基于全基因表达谱的中药组分川栀方抗巨噬细胞炎性损伤作用机制研究

目的:分析中药组分川栀方(ZGC)对脂多糖(LPS)激活RAW264.7细胞炎性反应模型的全基因组表达谱影响,从整体水平探讨该方对巨噬细胞炎性损伤的可能作用机制及核心靶标。方法:构建LPS诱导RAW264.7细胞炎症模型,采用基因芯片技术检测ZGC干预对炎性巨噬细胞全基因组表达的影响,对各组间显著差异表达基因进行GO/KEGG富集分析。结果:全基因组表达谱芯片分析结果显示ZGC干预组相对LPS模型组,上调C4bp等5个基因的表达,抑制Mgat3、Psma6、Siglecg等22个基因的表达。GO富集分析结果显示ZGC主要参与白细胞介导免疫调节、前列腺素分泌调节、突触膜、唾液酸结合、免疫受体活性等发挥对抗细胞炎症作用。KEGG信号通路分析结果显示,ZGC主要通过细胞因子受体相互作用、C型凝集素受体(CTLs)信号通路等发挥作用。结论:ZGC可干预炎性巨噬细胞27个基因的异常表达,相关基因可能通过影响细胞因子受体相互作用、CTLs信号通路及TLR4/NF-κB等信号通路而发挥抗炎作用。

栀子调控铁死亡治疗脑缺血再灌注损伤的网络药理学研究

目的采用网络药理学方法探究栀子调控铁死亡治疗脑缺血再灌注损伤(CIRI)的分子机制。方法采用中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)获取栀子有效活性成分及其预测靶点,利用基因卡(GeneCards)数据库收集获取CIRI的基因靶点,通过韦恩图工具获得栀子有效活性成分和CIRI的交集基因。利用Cytoscape 3.9.1软件构建栀子、活性成分以及预测靶点间的相互关系网络图。应用R语言软件对“栀子-CIRI”交集基因进行基因本体(GO)富集和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析。使用铁死亡FerrDb数据库,收集铁死亡的相关基因,对栀子活性成分、CIRI、铁死亡三者间的公共靶点进行综合分析并预测栀子调控铁死亡干预CIRI的有效成分及靶点。结果从栀子中筛选出有对应基因靶点的65个有效活性成分进行相关预测,得到缺氧诱导因子RE-1亚基α(HIF-1α)、肿瘤蛋白P53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)、血红素加氧酶1(HMOX1)、一氧化氮合酶2(NOS2)、核因子κB(NF-κB)亚基-RELA原癌基因(RELA)、白细胞介素-6(IL-6)等24个栀子调控铁死亡干预CIRI的可能作用靶标,介导HIF-1、肿瘤坏死因子(TNF)、MAPK和Toll样受体信号通路等途径调控铁死亡过程,从而对CIRI损伤产生治疗作用。结论栀子可能通过调控铁死亡途径治疗CIRI。

黄芪-水蛭药对调控铁死亡治疗脑缺血再灌注损伤作用机制探析

目的“黄芪-水蛭”药对可以减轻脑缺血再灌注损伤(CIRI),但其作用机制尚未明确。铁死亡是CIRI的新靶点,本文利用网络药理学方法探究“黄芪-水蛭”药对通过调控铁死亡治疗CIRI的作用机制。方法通过检索PubChem、SwissTargetPrediction、Batman-TCM、UniProt、TCMSP等数据库分别获得黄芪、水蛭的有效活性成分和作用靶点;检索GeneCards数据库收集CIRI相关靶点;利用Venny在线工具获得“黄芪-水蛭”药对活性成分和CIRI的共同作用靶点。通过Cytoscape软件得出“黄芪-水蛭”药对活性成分、疾病及预测靶点之间相互关系的网络,将蛋白互作网络图进行可视化处理,并使用CytoHubba插件计算得出核心靶点。应用R语言软件对“黄芪-水蛭”治疗CIRI的靶点进行GO分析和KEGG分析。利用FerrDb数据库,获取调控铁死亡的相关基因,将“黄芪-水蛭”药对活性成分、CIRI、铁死亡三者之间的公共基因进行分析,探究其关系并作出预测。使用AutoDockTools 1.5.7等软件对药对活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果通过数据库检索共收集到“黄芪-水蛭”药对有效活性成分28个、预测得到药对基因靶点680个,CIRI相关靶点1513个,药对-疾病的共同靶点253个,铁死亡相关靶点259个,进行相关预测得到包括PIK3CA、RELA、MAPK1、MAPK8、PTGS2、STAT3、SRC、NOS2等28个“黄芪-水蛭”药对调控铁死亡干预CIRI的可能作用靶点,及包括PI3K-Akt、Ras、TNF、MAPK、HIF-1信号传导途径在内的279条信号通路。分子对接显示,药对关键成分和核心靶点之间有相互作用关系,“黄芪-水蛭”药对可能通过调控铁死亡干预CIRI的发生发展而发挥治疗作用。结论利用网络药理学方法,分析挖掘出“黄芪-水蛭”药对活性成分通过调控铁死亡抗CIRI的潜在靶点及其相关通路,提示“黄芪-水蛭”可能通过氧化应激和抗炎途径调控铁死亡途径发挥其抗CIRI的作用,并为后续进一步的细胞和动物实验提供依据。