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基于网络药理学和分子对接探究防己茯苓汤治疗缺血再灌注急性肾损伤的作用机制
被引量:
17
1
作者
黄俊鑫
王碧霞
+7 位作者
邹汉斌
吴秋欣
尹欣
黄淑颖
谢俊彬
杨清琪
高志岩
张征宇
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期175-182,共8页
目的:基于网络药理学和实验验证探究防己茯苓汤治疗缺血再灌注急性肾损伤(AKI)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库和文献挖掘收集防己茯苓汤活性成分,利用SwissTargetPrediction预测活性成分作用靶点;借...
目的:基于网络药理学和实验验证探究防己茯苓汤治疗缺血再灌注急性肾损伤(AKI)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库和文献挖掘收集防己茯苓汤活性成分,利用SwissTargetPrediction预测活性成分作用靶点;借助GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、疾病相关的基因与突变位点数据库(DisGeNET)、治疗靶标数据库(TTD)收集AKI靶点;利用STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;采用Metascape平台对核心靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析;利用Cytoscape软件构建药物-活性成分-作用靶点-疾病网络图和活性成分-作用靶点-信号通路网络图;使用AutoDock进行分子对接;最后采用动物实验验证分析结果。结果:筛选出防己茯苓汤活性成分137种及药物靶点858个,AKI疾病靶点1294个,防己茯苓汤治疗AKI作用靶点267个,其中磷脂酰肌醇3-激酶调节亚基1(PIK3R1)、磷脂酰肌醇3-激酶催化亚单位α(PIK3CA)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)、蛋白激酶B1(Akt1)、促分裂原活化的蛋白激酶3(MAPK3)为防己茯苓汤治疗AKI的关键靶点,GO富集分析得到1609个结果,主要涉及细胞对脂质的反应、膜筏、蛋白激酶活性等,KEGG通路分析则与PI3K/Akt信号通路、趋化因子信号通路、Toll样受体(TLR)信号通路等140条通路有关,分子对接则发现核心活性成分和关键靶点均有良好的结合能力,苏木精-伊红(HE)染色结果表明防己茯苓汤能明显改善AKI的病理学状态,血清学结果则显示血清肌酐(SCr)、尿素氮(BUN)水平明显下降。结论:该研究初步探讨了防己茯苓汤治疗AKI的作用机制,发现防己茯苓汤治疗AKI具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,为后续进一步深入研究具体作用机制奠定基础。
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关键词
防己茯苓汤
急性肾损伤
网络药理学
分子对接
原文传递
题名
基于网络药理学和分子对接探究防己茯苓汤治疗缺血再灌注急性肾损伤的作用机制
被引量:
17
1
作者
黄俊鑫
王碧霞
邹汉斌
吴秋欣
尹欣
黄淑颖
谢俊彬
杨清琪
高志岩
张征宇
机构
广州医科大学第二临床学院
广州医科大学金域检验学院
广州医科大学儿科学院
广州医科大学第三临床学院
广州医科大学基础医学院
出处
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期175-182,共8页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(31401240)
广东省大学生创新创业训练计划项目(S202010570010)。
文摘
目的:基于网络药理学和实验验证探究防己茯苓汤治疗缺血再灌注急性肾损伤(AKI)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库和文献挖掘收集防己茯苓汤活性成分,利用SwissTargetPrediction预测活性成分作用靶点;借助GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、疾病相关的基因与突变位点数据库(DisGeNET)、治疗靶标数据库(TTD)收集AKI靶点;利用STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;采用Metascape平台对核心靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析;利用Cytoscape软件构建药物-活性成分-作用靶点-疾病网络图和活性成分-作用靶点-信号通路网络图;使用AutoDock进行分子对接;最后采用动物实验验证分析结果。结果:筛选出防己茯苓汤活性成分137种及药物靶点858个,AKI疾病靶点1294个,防己茯苓汤治疗AKI作用靶点267个,其中磷脂酰肌醇3-激酶调节亚基1(PIK3R1)、磷脂酰肌醇3-激酶催化亚单位α(PIK3CA)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)、蛋白激酶B1(Akt1)、促分裂原活化的蛋白激酶3(MAPK3)为防己茯苓汤治疗AKI的关键靶点,GO富集分析得到1609个结果,主要涉及细胞对脂质的反应、膜筏、蛋白激酶活性等,KEGG通路分析则与PI3K/Akt信号通路、趋化因子信号通路、Toll样受体(TLR)信号通路等140条通路有关,分子对接则发现核心活性成分和关键靶点均有良好的结合能力,苏木精-伊红(HE)染色结果表明防己茯苓汤能明显改善AKI的病理学状态,血清学结果则显示血清肌酐(SCr)、尿素氮(BUN)水平明显下降。结论:该研究初步探讨了防己茯苓汤治疗AKI的作用机制,发现防己茯苓汤治疗AKI具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,为后续进一步深入研究具体作用机制奠定基础。
关键词
防己茯苓汤
急性肾损伤
网络药理学
分子对接
Keywords
Fangji Fulingtang
acute kidney injury
network pharmacology
molecular docking
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
R289 [医药卫生—方剂学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接探究防己茯苓汤治疗缺血再灌注急性肾损伤的作用机制
黄俊鑫
王碧霞
邹汉斌
吴秋欣
尹欣
黄淑颖
谢俊彬
杨清琪
高志岩
张征宇
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
17
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