基于肥大细胞相关基因的膀胱癌预后模型构建

目的分析肥大细胞相关基因与膀胱癌预后间的关系,筛选预后关键基因,构建膀胱癌预后风险模型。方法利用肥大细胞批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据提取差异基因,并进行KEGG、GO分析与基因集富集分析(GSEA)。通过查阅文献获得膀胱癌单细胞测序内的肥大细胞特征基因。选取共有基因,使用Lasso回归与多因素COX回归筛选关键预后基因,基于风险评分,将患者分为高风险组和低风险组。最后通过单因素与多因素COX回归分析,结合风险评分与多个独立预后因素共同开发列线图以预测膀胱癌患者的生存率。结果构建预后模型的五个基因是WDR45B、EI24、NCOR1、VEGFA和RNF19A,五个基因成功将患者分为高风险组和低风险组。相较于低风险组,高风险组患者生存预后显著变差。同时成功在GSE31864数据验证模型效能。此外,在整合T/N分期、风险评分和年龄而构建的列线图,在膀胱癌患者生存预后方面具有良好的预测性。结论本研究提出一种基于膀胱癌患者肥大细胞五个基因的预后风险模型,可帮助临床医生评估预后情况,为膀胱癌患者提供个性化治疗建议。

基于转录组测序探究TGF-β对成纤维细胞作用的机制研究

目的基于转录组RNA测序筛选转化生长因子β(transforming growth factor-beta,TGF-β)刺激的成纤维细胞与正常成纤维细胞的差异mRNA。方法对正常人成纤维MRC-5细胞和经20 ng/mL TGF-β刺激24 h后的MRC-5细胞进行转录组RNA测序,筛选出两组之间的差异表达基因(DEGs),对DEGs进行生物信息学分析,包括基因功能(GO)、京都基因百科全书(KEGG)富集分析、蛋白质相互作用网络分析(PPI)以及相关基因对肿瘤生存预后的影响。结果筛选出在33692个基因中差异表达的mRNAs共161个,其中上调39个,下调122个;GO分析表明,DEGs主要富集的生物学过程包括核苷酸生物合成、代谢和神经元凋亡、坏死等过程;KEGG通路富集发现这些信号主要涉及核苷酸生物合成过程,核苷磷酸代谢过程,神经元凋亡等过程,其中核苷酸生物合成在6条信号通路中均被富集到;利用TCGA数据库对膀胱癌(BLCA)进行生存分析发现TGFB1I1、HYOU1和CAT基因同时高表达时,与患者较差预后显著相关。结论mRNA在TGF-β刺激后的成纤维细胞和正常成纤维细胞中存在表达差异,筛选出在BLCA病人中表达的TGFB1I1、HYOU1和CAT,有望作为患者的预后标志物。

非小细胞肺癌患者肿瘤组织乳酸脱氢酶A和Sox-2基因的表达及其临床意义

目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者肿瘤组织的乳酸脱氢酶A(LDHA)和正性别决定区Y框蛋白-2(Sox-2)基因的表达情况及其临床意义。方法选择54例NSCLC患者,采用实时定量聚合酶链式反应检测肿瘤组织及癌旁组织中LDHA和Sox-2基因的表达水平,分析肿瘤组织中LDHA和Sox-2基因的表达水平与临床病理特征的关系,以及肿瘤组织LDHA与Sox-2基因表达水平的关系。结果 NSCLC肿瘤组织的LDHA和Sox-2相对表达均高于癌旁组织(P<0.05)。肿瘤细胞分化程度低者肿瘤组织LDHA、Sox-2表达量高于分化程度高者(P<0.05)。肿瘤组织LDHA与Sox-2基因表达水平呈正相关(P<0.05)。结论 NSCLC患者肿瘤组织中LDHA和Sox-2表达均有升高,两者在肿瘤发生发展中具有协同作用。

医学免疫学课程的框架式教学法探讨

框架式教学法是一种将知识建立起整体框架,让初学者迅速了解知识结构,之后对知识点进行填充的教学方法。相比传统教学法,框架式教学更容易让学生对知识有整体把握感。将框架式教学法应用于医学免疫学课程的教学中,指出了如何实施该教学方法,该教学方法的作用以及对教师的要求。

