中国生物样本库的现状与建设思考

生物样本对于生命科学研究具有重大的意义及价值。生物样本库是将生物样本有效收集、整理、储存及分发的实体。生物样本的数量与质量对生命科学及医药开发至关重要,目前独立生物样本库已经无法独自满足大型生物医药项目开展的需求。在我国建设区域性生物样本库,将能有效促进我国生物医药科技的进步与发展。

柱状田头菇和杨柳田头菇B交配型位点特征分析及其应用

柱状田头菇(茶树菇)Cyclocybe aegerita在我国广泛种植,其菌株资源分为多个类群且遗传背景多样。多种命名和复杂的交配特征给柱状田头菇及近缘种的育种研究带来障碍。以两个物种柱状田头菇和杨柳田头菇C.salicacola菌株群体为研究材料,通过基因组测序及序列分析,设计特异引物扩增获取菌株群体的交配区域片段,用于菌株鉴定及系统构建。克隆获得了两个柱状田头菇菌株的B交配位点,其中约8 kb的片段序列非常保守,包括信息素受体rcb1、rcb2和部分非编码区。基于该区域含有变异区的片段设计特异引物,经对35个菌株扩增及克隆测序后,每个实验菌株中均获得1-2类型约3.2 kb片段(cbmr)。使用该片段与线粒体小亚基构建的聚类树契合度较高,但前者在类群的划分上更为精细。此外,该片段的变异区也为类群和交配型鉴定提供了靶位点。依据B交配型部分位点设计的引物在所有的实验菌株中均获得相应的片段,可以作为分子标记用于柱状田头菇和杨柳田头菇菌株及B交配型分子鉴定。

茶树菇线粒体中间肽酶基因克隆分析及其在A交配型鉴定中的应用

以茶树菇为研究对象,依据基因组序列,通过长程PCR扩增获得YSG和AC0007菌株线粒体中间肽酶基因(mitochondrial intermediate peptidase encoding gene,mip)。结果表明:该基因与A交配位点连锁,可以其作为A交配位点克隆的靶位点。序列分析发现,该位点的C段编码区高度保守,设计的特异性引物可以在群体中获得mip基因的保守区,另外其N端编码区的变异区域可以为A交配位点鉴定提供特异的靶标,为食用菌遗传及育种研究提供重要的基础。

茶树菇复合群系统类群及交配分析

茶树菇复合群是一类具有重要经济价值的菌类,其菌株资源多样,命名混乱。为给育种工作提供参考依据,利用线粒体小亚基V4-6-9区序列和交配,对4个代表菌株进行分子和交配特征分析。结果表明:(1)线粒体小亚基序列作为类群区分的有效标记,有效区分杨柳田头菇类群、茶树菇/茶薪菇类群和杨树菇类群;(2)交配特征显示杨柳田头菇为独立生物学种,而其他类群属同一生物学种,建议使用茶树菇这一名称。研究结果可为茶树菇资源鉴定及育种研究提供参考。