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从迟缓爱德华氏菌fosmid文库克隆编码寡肽透过酶的opp基因簇
被引量:
1
1
作者
杨佳银
莫照兰
+3 位作者
茅云翔
李杰
叶旭红
王波
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期13-19,共7页
从迟缓爱德华氏菌(Edwarclsiellatarda)LSE40 fosmid文库克隆到编码寡肽透过酶的opp基因簇。该基因簇全长6741bp,含有5个ORF,依次编码OppA—B-C-D-F5个蛋白;位于oppA翻译起始住点上游385bp处有一个推测的转录起始位点,在该转录起...
从迟缓爱德华氏菌(Edwarclsiellatarda)LSE40 fosmid文库克隆到编码寡肽透过酶的opp基因簇。该基因簇全长6741bp,含有5个ORF,依次编码OppA—B-C-D-F5个蛋白;位于oppA翻译起始住点上游385bp处有一个推测的转录起始位点,在该转录起点的-35和-10区分别有TAGACA和TATATT两个特征性启动子序列;位于oppA和oppB的间隔区和oppF之后的非编码区各有一个茎环结构,推测分别为oppA和opp基因簇的转录终止子。氨基酸序列分析表明该基因簇编码的各个蛋白与同属细菌鲶鱼爱德华氏菌(E.ictaluri)对应的各个蛋白高度相似,相似性在96%~98%;与其他革兰氏阴性菌相似性在56%~89%;与革兰氏阳性菌的相似性在27%~53%。以细菌OppA的保守结构域SBP_bac_5构建系统发生树,结果显示E.tardaLSE40与同属细菌E.ictaluri的亲缘关系最近,与肠杆菌科细菌的亲缘关系较近,与革兰氏阳性细菌的亲缘关系较远,表明oppA的SBP_bac_5结构域可作为细菌分类鉴定的依据。opp基因簇的获取为深入了解E.tarda适应环境和宿主的生存机制奠定了基础。
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关键词
迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella
tarda)
FOSMID文库
opp基因簇
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职称材料
esaC基因对迟缓爱德华氏菌的毒力及T3SS蛋白分泌的影响
被引量:
2
2
作者
李杰
莫照兰
+3 位作者
茅云翔
王波
杨佳银
邵林
《高技术通讯》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期199-203,共5页
为了确定编码迟缓爱德华氏菌(E.tarda)Ⅲ型分泌系统(T3SS)装置蛋白的esaC基因的功能,采用基因敲除的方法构建了E.tarda野生型致病菌株LSFAO的esaC基因无极性缺失突变株LSE40ΔesaC,该突变株缺失了esaC的46-1452bp。Western blotting分...
为了确定编码迟缓爱德华氏菌(E.tarda)Ⅲ型分泌系统(T3SS)装置蛋白的esaC基因的功能,采用基因敲除的方法构建了E.tarda野生型致病菌株LSFAO的esaC基因无极性缺失突变株LSE40ΔesaC,该突变株缺失了esaC的46-1452bp。Western blotting分析表明,由于esaC的缺失,E.tarda T3SS的输送器蛋白(EseB,EseC,EseD)不能分泌到细胞外,同时细菌的自凝聚现象消失;毒力检测发现,突变株LSE40ΔesaC对蓝曼龙鱼的半数致死量比野生型菌株提高了11.5倍。结果表明,esaC基因影响T3SS输送器蛋白的分泌和E.tarda的毒力。此研究确定了esaC基因作为E.tarda T3SS装置蛋白的功能,加深了对E.tarda致病机理的了解。
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关键词
迟缓爱德华氏菌
esaC突变株
Ⅲ型分泌系统
毒力
输送器蛋白
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职称材料
题名
从迟缓爱德华氏菌fosmid文库克隆编码寡肽透过酶的opp基因簇
被引量:
1
1
作者
杨佳银
莫照兰
茅云翔
李杰
叶旭红
王波
机构
中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室
中国科学院研究生院
中国海洋大学海洋生命学院
出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期13-19,共7页