扫描磁铁电源改进型控制研究

基于三角波励磁电流线性度以及三角波调制器原理的考虑．在传统的非线性近似系统基础上进行了改良，在全桥对称电路的基础上，采用一种基于脉宽调制的开环控制方案，使扫描磁铁电源输出的电流峰值为0～8A可调，扫描频率为5～8Hz，可调的线性度良好的连续三角波。

肝细胞癌根治术后早期复发相关microRNAs的筛选

目的筛选与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者根治术后早期复发相关的microRNAs。方法收集10例HCC患者肝脏组织标本,其中早期复发组5例,非早期复发组5例,以及正常肝脏组织标本4例。利用microRNA基因芯片技术检测3组肝脏组织标本中microRNAs的表达谱,筛选出差异表达的microRNAs。结果早期复发组与正常组相比,miR-21-3p、miR-21-5p、miR-222-3p、miR-3182、miR-3651、miR-3654、miR-4451、miR-4633-5p、miR-720的表达均上调,miR-4525的表达下调(P<0.05);非早期复发组与正常组相比,miR-106b-5p、miR-4451、miR-3651、miR-93-5p的表达均上调,miR-451a、miR-3692-5p的表达下调(P<0.05)。结论 microRNAs的表达与HCC患者术后早期复发有关,检测患者肝脏组织中microRNAs的表达水平可能有助于监测HCC术后早期复发。

多发性骨髓瘤中miRNA-16相对表达量与Mayo危险分层的关系

目的研究多发性骨髓瘤(MM)患者miRNA-16(简称miR-16)表达水平的变化及与危险分层、预后判断的关系。方法收集2016年8月至2017年1月于广西医科大学附属第一医院血液内科住院治疗的31例MM患者的骨髓标本各10mL,并取5例健康骨髓捐献者的骨髓标本作为健康对照。利用实时荧光定量聚合酶链反应技术(qRT-PCR)分析miR-16相对表达量变化。同时利用荧光原位杂交技术(iFISH)检测异常基因。统计学分析miR-16相对表达量与以iFISH为基础的Mayo危险分层的关系,和患者自身治疗前后miR-16的相对表达量差异。结果 miR-16在MM患者中相对表达量升高,与Mayo危险分层呈正相关。同时病程进展后的MM患者,miR-16相对表达量上升。结论 miR-16可作为临床判断MM疾病复发或进展恶化的指标,根据其表达量变化指导临床个体化治疗。

根治性手术与肝动脉化疗栓塞治疗孤立性巨大肝细胞癌的效果比较

目的比较根治性切除术与肝动脉化疗栓塞(TACE)对孤立性巨大肝细胞癌患者预后的影响。方法收集肝功能Child-Pugh A级148例孤立性巨大肝细胞癌患者的临床资料,其中行根治性切除44例(根治性切除组),行TACE术104例(TACE组),对两组的临床资料及生存情况进行分析。结果根治性切除组和TACE组中位生存期分别为25.0个月和10.0个月,1、3、5年生存率分别为67.9%、41.7%、34.9%和41.3%、18.9%、14.3%,两组间差异有统计学意义(P=0.001)。影响患者预后的独立危险因素为TACE治疗、血清白蛋白<35 g/L和AFP≥400 ng/m L(P<0.05)。结论肝功能Child-Pugh A级孤立性巨大肝细胞癌患者根治性手术明显优于TACE。

多发性骨髓瘤中miR-15a的表达与Mayo危险分层的关系

目的：分析多发性骨髓瘤（multiple myeloma,MM）的不同患者体内miR-15a表达水平差异及其与Mayo危险分层的临床意义,判断miR-15a是否可对MM患者进行预后判断及病程进展监控,指导临床治疗方案执行.方法：通过qRT-PCR分析就诊于广西医科大学附属第一医院30例MM患者和5例正常骨髓捐献者骨髓单个核细胞内的miR-15a表达水平;同时以荧光原位杂交技术（fluorescence in situ hybridization,FISH）检测的常见异常基因为基础进行Mayo危险分层.统计学分析二者之间的相关性.结果：复发的MM标危患者miR-15a表达水平高于标危的初治患者,具有统计学意义.结论：miR-15a表达量与Mayo危险分层不具有统计学意义（P〉0.05）,但miR-15a的表达量与多发性骨髓瘤病程进展成正相关（P=0.0014〈0.05）,有望成为监测MM复发、 恶化的新生物学标志物.

