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EV-D68 VP1蛋白的生物信息学分析和候选疫苗表位肽段预测及筛选 被引量:9
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作者 陈俊伊 唐弘 +3 位作者 庄稀尧 熊雨菡 唐霞 杨春(指导) 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第15期1809-1813,1818,共6页
目的:通过对人肠道病毒D68型(EV-D68)衣壳蛋白VP1理化性质、结构功能和B细胞表位分析,获取候选疫苗肽段用于后期疫苗研制。方法:应用Bioedit软件、Netphos和ExPASy等在线工具分析EV-D68 VP1蛋白氨基酸序列。结果:EV-D68 VP1蛋白是等电点... 目的:通过对人肠道病毒D68型(EV-D68)衣壳蛋白VP1理化性质、结构功能和B细胞表位分析,获取候选疫苗肽段用于后期疫苗研制。方法:应用Bioedit软件、Netphos和ExPASy等在线工具分析EV-D68 VP1蛋白氨基酸序列。结果:EV-D68 VP1蛋白是等电点为8.73、相对分子量34.0 kD的亲水性蛋白质,具有35个可能的磷酸化位点,无信号肽和跨膜区,二级结构中不规则卷区有最高比例,α-螺旋和β-折叠散落在蛋白中;预测VP1蛋白具有多个可能的B细胞表位。结论:本研究分析了EV-D68 VP1的基本理化性质,结构功能和可能的B细胞表位,筛选了B细胞表位肽段,为EV-D68的进一步研究和疫苗的制备奠定基础。 展开更多
关键词 肠道病毒D68 VP1蛋白 B细胞表位 生物信息学
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多发性骨髓瘤患者中脂肪干细胞差异表达基因的生物信息学分析
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作者 张森鹏 何子煜 +6 位作者 全明 叶尔柏 杨泽纯 李淇 周玉其 杜以宽(指导) 杨春(指导) 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第17期2129-2135,共7页
目的:通过生物信息学方法分析与骨髓瘤患者脂肪干细胞(MM-ASC)相关的关键基因和候选通路,为多发性骨髓瘤(MM)的诊断和治疗提供候选靶点。方法:在GEO数据库中获取GSE133346芯片数据,使用R语言筛选MM-ASC的差异基因(DEGs),并用DAVID数据库... 目的:通过生物信息学方法分析与骨髓瘤患者脂肪干细胞(MM-ASC)相关的关键基因和候选通路,为多发性骨髓瘤(MM)的诊断和治疗提供候选靶点。方法:在GEO数据库中获取GSE133346芯片数据,使用R语言筛选MM-ASC的差异基因(DEGs),并用DAVID数据库对DEGs进行生物学功能(GO)分析,利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对基因进行生物通路富集分析,筛选靶基因所涉及的有意义的生物学功能和通路靶基因;采用String和Cytoscape软件进行靶基因蛋白相互作用(PPI)网络分析,筛选关键靶基因;进一步采用R语言筛选miRNAs,使用miRDB预测其靶基因,并使用Cytoscape软件构建miRNAs-mRNA调控关系网络。结果:①MM-ASC共筛选出123个DEGs,其中有36个上调基因和87个下调基因;②信号通路主要表现为胃酸分泌、NF-κB信号通路、胰高血糖素信号通路、钙信号通路、血管平滑肌收缩信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用等;③其Hubgene为CXCL12、CD44和CDH2。Degree排在前10位的关键基因为CDH2、CD44、CXCL12、ACTA2、MYLK、S100A4、PLAU、NT5E、AXIN2、MYH10;④预测得到hsa-miR-30a-3p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-30d-3p等10种重要的miRNAs。结论:MM-ASC中存在差异表达基因谱,且DEGs大多富集于NF-κB、钙信号通路等。CDH2、CD44、CXCL12在MM的发病中可能发挥关键基因作用。miR-30a-3p、miR-34a-5p等miRNAs可能干预MM的发病过程。 展开更多
关键词 多发性骨髓瘤 差异表达基因 脂肪干细胞 GEO数据库 生物信息学分析
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普惠金融发展案例的典型调查——以建设银行“普惠金融e登记”为例
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作者 朱静 杨春(指导) 《商场现代化》 2019年第1期96-97,共2页
本文研究了我国普惠金融的发展现状,并以建设银行"普惠金融e登记"为例研究普惠金融的发展情况。研究发现,我国在普惠金融领域取得了一定成果,大型银行、小型银行以及非银行机构都以自身优势为基础进入普惠金融领域,为低收入... 本文研究了我国普惠金融的发展现状,并以建设银行"普惠金融e登记"为例研究普惠金融的发展情况。研究发现,我国在普惠金融领域取得了一定成果,大型银行、小型银行以及非银行机构都以自身优势为基础进入普惠金融领域,为低收入人群、小微企业等弱势群体提供金融服务;建设银行把金融科技融入小微企业贷款业务中,创新普惠金融产品的做法值得借鉴;政银合作模式有利于创造有利的普惠金融环境。 展开更多
关键词 普惠金融 建设银行 案例调查
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