2016—2020年云南省德宏州流感病原学监测结果分析

【目的】了解云南省德宏州2016—2020年流行性感冒(简称“流感”)的流行状况以及流感病毒流行株构成,为当地流感防控提供参考。【方法】收集2016年1月—2020年12月德宏州的流感监测数据,采用描述性流行病学方法,对德宏州流感监测资料和病原学监测结果进行统计分析。【结果】共检测流感样病例(ILI)标本4146份,检出流感病毒核酸阳性502例(A型311份,B型191份),阳性率为12.11%。其中2017年的阳性率最高,2019年次之,而2020年最低(P<0.05)。流感高发期为秋冬季。0~4岁年龄组的阳性率最低,25~59岁组阳性率最高(P<0.001)。不同性别之间的阳性率差异无统计学意义(P>0.05)。【结论】自2020年1月以后,新型冠状病毒肺炎防控期间,德宏州流感阳性率有所下降。除2020年外,每年流感均呈季节性流行,以秋冬季为主;流感优势毒株交替出现,以甲型流感病毒为主。

2021年云南省手足口病病例中柯萨奇病毒A2型的测序定型和基因特征分析

目的对2021年云南省昆明市及曲靖市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中非肠道病毒A组71型(enterovirus A71,EVA71)和非柯萨奇病毒A组16型(coxsackie-virus A16,CVA16)的其他肠道病毒进行VP4/VP2区及VP1区基因测序检测,并对检测到的CVA2 VP1区基因进行基因进化分析,为CVA2的预防及控制提供实验室证据。方法按《手足口病实验室手册(2018年版)》,对2021年昆明市和曲靖市送到云南省疾病预防控制中心HFMD实验室的标本进行前处理,提取病毒RNA后,先用MD91/OL68-1引物扩增肠道病毒VP4/VP2结合区基因并测序,编辑后的序列在GenBank上搜索确定病毒型别,再用肠道病毒A组引物分两段扩增CVA2 VP1区基因完整序列并测序,通过肠道病毒在线定型工具(Enterovirus Genotyping tool Version 0.1)进行病毒型别确认。按文献下载CVA2 VP1区基因型/亚型代表株序列,Mega5.2软件构建基因进化树,分析病毒基因特征。结果共检测749份非EVA71和非CVA16的肠道病毒标本,两地皆以A组肠道病毒为主,B组肠道病毒有少量报告,CVA16居病原谱第一位。其中CVA25份,检出率为0.67%(5/749),为HFMD的稀有病原。VP4/VP2和VP1两个基因片段的测序检测、定型结果一致。基因特征分析表明,昆明市3株为基因型A,曲靖市2株为基因型D。结论2021年云南省HFMD监测网络中昆明市和曲靖市CVA2的检出率为0.67%,CVA2在这两个市是HFMD的稀有病原。基因进化分析表明,两个基因型分别在昆明市和曲靖市传播但尚未引起流行。昆明市CVA2基因型A为国内首次报道。加强云南省CVA2的实验室监测特别是分子流行病学监测,对追踪和分析病毒传染来源具有重要意义。

云南省2021年手足口病病例8株埃可病毒18型分离株基因特征

目的分析云南省2021年手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)病例埃可病毒18型(Echovirus 18,E18)分离株基因特征。方法从2021年云南省2个市州HFMD病例粪便标本中分离E18;对VP1区基因进行扩增、测序和拼接,获得全序列;构建E18分离株与GenBank中参考株的系统进化树,分析基因特征。结果从HFMD病例中获得8株E18分离株,其完整VP1区序列的核苷酸、氨基酸同源性分别为96.75%-99.77%、97.21%-100%;与原型株Metcalf相比的核苷酸、氨基酸同源性分别为77.24%-78.63%、91.99%-93.73%。基于VP1区分型,8株分离株均属于基因型5分支2,且在VP1区存在特有的氨基酸位点变异(T80A、I240V、T274S和H281R)。结论本研究E18分离株属于基因型5,可能在环境中循环了一段时间。需进一步加强HFMD病例E18监测和分子生物学特征研究。