RAB22A在乳腺癌组织中的表达及临床意义

目的探讨RAB22A在乳腺癌组织中的表达及临床意义。方法采用实时荧光定量PCR检测60例乳腺癌及其相应癌旁组织中RAB22A m RNA的表达,分析其与乳腺癌患者临床病理特征的关系。结果 RAB22A m RNA在乳腺癌组织中的表达高于癌旁组织(4.9±1.1 vs 1.1±0.3,P<0.01)。不同年龄、肿瘤大小以及不同ER、PR、HER-2表达状况乳腺癌患者中RAB22A m RNA的表达差异无统计学意义(P>0.05),但不同淋巴结转移数患者RAB22A m RNA表达差异有统计学意义(P<0.05),高表达RAB22A患者的总生存期较低表达患者差(P<0.05);多因素Cox比例风险回归模型分析结果显示RAB22A和淋巴结转移数是影响预后的独立因素(P<0.05)。结论 RAB22A在乳腺癌组织中表达升高,可能与乳腺癌转移和不良预后有关。

Journal club教学法提升医学本科生科研素养的实践

在生命科学与医学的研究生教育过程中,广泛采用了Journal club教学法,但在国内的医学本科教育中,该教学方法应用较少。提升学生科研素养是医学本科教育改革发展的迫切需求,将Journal club教学法运用于高校的医学本科教学,是现代教学方法改革中提升医学本科生科研素养的一种新的尝试。文章介绍了在医学教育过程中,如何运用Journal club教学法,以学生为本、教师引导为辅,以提高学生自主学习能力和提升学生科研素养。

肺鳞状细胞癌中甲基化调控基因及其临床意义

目的筛选肺鳞状细胞癌(LUSC)中受甲基化调控的基因,并分析其临床意义。方法从癌症和肿瘤基因图谱数据库中,下载338例LUSC组织和38例正常肺组织mRNA测序数据及DNA甲基化数据。采用R语言软件处理mRNA表达数据,筛选出差异表达基因(DEG),再运用受试者工作特征(ROC)曲线评估DEG鉴别LUSC组织和正常肺组织的效能,筛选出候选基因。使用minfi软件包分析TCGA数据库中甲基化数据,筛选出差异甲基化位点。利用MEXPRESS数据可视化工具,分析候选基因表达与其启动子区域DNA甲基化位点之间的相关性,筛选出与甲基化相关的目的基因及其位点。应用实时荧光定量PCR,检测21例LUSC患者癌组织及相应癌旁正常肺组织中目的基因的表达水平。结果筛选出目的基因SOX15及其cg01029592与cg13159929两位点。338例LUSC患者组织中SOX15mRNA相对表达量高于38例正常肺组织中的表达量(log2FC=4.758,P<0.001)。ROC曲线分析结果显示,SOX15高表达对鉴别LUSC组织和正常肺组织具有较高效能(曲线下面积为0.910,P<0.001)。位点cg01029592、cg13159929在LUSC组织中甲基化水平均低于正常肺组织(P<0.05)。在LUSC组织中SOX15的表达与cg01029592及cg13159929位点的甲基化水平呈负相关(均P<0.05)。位点cg01029592、cg12615880高甲基化水平者的总体生存率均高于低甲基化水平者(P<0.05)。实时荧光定量PCR结果显示,LUSC组织的SOX15mRNA的相对表达量高于癌旁正常组织(P<0.05)。结论SOX15或可成为LUSC肿瘤特异性标志物。SOX15启动子区低甲基化可能导致其mRNA高表达,并且与LUSC预后相关。