基金
国家高技术研究发展计划项目(2006AA100310)
国家重点基础研究发展计划项目(2006CB101803)
+1 种基金
国家海洋局908专项项目(908-01-ZH3)
国家自然科学基金项目(30671613)
文摘
从迟缓爱德华氏菌(Edwarclsiellatarda)LSE40 fosmid文库克隆到编码寡肽透过酶的opp基因簇。该基因簇全长6741bp,含有5个ORF,依次编码OppA—B-C-D-F5个蛋白;位于oppA翻译起始住点上游385bp处有一个推测的转录起始位点,在该转录起点的-35和-10区分别有TAGACA和TATATT两个特征性启动子序列;位于oppA和oppB的间隔区和oppF之后的非编码区各有一个茎环结构,推测分别为oppA和opp基因簇的转录终止子。氨基酸序列分析表明该基因簇编码的各个蛋白与同属细菌鲶鱼爱德华氏菌(E.ictaluri)对应的各个蛋白高度相似,相似性在96%~98%;与其他革兰氏阴性菌相似性在56%~89%;与革兰氏阳性菌的相似性在27%~53%。以细菌OppA的保守结构域SBP_bac_5构建系统发生树,结果显示E.tardaLSE40与同属细菌E.ictaluri的亲缘关系最近,与肠杆菌科细菌的亲缘关系较近,与革兰氏阳性细菌的亲缘关系较远,表明oppA的SBP_bac_5结构域可作为细菌分类鉴定的依据。opp基因簇的获取为深入了解E.tarda适应环境和宿主的生存机制奠定了基础。
关键词
迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella
tarda)
FOSMID文库
opp基因簇
Keywords
Edwardsiella tarda
fosmid library
opp gene cluster
分类号
S941.42 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
esaC基因对迟缓爱德华氏菌的毒力及T3SS蛋白分泌的影响
被引量:
2
2
作者
李杰
莫照兰
茅云翔
王波
杨佳银
邵林
机构
中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室
中国科学院研究生院
中国海洋大学海洋生命学院
出处
《高技术通讯》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期199-203,共5页
基金
863计划(2006AA100310)
国家自然科学基金(30671613)
青岛市科技发展计划(08-1-7-2-HY)资助项目
文摘
为了确定编码迟缓爱德华氏菌(E.tarda)Ⅲ型分泌系统(T3SS)装置蛋白的esaC基因的功能,采用基因敲除的方法构建了E.tarda野生型致病菌株LSFAO的esaC基因无极性缺失突变株LSE40ΔesaC,该突变株缺失了esaC的46-1452bp。Western blotting分析表明,由于esaC的缺失,E.tarda T3SS的输送器蛋白(EseB,EseC,EseD)不能分泌到细胞外,同时细菌的自凝聚现象消失;毒力检测发现,突变株LSE40ΔesaC对蓝曼龙鱼的半数致死量比野生型菌株提高了11.5倍。结果表明,esaC基因影响T3SS输送器蛋白的分泌和E.tarda的毒力。此研究确定了esaC基因作为E.tarda T3SS装置蛋白的功能,加深了对E.tarda致病机理的了解。
关键词
迟缓爱德华氏菌
esaC突变株
Ⅲ型分泌系统
毒力
输送器蛋白
Keywords
E. tarda, esaC mutant, type III secretion system (T3SS), virulence, translocator proteins
分类号
S941 [农业科学—水产养殖]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
从迟缓爱德华氏菌fosmid文库克隆编码寡肽透过酶的opp基因簇
杨佳银
莫照兰
茅云翔
李杰
叶旭红
王波
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008
1
下载PDF
职称材料
2
esaC基因对迟缓爱德华氏菌的毒力及T3SS蛋白分泌的影响
李杰
莫照兰
茅云翔
王波
杨佳银
邵林
《高技术通讯》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010
2
下载PDF
职称材料
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