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金川牦牛CIDEA基因克隆及其在脂肪组织与脂肪细胞的表达
被引量:
3
1
作者
霍文韬
周婷
+5 位作者
余越
杨清澜
常馨丹
李键
熊显荣
熊燕
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2021年第4期224-231,共8页
旨在克隆牦牛诱导细胞凋亡DNA片段化45样效应因子A(CIDEA)基因序列、分析其生物学特性及检测CIDEA基因在牦牛不同组织及脂肪细胞分化中的表达模式。以金川牦牛皮下脂肪组织的cDNA为模板,采用PCR技术克隆CIDEA基因的CDS序列(Coding seque...
旨在克隆牦牛诱导细胞凋亡DNA片段化45样效应因子A(CIDEA)基因序列、分析其生物学特性及检测CIDEA基因在牦牛不同组织及脂肪细胞分化中的表达模式。以金川牦牛皮下脂肪组织的cDNA为模板,采用PCR技术克隆CIDEA基因的CDS序列(Coding sequence),对CDS区进行相关的生物信息学分析;设计特异引物,检测该基因在金川牦牛肺脏、心脏、肾脏、脂肪等组织的表达情况;同时分离原代前体脂肪细胞,分析CIDEA基因在脂肪细胞分化过程中的表达趋势。结果表明,金川牦牛CIDEA基因的序列长度为696 bp,其中CDS序列为684 bp,编码227个氨基酸;金川牦牛CIDEA基因与普通牛的同源性最高,核苷酸序列同源性为94.14%,氨基酸序列同源性为99.54%,与鸡的同源性最低,核苷酸序列同源性仅为63.38%,氨基酸序列同源性仅为59.05%,利用MEGA 5.0软件构建进化树显示金川牦牛与牛的亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远。蛋白理化性质分析结果表明,CIDEA蛋白是一个不稳定的碱性亲水蛋白,不存在跨膜结构与信号肽;二级结构预测显示CIDEA蛋白中α螺旋占33.92%,无规则卷曲占51.98%。实时荧光定量PCR结果表明,CIDEA基因在金川牦牛脂肪组织中表达量最高,肺脏中表达量最低;在金川牦牛脂肪细胞分化过程中呈现上升的趋势。由此可推测金川牦牛CIDEA基因可能参与牦牛脂肪细胞分化与脂肪沉积。
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关键词
金川牦牛
CIDEA基因
基因克隆
时序表达
脂肪组织
脂肪细胞
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题名
金川牦牛CIDEA基因克隆及其在脂肪组织与脂肪细胞的表达
被引量:
3
1
作者
霍文韬
周婷
余越
杨清澜
常馨丹
李键
熊显荣
熊燕
机构
西南民族大学畜牧兽医学院
青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2021年第4期224-231,共8页
基金
四川省科技计划项目(2019YJ0258)
国家自然科学基金项目(31902154)
西南民族大学大学生创新创业训练计划项目(202010656030)。
文摘
旨在克隆牦牛诱导细胞凋亡DNA片段化45样效应因子A(CIDEA)基因序列、分析其生物学特性及检测CIDEA基因在牦牛不同组织及脂肪细胞分化中的表达模式。以金川牦牛皮下脂肪组织的cDNA为模板,采用PCR技术克隆CIDEA基因的CDS序列(Coding sequence),对CDS区进行相关的生物信息学分析;设计特异引物,检测该基因在金川牦牛肺脏、心脏、肾脏、脂肪等组织的表达情况;同时分离原代前体脂肪细胞,分析CIDEA基因在脂肪细胞分化过程中的表达趋势。结果表明,金川牦牛CIDEA基因的序列长度为696 bp,其中CDS序列为684 bp,编码227个氨基酸;金川牦牛CIDEA基因与普通牛的同源性最高,核苷酸序列同源性为94.14%,氨基酸序列同源性为99.54%,与鸡的同源性最低,核苷酸序列同源性仅为63.38%,氨基酸序列同源性仅为59.05%,利用MEGA 5.0软件构建进化树显示金川牦牛与牛的亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远。蛋白理化性质分析结果表明,CIDEA蛋白是一个不稳定的碱性亲水蛋白,不存在跨膜结构与信号肽;二级结构预测显示CIDEA蛋白中α螺旋占33.92%,无规则卷曲占51.98%。实时荧光定量PCR结果表明,CIDEA基因在金川牦牛脂肪组织中表达量最高,肺脏中表达量最低;在金川牦牛脂肪细胞分化过程中呈现上升的趋势。由此可推测金川牦牛CIDEA基因可能参与牦牛脂肪细胞分化与脂肪沉积。
关键词
金川牦牛
CIDEA基因
基因克隆
时序表达
脂肪组织
脂肪细胞
Keywords
Jinchuan yak
CIDEA
Gene cloning
Temporal-expression
Adipose tissue
Adipocyte
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
S823 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
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被引量
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1
金川牦牛CIDEA基因克隆及其在脂肪组织与脂肪细胞的表达
霍文韬
周婷
余越
杨清澜
常馨丹
李键
熊显荣
熊燕
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2021
3
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职称材料
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参考文献
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