微小RNA-205在非小细胞肺癌中的表达及其启动子甲基化情况

目的探讨微小RNA-205(miR-205)在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达及其启动子甲基化情况。方法采用实时荧光定量PCR法对27份NSCLC组织及其癌旁正常组织标本的miR-205进行相对定量分析,其中肺腺癌组织19份,肺鳞癌组织8份。先对RNA-205基因启动子区CpG岛进行预测,再经亚硫酸盐测序、PCR产物克隆、鉴定、测序等步骤,分析并比较人肺鳞癌细胞株HTB-182和人肺腺癌细胞株A549的miR-205基因启动子区域甲基化水平。结果肺腺癌组织miR-205的表达量高于癌旁组织(P<0.05),肺鳞癌组织的miR-205表达量高于癌旁组织(P<0.05);肺鳞癌组织miR-205表达量高于肺腺癌组织(P<0.05)。miR-205基因的启动子具有CpG岛,与肺腺癌A549细胞相比,肺鳞癌HTB-182细胞的miR-205基因启动子的甲基化程度较低(P<0.05),且主要差别体现在Site2和Site6上。结论肺鳞癌的miR-205表达水平升高,这可能与其启动子低甲基化有关。

miR-30a对肺腺癌A549细胞转录组水平变化的影响

目的:研究miR-30a过表达对肺腺癌(LUAD)细胞转录组水平变化的影响。方法:利用TCGA数据库,分析miR-30a在LUAD中的表达差异。培养A549细胞并进行细胞转染。细胞划痕实验观察miR-30a对肺癌细胞发生迁移和侵袭能力的影响;qPCR分析miR-30a在A549细胞中的过表达情况;琼脂糖凝胶电泳及安捷伦2100核酸检测仪分析总RNA的完整性。设置空白对照组、阴性对照组及过表达miR-30a组,利用高通量测序技术,分析A549细胞转录组的变化,得到差异表达基因。对差异基因进行Kaplan-Meier生存预后分析。结果:miR-30a在LUAD组织中低表达(P<0.01)。miR-30a可抑制肺癌细胞A549和H460的体外迁移和侵袭能力(P<0.01)。高效转染A549细胞,制备miR-30a过表达样本并构建好高通量测序文库,与空白对照组及阴性对照组相比,过表达miR-30a组的差异表达基因有173个,其中高表达的基因有131个,低表达的基因有42个;过表达miR-30a可以使ACOT11、KDELC2、CT62、F10、MADCAM1、FGF12、BTBD8基因下调2倍以上;过表达miR-30a可以使EGR4、CYP3A7、ARG1、CFAP73、MYLK2、TVP23A基因上调3倍以上;靶基因KDELC2和MADCAM1与患者良好预后相关(P<0.05)。结论:过表达miR-30a影响LUAD细胞的生长,并调控LUAD细胞的转录组水平。

微小RNA-30a及其与肺癌关系的研究进展

目前,肺癌的患病率和死亡率居于所有恶性肿瘤的首位。微小RNA-30a在肺癌中呈低表达,其不仅可影响肺癌细胞的增殖、分化、凋亡、侵袭、迁移、自噬、上皮细胞的间充质转化和组织纤维化,而且还与肺癌的化疗和放疗耐受有关,在肺癌的发生发展中具有重要的调控作用,有可能成为肺癌不良预后的新评价指标及肺癌的治疗新靶点。

肺腺癌miR-195的表达及靶基因筛选

目的研究miR-195在肺腺癌中的表达差异,筛选miR-195靶基因,分析靶基因作用网络及其对患者生存预后的影响。方法利用TCGA数据库,比较miR-195在肺腺癌癌组织与癌旁正常组织间的表达差异;采用实时荧光定量PCR检测miR-195在临床标本中的相对表达水平。设计miR-195的Hybrid PCR引物,扩增出靶基因的mRNA 3′-非翻译区(3′UTR),菌落PCR筛选靶基因的3′UTR片段进行测序。美国国家生物信息中心网站比对测序结果,得到靶基因的基因注释和全长序列,构建靶基因作用网络并进行生存分析。结果miR-195在肺腺癌癌组织中的相对表达水平低于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P<0.01)。Hybrid PCR筛选miR-195候选靶基因显示多个条带。miR-195与靶基因的结合位点在基因3′UTR上有19个。靶基因GCLC、NOB1的低表达与肺腺癌患者的良好预后相关。结论肺腺癌癌组织中miR-195呈低表达。miR-195可能通过直接抑制靶基因GCLC、NOB1的功能,进而影响肺腺癌的发生、发展。

