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多发性骨髓瘤患者中脂肪干细胞差异表达基因的生物信息学分析
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作者 张森鹏 何子煜 +6 位作者 全明 叶尔柏 杨泽纯 李淇 周玉其 杜以宽(指导) 杨春(指导) 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第17期2129-2135,共7页
目的:通过生物信息学方法分析与骨髓瘤患者脂肪干细胞(MM-ASC)相关的关键基因和候选通路,为多发性骨髓瘤(MM)的诊断和治疗提供候选靶点。方法:在GEO数据库中获取GSE133346芯片数据,使用R语言筛选MM-ASC的差异基因(DEGs),并用DAVID数据库... 目的:通过生物信息学方法分析与骨髓瘤患者脂肪干细胞(MM-ASC)相关的关键基因和候选通路,为多发性骨髓瘤(MM)的诊断和治疗提供候选靶点。方法:在GEO数据库中获取GSE133346芯片数据,使用R语言筛选MM-ASC的差异基因(DEGs),并用DAVID数据库对DEGs进行生物学功能(GO)分析,利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对基因进行生物通路富集分析,筛选靶基因所涉及的有意义的生物学功能和通路靶基因;采用String和Cytoscape软件进行靶基因蛋白相互作用(PPI)网络分析,筛选关键靶基因;进一步采用R语言筛选miRNAs,使用miRDB预测其靶基因,并使用Cytoscape软件构建miRNAs-mRNA调控关系网络。结果:①MM-ASC共筛选出123个DEGs,其中有36个上调基因和87个下调基因;②信号通路主要表现为胃酸分泌、NF-κB信号通路、胰高血糖素信号通路、钙信号通路、血管平滑肌收缩信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用等;③其Hubgene为CXCL12、CD44和CDH2。Degree排在前10位的关键基因为CDH2、CD44、CXCL12、ACTA2、MYLK、S100A4、PLAU、NT5E、AXIN2、MYH10;④预测得到hsa-miR-30a-3p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-30d-3p等10种重要的miRNAs。结论:MM-ASC中存在差异表达基因谱,且DEGs大多富集于NF-κB、钙信号通路等。CDH2、CD44、CXCL12在MM的发病中可能发挥关键基因作用。miR-30a-3p、miR-34a-5p等miRNAs可能干预MM的发病过程。 展开更多
关键词 多发性骨髓瘤 差异表达基因 脂肪干细胞 GEO数据库 生物信息学分析
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脂肪干细胞对模式动物精子生成及其活性改变的研究进展
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作者 李淇 杨泽纯 +3 位作者 叶尔柏 周玉其 杨春 杜以宽 《广东医科大学学报》 2021年第6期761-765,共5页
由于环境污染、饮食不健康以及手机电磁辐射等因素使男性性功能降低,精子活力下降,相关疾病如少精子症、无精子症等发病率逐步增高。目前临床最有效的手段是体外受精-胚胎移植治疗,并辅助药物治疗,但这些治疗均存在不同程度的局限性,如... 由于环境污染、饮食不健康以及手机电磁辐射等因素使男性性功能降低,精子活力下降,相关疾病如少精子症、无精子症等发病率逐步增高。目前临床最有效的手段是体外受精-胚胎移植治疗,并辅助药物治疗,但这些治疗均存在不同程度的局限性,如提高胎儿畸形率、增加受孕者妊娠风险等。随着对干细胞研究的不断深入,其在精子改善领域也取得了较多研究成果。脂肪干细胞因其取材容易、获得率高等生物特性成为干细胞治疗的常用选择,并作为潜在治疗物质用于改善受损精子活力。该文综述了脂肪干细胞对精子生成以及改善受损精子活性的作用机制。 展开更多
关键词 脂肪干细胞 精子 纤维连接蛋白 PI3K/AKT通路 mTOR通路
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小学低年段自然拼读读物教学策略的思考与实践——《外研社丽声拼读故事会》第一级Sam’s Pot一课的教学思考
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作者 徐文卿 杨泽纯 《中文科技期刊数据库(全文版)教育科学》 2021年第8期116-117,119,共3页
自然拼读有助于阅读的开始,而阅读也有助于拼读的巩固、内化,两者是相辅相成、互助的关系。学生运用自然拼读的规则进行阅读和理解简单的适龄英文读物,阅读启蒙英语绘本的过程是语言的解码过程,就是从编码度较低的语言入手,还原单词的... 自然拼读有助于阅读的开始,而阅读也有助于拼读的巩固、内化,两者是相辅相成、互助的关系。学生运用自然拼读的规则进行阅读和理解简单的适龄英文读物,阅读启蒙英语绘本的过程是语言的解码过程,就是从编码度较低的语言入手,还原单词的音、形、义编码过程,分析、比较、理解与运用语言。 展开更多
关键词 自然拼读解码 阅读启蒙 策略
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