系,促进我国乡村有效治理的实现。 展开更多
关键词 乡村治理 有效治理 乡村振兴
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有效治理促进农民农村共同富裕的路径选择 被引量:1
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作者 宁泽逵 杨书贤 孙玥 《西部经济管理论坛》 2023年第1期1-10,共10页
有效治理作为乡村振兴的关键支撑,涵盖诸多方面内容。有效治理促进农民农村共同富裕的理论机理在于有效治理可以形成“一核多元”的协同共治格局、发挥新型乡村治理体系的作用、助力乡村全面振兴,从而实现农民农村共同富裕。本文梳理我... 有效治理作为乡村振兴的关键支撑,涵盖诸多方面内容。有效治理促进农民农村共同富裕的理论机理在于有效治理可以形成“一核多元”的协同共治格局、发挥新型乡村治理体系的作用、助力乡村全面振兴,从而实现农民农村共同富裕。本文梳理我国乡村治理的实践后发现,在乡村治理领域中,无论是乡村的政治、经济、文化,还是社会和生态环境的治理都已取得一定成效,但要实现农民农村共同富裕还面临诸多制约因素,主要表现为基层党组织建设有待加强、集体经济较薄弱、人居环境质量有待提高、民生保障不充分、农民精神文化生活不足。基于此,本文提出有效治理促进农民农村共同富裕的路径:加强农村基层党组织建设,发挥党建统领的核心作用;壮大新型农村集体经济,巩固农民农村共同富裕基础;提高农村人居环境质量,实现农业农村绿色发展;促进基本公共服务均等化,持续提升农民生活品质;加强乡风文明建设,提升农民精神文化生活质量。 展开更多
关键词 有效治理 乡村振兴 共同富裕
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基于因子分析的经济和生态协调发展研究——以山东省为例 被引量:1
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作者 李红玉 张心悦 杨书贤 《江苏商论》 2017年第6期79-82,共4页
随着经济的快速发展、生产生活环境问题的突出以及国家和社会公众的重视,生态环境问题越来越受到关注,革新"资源节约型、环境友好型"的经济发展面貌、寻求经济发展和生态和谐的均衡点对山东经济实现持续、协调发展具有重要的... 随着经济的快速发展、生产生活环境问题的突出以及国家和社会公众的重视,生态环境问题越来越受到关注,革新"资源节约型、环境友好型"的经济发展面貌、寻求经济发展和生态和谐的均衡点对山东经济实现持续、协调发展具有重要的意义。本文运用因子分析和聚类的分析方法研究山东的生态环境现状,并据此对山东的经济发展提出合理化建议。 展开更多
关键词 生态环境 经济发展 因子分析
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汽车自动变速器故障码读取与清除
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作者 杨书贤 《轻型汽车技术》 2003年第5期60-63,共4页
一、自动变速器故障码读取方法(1)连接 SCS 跨接线至手套箱下方的维修检查连接器,再接通点火开关(Key-on)。(2)此时在仪表板上的 D4指示灯闪烁 DTC 故障码,观察并记录 DTC 故障码。连接器及 D4灯,如图1。二、自动变速器故障码清除方法(1... 一、自动变速器故障码读取方法(1)连接 SCS 跨接线至手套箱下方的维修检查连接器,再接通点火开关(Key-on)。(2)此时在仪表板上的 D4指示灯闪烁 DTC 故障码,观察并记录 DTC 故障码。连接器及 D4灯,如图1。二、自动变速器故障码清除方法(1)旋转点火开关。 展开更多
关键词 汽车 自动变速器 故障码 读取方法 清除方法 故障诊断 维修 故障检查
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