甲状腺癌患者血清TPOAb、TgAb、IL-17、VEGF水平及其临床意义分析

探讨甲状腺癌(TC)患者血清甲状腺过氧化物酶抗体(TPOAb)、甲状腺球蛋白抗体(TgAb)、白细胞介素17(IL-17)及血管内皮因子(VEGF)水平的变化及其临床意义。方法 选取2022年5月至12月我院收治的37例TC患者为C组, 33例甲状腺结节(TN)患者为B组,另选取健康体检者19例为A组。均空腹抽取外周静脉血,检测血清TPOAb、TgAb、IL-17、VEGF水平,进行比较分析。结果 C组的TPOAb、TgAb及IL-17均高于A组(p分别为0.001、0.001、0.09),C组的TPOAb、IL-17均高于B组(p分别为0.003、0.016),VEGF低于B组(p=0.027),B组的TPOAb、TgAb高于A组(p分别为0.005、0.027);四个研究指标中,TPOAb与TgAb正相关(r=0.334,p<0.05),TgAb与VEGF正相关(r=0.249, p<0.05),其余指标间无相关性;经ROC曲线分析,TgAb对鉴别A组与C组有一定提示作用(AUC=0.671);IL-17对鉴别B组与C组有一定提示作用(AUC=0.636);在鉴别TC与非TC(含A组及B组)人群时,TPOAb有一定提示作用(AUC=0.627);在鉴别A组与B组时,四个指标意义均不明显;将四个指标联合,对鉴别A组与C组有较好的临床价值(AUC=0.760)。结论 TPOAb、TgAb、IL-17及VEGF联合检测有助于鉴别健康人群与TC患者。

miR-191在非小细胞肺癌中的表达及其临床意义

目的:探讨miR-191在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达及其临床意义。方法:采用实时荧光相对定量聚合酶链式反应(quantitative realtime polymerase chain reaction,qRT-PCR)技术检测非小细胞肺癌患者的癌组织及癌旁组织中miR-191的表达水平,并分析其与患者临床病理特征及生存期的相关性。结果:与癌旁组织比较,癌组织中miR-191的表达显著上调。组织分化程度低或有淋巴结转移的NSCLC患者癌组织中miR-191表达明显高于组织分化程度高或无淋巴结转移的NSCLC患者(P<0.05),癌组织高表达miR-191的NSCLC患者生存期明显短于癌组织低表达miR-191的NSCLC患者(P<0.05)。结论:miR-191在非小细胞肺癌中表达上调,与组织分化程度、淋巴结转移和患者生存期有关。

非小细胞肺癌miRNA-191启动子区甲基化状态及其临床病理特征的相关分析

目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)微小RNA(miRNA)-191启动子区甲基化状态及其在NSCLC发生、发展中的意义。方法甲基化特异性PCR(MSP)检测105份NSCLC患者术后肿瘤组织及其对应癌旁组织中的miRNA-191启动子甲基化水平,并分析miRNA-191启动子区甲基化状态与对应患者临床病理特征间的关系。结果105份NSCLC肿瘤标本中有48份发生甲基化,甲基化率为45.71%,对应的癌旁组织中有87份发生甲基化,甲基化率为82.86%,二者比较差异有统计学意义(χ2=37.87,P<0.01)。miRNA-191启动子区甲基化组与非甲基化组在TNM分期、肿瘤组织分化程度方面比较,差异有统计学意义(χ2=4.27、6.75,P=0.04、0.01),非甲基化组的TNM分期更晚、组织分化程度更低;而性别、年龄、组织类型方面比较,差异无统计学意义(χ2=0.01、0.89、1.80,P=0.91、0.35、0.25)。生存分析结果显示,与NSCLC患者甲基化组比较,NSCLC患者非甲基化组的总生存期更短(χ2=6.06,P=0.01)。结论NSCLC肿瘤组织miRNA-191的甲基化率明显低于癌旁组织,NSCLC的发生、发展过程可能与miRNA-191启动子区的异常甲基化密切相关。