解淀粉芽孢杆菌群体遗传特征分析

通过平均核苷酸一致性分析、基因预测、泛基因组构建、功能注释等流程,以66株解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)的基因组为对象,进行该物种的泛基因组分析。平均核苷酸一致性分析表明,上述菌株可划为具有明显物种边界的两个独立分支;获得的泛基因组共包含13051个基因,其中核心基因2165个;碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZy)功能注释显示,B.amyloliquefaciens相比Bacillus属内其他菌株在分解淀粉、β-葡聚糖和木聚糖上具有较大优势;在促植物生长方面,B.amyloliquefaciens通过吲哚丙酮酸途径合成吲哚乙酸,并通过碱性磷酸脂酶和植酸酶分解磷元素;抗生素耐药性分析发现,多数菌株含链霉素以及大环内酯类抗生素抗性基因。此外,在所有基因组中均发现杆菌烯和杆菌肽等次级代谢产物基因簇。上述研究进一步明确B.amyloliquefaciens基因组水平的分类学特点、核心基础代谢特征,以及菌株在碳水化合物代谢、植物促生、生物防治等方面的优势及潜力,可为开发利用该菌作参考。

产马乳酒乳杆菌马乳酒亚种ZW18益生基因分析

产马乳酒乳杆菌马乳酒亚种(Lactobacillus kefiranofaciens subsp.kefiranofaciens)作为新食品原料具有很多益生特性,该研究利用全基因组测序对产马乳酒乳杆菌马乳酒亚种ZW18基本特征和益生功能基因进行全面分析。结果表明,该菌株由一个环状染色体和两个质粒组成,全长约2.4 Mbp,有更多独特基因和特性。通过数据库注释可得菌株ZW18具有较好的生存能力与稳定性,且对碳水化合物利用能力强,保证了菌体细胞的物质基础和能量供给。该菌株基因组中含有与抵抗氧化应激、耐酸耐胆盐、黏附和聚集、免疫、细菌素等相关的基因,与硫胺素、核黄素等多种维生素及赖氨酸、蛋氨酸等人体所需氨基酸合成相关基因,表明其具有多种潜在益生特性,为进一步深入研究与应用提供基础数据。